Probiotic potential risk score
| ARGs | VFs | PGs | PPRS |
|---|---|---|---|
| 6 | 0 | 0 | 6.00 |
PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).
Antibiotic resistance genes
Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)
| Query ID | Begin | End | ARO name | ARO accession | CARD name | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ACJIHHAJ_106 | 31042 | 31776 | ErmG | ARO:3000522 | ErmG | 99.18 | 100.00 | L42817.1 |
| ACJIHHAJ_88 | 11093 | 13018 | tet(Q) | ARO:3000191 | tet(Q) | 96.10 | 97.56 | Z21523.1 |
| ACJIHHAJ_27 | 72 | 809 | ErmB | ARO:3000375 | ErmB | 98.37 | 98.79 | AF242872.1 |
RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)
ResFinder
| Query ID | Begin | End | Resistance gene | Phenotype | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ACJIHHAJ_88 | 539 | 1405 | ant(6)-Ia | Streptomycin | 100.00 | 100.00 | KF864551 |
| ACJIHHAJ_27 | 72 | 809 | erm(B) | Erythromycin, Lincomycin, Clindamycin, Quinupristin, Pristinamycin IA, Virginiamycin S | 99.86 | 100.00 | U18931 |
| ACJIHHAJ_106 | 31042 | 31776 | erm(G) | Erythromycin, Lincomycin, Clindamycin, Quinupristin, Pristinamycin IA, Virginiamycin S | 99.32 | 100.00 | M15332 |
| ACJIHHAJ_88 | 11093 | 13018 | tet(Q) | Doxycycline, Tetracycline, Minocycline | 99.27 | 100.00 | L33696 |
| ACJIHHAJ_106 | 28807 | 30270 | msr(D) | Erythromycin, Azithromycin, Telithromycin, Quinupristin, Pristinamycin IA, Virginiamycin S | 97.54 | 100.00 | AF274302 |
| ACJIHHAJ_106 | 27467 | 28681 | mef(A) | Erythromycin, Azithromycin | 94.24 | 99.75 | AF227520 |
ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)
AMRFinderPlus
| Query ID | Begin | End | Gene symbol | Sequence name | Method | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ACJIHHAJ_88 | 539 | 1402 | aadE | aminoglycoside 6-adenylyltransferase AadE | EXACTX | 100.00 | 100.00 | WP_001255868.1 |
| ACJIHHAJ_27 | 72 | 806 | erm(B) | 23S rRNA (adenine(2058)-N(6))-methyltransferase Erm(B) | BLASTX | 99.59 | 100.00 | WP_002292226.1 |
| ACJIHHAJ_106 | 31042 | 31773 | erm(G) | 23S rRNA (adenine(2058)-N(6))-methyltransferase Erm(G) | BLASTX | 99.59 | 100.00 | WP_063844791.1 |
| ACJIHHAJ_88 | 11096 | 13018 | tet(Q) | tetracycline resistance ribosomal protection protein Tet(Q) | BLASTX | 98.60 | 100.00 | WP_063856407.1 |
| ACJIHHAJ_106 | 28807 | 30267 | msr(D) | ABC-F type ribosomal protection protein Msr(D) | BLASTX | 97.13 | 100.00 | WP_000420313.1 |
| ACJIHHAJ_106 | 27467 | 28690 | mef(A) | macrolide efflux MFS transporter Mef(A) | BLASTX | 96.57 | 100.00 | WP_012102963.1 |
AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)
Virulence factors
Virulence Factor Database (VFDB)
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | VF name | VF category | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | |||||||||
BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)
VirulenceFinder
| Query ID | Begin | End | Database | Virulence factor | Protein function | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)
Pathogenic genes
PHI-base
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | Function | Identity | Coverage | Gene ID |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)
Plasmid
PlasmidFinder
| Query ID | Begin | End | Plasmid | Query / Template | Identity | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||
PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)
PlasmidHunter
| Query ID | Prediction | Chromosome | Plasmid |
|---|---|---|---|
| ACJIHHAJ_1 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_2 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_3 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_4 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_5 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_6 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_7 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_8 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_10 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_11 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_12 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_13 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_14 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_15 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_16 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_17 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_18 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_19 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_20 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_21 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_22 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_23 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_24 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_25 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_26 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_27 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_28 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_29 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_30 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_31 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_32 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_33 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_34 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_35 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_36 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_37 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_38 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_39 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_40 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_41 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_42 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_43 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_44 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_45 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_46 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_55 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_66 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_77 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_88 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_99 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_104 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_105 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_106 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_107 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_108 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_109 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_110 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_111 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_112 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_113 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_114 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_115 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_116 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_117 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_118 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_119 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_120 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_121 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_122 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_123 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_124 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_125 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_126 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_127 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_128 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_129 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_130 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_131 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_132 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_133 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_134 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_135 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_136 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_137 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_138 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_139 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_140 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_141 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_142 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_143 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_144 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_145 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_146 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_147 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_148 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_149 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_150 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_151 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_152 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_153 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_154 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_155 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_156 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_157 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_158 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_159 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_160 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_161 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_162 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_163 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_164 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_165 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_166 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_167 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_168 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_169 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_170 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_171 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_172 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_173 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_174 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_175 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_176 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_177 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_178 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_179 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_180 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_181 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_182 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_183 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_184 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_185 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_186 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_187 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_188 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_189 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_190 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_191 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ACJIHHAJ_192 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ACJIHHAJ_193 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)
Prophage
Phigaro
| Query ID | Begin | End | Transposable | Taxonomy | pVOGs |
|---|---|---|---|---|---|
| ACJIHHAJ_118 | 8952 | 21458 | False | Siphoviridae | VOG8171, |
| ACJIHHAJ_126 | 39786 | 49206 | False | Siphoviridae | VOG0749, |
| ACJIHHAJ_193 | 4391 | 16853 | False | Siphoviridae | VOG4566, |
Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)