Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
JNBILIEM_10.01.00.0
JNBILIEM_20.01.00.0
JNBILIEM_30.01.00.0
JNBILIEM_41.00.01.0
JNBILIEM_50.01.00.0
JNBILIEM_61.00.01.0
JNBILIEM_70.01.00.0
JNBILIEM_80.01.00.0
JNBILIEM_91.00.01.0
JNBILIEM_100.01.00.0
JNBILIEM_110.01.00.0
JNBILIEM_121.00.01.0
JNBILIEM_130.01.00.0
JNBILIEM_140.01.00.0
JNBILIEM_150.01.00.0
JNBILIEM_161.00.01.0
JNBILIEM_170.01.00.0
JNBILIEM_181.00.01.0
JNBILIEM_190.01.00.0
JNBILIEM_200.01.00.0
JNBILIEM_211.00.01.0
JNBILIEM_221.00.01.0
JNBILIEM_231.00.01.0
JNBILIEM_240.01.00.0
JNBILIEM_251.00.01.0
JNBILIEM_260.01.00.0
JNBILIEM_270.01.00.0
JNBILIEM_281.00.01.0
JNBILIEM_290.01.00.0
JNBILIEM_301.00.01.0
JNBILIEM_310.01.00.0
JNBILIEM_320.01.00.0
JNBILIEM_330.01.00.0
JNBILIEM_340.01.00.0
JNBILIEM_350.01.00.0
JNBILIEM_360.01.00.0
JNBILIEM_370.01.00.0
JNBILIEM_380.01.00.0
JNBILIEM_390.01.00.0
JNBILIEM_400.01.00.0
JNBILIEM_410.01.00.0
JNBILIEM_420.01.00.0
JNBILIEM_431.00.01.0
JNBILIEM_440.01.00.0
JNBILIEM_450.01.00.0
JNBILIEM_460.01.00.0
JNBILIEM_470.01.00.0
JNBILIEM_480.01.00.0
JNBILIEM_490.01.00.0
JNBILIEM_500.01.00.0
JNBILIEM_510.01.00.0
JNBILIEM_520.01.00.0
JNBILIEM_530.01.00.0
JNBILIEM_540.01.00.0
JNBILIEM_550.01.00.0
JNBILIEM_560.01.00.0
JNBILIEM_570.01.00.0
JNBILIEM_580.01.00.0
JNBILIEM_590.01.00.0
JNBILIEM_600.01.00.0
JNBILIEM_610.01.00.0
JNBILIEM_620.01.00.0
JNBILIEM_630.01.00.0
JNBILIEM_640.01.00.0
JNBILIEM_650.01.00.0
JNBILIEM_660.01.00.0
JNBILIEM_670.01.00.0
JNBILIEM_680.01.00.0
JNBILIEM_690.01.00.0
JNBILIEM_700.01.00.0
JNBILIEM_710.01.00.0
JNBILIEM_720.01.00.0
JNBILIEM_730.01.00.0
JNBILIEM_740.01.00.0
JNBILIEM_750.01.00.0
JNBILIEM_760.01.00.0
JNBILIEM_770.01.00.0
JNBILIEM_780.01.00.0
JNBILIEM_790.01.00.0
JNBILIEM_800.01.00.0
JNBILIEM_810.01.00.0
JNBILIEM_820.01.00.0
JNBILIEM_830.01.00.0
JNBILIEM_840.01.00.0
JNBILIEM_850.01.00.0
JNBILIEM_860.01.00.0
JNBILIEM_870.01.00.0
JNBILIEM_881.00.01.0
JNBILIEM_890.01.00.0
JNBILIEM_900.01.00.0
JNBILIEM_910.01.00.0
JNBILIEM_920.01.00.0
JNBILIEM_930.01.00.0
JNBILIEM_940.01.00.0
JNBILIEM_951.00.01.0
JNBILIEM_960.01.00.0
JNBILIEM_970.01.00.0
JNBILIEM_980.01.00.0
JNBILIEM_990.01.00.0
JNBILIEM_1000.01.00.0
JNBILIEM_1010.01.00.0
JNBILIEM_1020.01.00.0
JNBILIEM_1030.01.00.0
JNBILIEM_1040.01.00.0
JNBILIEM_1050.01.00.0
JNBILIEM_1060.01.00.0
JNBILIEM_1071.00.01.0
JNBILIEM_1080.01.00.0
JNBILIEM_1091.00.01.0
JNBILIEM_1100.01.00.0
JNBILIEM_1110.01.00.0
JNBILIEM_1120.01.00.0
JNBILIEM_1130.01.00.0
JNBILIEM_1141.00.01.0
JNBILIEM_1150.01.00.0
JNBILIEM_1160.01.00.0
JNBILIEM_1171.00.01.0
JNBILIEM_1180.01.00.0
JNBILIEM_1190.01.00.0
JNBILIEM_1200.01.00.0
JNBILIEM_1211.00.01.0
JNBILIEM_1220.01.00.0
JNBILIEM_1230.01.00.0
JNBILIEM_1240.01.00.0
JNBILIEM_1250.01.00.0
JNBILIEM_1260.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
No hit found

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements