Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
KEAFMBMG_10.01.00.0
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KEAFMBMG_1470.01.00.0
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KEAFMBMG_1850.01.00.0
KEAFMBMG_1861.00.01.0
KEAFMBMG_1870.01.00.0
KEAFMBMG_1880.01.00.0
KEAFMBMG_1891.00.01.0
KEAFMBMG_1900.01.00.0
KEAFMBMG_1910.01.00.0
KEAFMBMG_1921.00.01.0
KEAFMBMG_1930.01.00.0
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KEAFMBMG_1980.01.00.0
KEAFMBMG_1990.01.00.0
KEAFMBMG_2001.00.01.0
KEAFMBMG_2010.01.00.0
KEAFMBMG_2020.01.00.0
KEAFMBMG_2030.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
KEAFMBMG_24609738229FalseSiphoviridaeVOG1637, VOG4659, VOG4633, VOG4545, VOG0660, VOG0209, VOG4586, VOG0207, VOG4534, VOG0205, VOG0204, VOG4553, VOG4573, VOG4556, VOG0202, VOG1886, VOG5068, VOG3349, VOG4581, VOG4841, VOG4571, VOG0198, VOG6005, VOG8222, VOG0327, VOG8776, VOG9752, VOG7924, VOG4606, VOG6545, VOG5562, VOG5998, VOG4548, VOG0322, VOG9708, VOG4552
KEAFMBMG_160293439564FalseMyoviridaeVOG4705, VOG9945, VOG5763, VOG4845, VOG4691, VOG4550, VOG0573, VOG1348, VOG1433, VOG1956, VOG6163, VOG4699, VOG1352, VOG1883, VOG1881, VOG1353, VOG4710, VOG1942, VOG6132, VOG1915, VOG4564, VOG1912, VOG7407, VOG0796, VOG10904, VOG4972, VOG0198, VOG0327, VOG7221, VOG5880, VOG9667, VOG9667, VOG0226, VOG5046, VOG0283, VOG0685

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements