Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
2002.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
MOPEJPLJ_825936161280tet(O)ARO:3000190tet(O)97.50100.00M18896.2

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
MOPEJPLJ_825936161280tet(O)Doxycycline, Tetracycline, Minocycline99.27100.00Y07780

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
MOPEJPLJ_825936461280tet(O)tetracycline resistance ribosomal protection protein Tet(O)BLASTX99.06100.00WP_014636291.1
MOPEJPLJ_14642904490vanU-Gglycopeptide resistance transcriptional regulator VanU-GPARTIALX80.6089.33WP_021418929.1

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
MOPEJPLJ_11.00.01.0
MOPEJPLJ_20.01.00.0
MOPEJPLJ_30.01.00.0
MOPEJPLJ_41.00.01.0
MOPEJPLJ_51.00.01.0
MOPEJPLJ_61.00.01.0
MOPEJPLJ_70.01.00.0
MOPEJPLJ_80.01.00.0
MOPEJPLJ_91.00.01.0
MOPEJPLJ_101.00.01.0
MOPEJPLJ_110.01.00.0
MOPEJPLJ_120.01.00.0
MOPEJPLJ_131.00.01.0
MOPEJPLJ_141.00.01.0
MOPEJPLJ_151.00.01.0
MOPEJPLJ_161.00.01.0
MOPEJPLJ_171.00.01.0
MOPEJPLJ_180.01.00.0
MOPEJPLJ_200.01.00.0
MOPEJPLJ_210.01.00.0
MOPEJPLJ_221.00.01.0
MOPEJPLJ_230.01.00.0
MOPEJPLJ_241.00.01.0
MOPEJPLJ_251.00.01.0
MOPEJPLJ_271.00.01.0
MOPEJPLJ_310.01.00.0
MOPEJPLJ_420.01.00.0
MOPEJPLJ_530.01.00.0
MOPEJPLJ_600.01.00.0
MOPEJPLJ_670.01.00.0
MOPEJPLJ_740.01.00.0
MOPEJPLJ_780.01.00.0
MOPEJPLJ_820.01.00.0
MOPEJPLJ_830.01.00.0
MOPEJPLJ_880.01.00.0
MOPEJPLJ_900.01.00.0
MOPEJPLJ_920.01.00.0
MOPEJPLJ_970.01.00.0
MOPEJPLJ_990.01.00.0
MOPEJPLJ_1030.01.00.0
MOPEJPLJ_1040.01.00.0
MOPEJPLJ_1050.01.00.0
MOPEJPLJ_1060.01.00.0
MOPEJPLJ_1070.01.00.0
MOPEJPLJ_1080.01.00.0
MOPEJPLJ_1090.01.00.0
MOPEJPLJ_1100.01.00.0
MOPEJPLJ_1110.01.00.0
MOPEJPLJ_1120.01.00.0
MOPEJPLJ_1130.01.00.0
MOPEJPLJ_1140.01.00.0
MOPEJPLJ_1150.01.00.0
MOPEJPLJ_1160.01.00.0
MOPEJPLJ_1170.01.00.0
MOPEJPLJ_1180.01.00.0
MOPEJPLJ_1190.01.00.0
MOPEJPLJ_1200.01.00.0
MOPEJPLJ_1210.01.00.0
MOPEJPLJ_1220.01.00.0
MOPEJPLJ_1230.01.00.0
MOPEJPLJ_1240.01.00.0
MOPEJPLJ_1250.01.00.0
MOPEJPLJ_1260.01.00.0
MOPEJPLJ_1271.00.01.0
MOPEJPLJ_1280.01.00.0
MOPEJPLJ_1290.01.00.0
MOPEJPLJ_1300.01.00.0
MOPEJPLJ_1310.01.00.0
MOPEJPLJ_1320.01.00.0
MOPEJPLJ_1330.01.00.0
MOPEJPLJ_1340.01.00.0
MOPEJPLJ_1350.01.00.0
MOPEJPLJ_1360.01.00.0
MOPEJPLJ_1370.01.00.0
MOPEJPLJ_1380.01.00.0
MOPEJPLJ_1390.01.00.0
MOPEJPLJ_1400.01.00.0
MOPEJPLJ_1410.01.00.0
MOPEJPLJ_1420.01.00.0
MOPEJPLJ_1431.00.01.0
MOPEJPLJ_1441.00.01.0
MOPEJPLJ_1450.01.00.0
MOPEJPLJ_1460.01.00.0
MOPEJPLJ_1470.01.00.0
MOPEJPLJ_1480.01.00.0
MOPEJPLJ_1490.01.00.0
MOPEJPLJ_1500.01.00.0
MOPEJPLJ_1511.00.01.0
MOPEJPLJ_1520.01.00.0
MOPEJPLJ_1530.01.00.0
MOPEJPLJ_1541.00.01.0
MOPEJPLJ_1550.01.00.0
MOPEJPLJ_1560.01.00.0
MOPEJPLJ_1570.01.00.0
MOPEJPLJ_1581.00.01.0
MOPEJPLJ_1590.01.00.0
MOPEJPLJ_1601.00.01.0
MOPEJPLJ_1611.00.01.0
MOPEJPLJ_1621.00.01.0
MOPEJPLJ_1630.01.00.0
MOPEJPLJ_1640.01.00.0
MOPEJPLJ_1651.00.01.0
MOPEJPLJ_1660.01.00.0
MOPEJPLJ_1671.00.01.0
MOPEJPLJ_1680.01.00.0
MOPEJPLJ_1690.01.00.0
MOPEJPLJ_1701.00.01.0
MOPEJPLJ_1710.01.00.0
MOPEJPLJ_1720.01.00.0
MOPEJPLJ_1730.01.00.0
MOPEJPLJ_1741.00.01.0
MOPEJPLJ_1751.00.01.0
MOPEJPLJ_1760.01.00.0
MOPEJPLJ_1771.00.01.0
MOPEJPLJ_1781.00.01.0
MOPEJPLJ_1791.00.01.0
MOPEJPLJ_1801.00.01.0
MOPEJPLJ_1811.00.01.0
MOPEJPLJ_1821.00.01.0
MOPEJPLJ_1830.01.00.0
MOPEJPLJ_1840.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
No hit found

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements