Probiotic potential risk score
| ARGs | VFs | PGs | PPRS |
|---|---|---|---|
| 2 | 0 | 0 | 2.00 |
PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).
Antibiotic resistance genes
Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)
| Query ID | Begin | End | ARO name | ARO accession | CARD name | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| IKKILMBM_27 | 534 | 2450 | tet(O) | ARO:3000190 | tet(O) | 98.28 | 100.00 | M18896.2 |
RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)
ResFinder
| Query ID | Begin | End | Resistance gene | Phenotype | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| IKKILMBM_27 | 534 | 2452 | tet(O) | Doxycycline, Tetracycline, Minocycline | 100.00 | 99.95 | Y07780 |
ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)
AMRFinderPlus
| Query ID | Begin | End | Gene symbol | Sequence name | Method | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| IKKILMBM_27 | 534 | 2450 | tet(O) | tetracycline resistance ribosomal protection protein Tet(O) | EXACTX | 100.00 | 100.00 | WP_000691759.1 |
| IKKILMBM_180 | 15429 | 15629 | vanU-G | glycopeptide resistance transcriptional regulator VanU-G | PARTIALX | 80.60 | 89.33 | WP_021418929.1 |
AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)
Virulence factors
Virulence Factor Database (VFDB)
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | VF name | VF category | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | |||||||||
BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)
VirulenceFinder
| Query ID | Begin | End | Database | Virulence factor | Protein function | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)
Pathogenic genes
PHI-base
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | Function | Identity | Coverage | Gene ID |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)
Plasmid
PlasmidFinder
| Query ID | Begin | End | Plasmid | Query / Template | Identity | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||
PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)
PlasmidHunter
| Query ID | Prediction | Chromosome | Plasmid |
|---|---|---|---|
| IKKILMBM_1 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_2 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_3 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_4 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_5 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_6 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_7 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_8 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_9 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_10 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_11 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_13 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_14 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_15 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_16 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_17 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_18 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_19 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_20 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_21 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_22 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_23 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_24 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_25 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_26 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_27 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_28 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_29 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_30 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_31 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_32 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_33 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_34 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_35 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_36 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_37 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_38 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_39 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_40 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_41 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_42 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_43 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_44 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_45 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_47 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_48 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_49 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_51 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_52 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_53 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_54 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_55 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_56 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_57 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_58 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_59 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_60 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_61 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_62 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_64 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_65 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_66 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_67 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_68 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_69 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_70 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_72 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_73 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_74 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_76 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_87 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_98 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_108 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_109 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_119 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_128 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_137 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_142 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_148 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_152 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_153 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_154 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_155 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_156 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_157 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_158 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_159 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_160 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_161 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_162 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_163 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_164 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_165 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_166 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_167 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_168 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_169 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_170 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_171 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_172 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_173 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_174 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_175 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_176 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_177 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_178 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_179 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_180 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_181 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_182 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_183 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_184 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_185 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_186 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_187 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_188 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_189 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_190 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_191 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_192 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_193 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_194 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_195 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_196 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_197 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_198 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_199 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_200 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_201 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_202 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_203 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_204 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_205 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_206 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_207 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_208 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_209 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_210 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_211 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_212 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_213 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_214 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_215 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_216 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_217 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_218 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_219 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_220 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_221 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_222 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_223 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_224 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_225 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_226 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_227 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_228 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_229 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_230 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_231 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_232 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| IKKILMBM_233 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| IKKILMBM_234 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)
Prophage
Phigaro
| Query ID | Begin | End | Transposable | Taxonomy | pVOGs |
|---|---|---|---|---|---|
| IKKILMBM_212 | 12066 | 25592 | False | Siphoviridae | VOG9113, |
Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)