Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
LAIFGBKF_10.01.00.0
LAIFGBKF_20.01.00.0
LAIFGBKF_31.00.01.0
LAIFGBKF_40.01.00.0
LAIFGBKF_50.01.00.0
LAIFGBKF_60.01.00.0
LAIFGBKF_70.01.00.0
LAIFGBKF_80.01.00.0
LAIFGBKF_90.01.00.0
LAIFGBKF_100.01.00.0
LAIFGBKF_110.01.00.0
LAIFGBKF_120.01.00.0
LAIFGBKF_130.01.00.0
LAIFGBKF_140.01.00.0
LAIFGBKF_150.01.00.0
LAIFGBKF_160.01.00.0
LAIFGBKF_170.01.00.0
LAIFGBKF_180.01.00.0
LAIFGBKF_190.01.00.0
LAIFGBKF_200.01.00.0
LAIFGBKF_211.00.01.0
LAIFGBKF_220.01.00.0
LAIFGBKF_230.01.00.0
LAIFGBKF_241.00.01.0
LAIFGBKF_250.01.00.0
LAIFGBKF_260.01.00.0
LAIFGBKF_270.01.00.0
LAIFGBKF_280.01.00.0
LAIFGBKF_290.01.00.0
LAIFGBKF_300.01.00.0
LAIFGBKF_310.01.00.0
LAIFGBKF_320.01.00.0
LAIFGBKF_331.00.01.0
LAIFGBKF_340.01.00.0
LAIFGBKF_350.01.00.0
LAIFGBKF_361.00.01.0
LAIFGBKF_370.01.00.0
LAIFGBKF_380.01.00.0
LAIFGBKF_390.01.00.0
LAIFGBKF_401.00.01.0
LAIFGBKF_410.01.00.0
LAIFGBKF_421.00.01.0
LAIFGBKF_431.00.01.0
LAIFGBKF_440.01.00.0
LAIFGBKF_450.01.00.0
LAIFGBKF_460.01.00.0
LAIFGBKF_470.01.00.0
LAIFGBKF_480.01.00.0
LAIFGBKF_491.00.01.0
LAIFGBKF_500.01.00.0
LAIFGBKF_511.00.01.0
LAIFGBKF_521.00.01.0
LAIFGBKF_530.01.00.0
LAIFGBKF_541.00.01.0
LAIFGBKF_550.01.00.0
LAIFGBKF_560.01.00.0
LAIFGBKF_570.01.00.0
LAIFGBKF_580.01.00.0
LAIFGBKF_591.00.01.0
LAIFGBKF_601.00.01.0
LAIFGBKF_610.01.00.0
LAIFGBKF_621.00.01.0
LAIFGBKF_630.01.00.0
LAIFGBKF_641.00.01.0
LAIFGBKF_650.01.00.0
LAIFGBKF_660.01.00.0
LAIFGBKF_670.01.00.0
LAIFGBKF_680.01.00.0
LAIFGBKF_690.01.00.0
LAIFGBKF_700.01.00.0
LAIFGBKF_711.00.01.0
LAIFGBKF_720.01.00.0
LAIFGBKF_730.01.00.0
LAIFGBKF_740.01.00.0
LAIFGBKF_751.00.01.0
LAIFGBKF_760.01.00.0
LAIFGBKF_771.00.01.0
LAIFGBKF_780.01.00.0
LAIFGBKF_791.00.01.0
LAIFGBKF_810.01.00.0
LAIFGBKF_821.00.01.0
LAIFGBKF_831.00.01.0
LAIFGBKF_840.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
LAIFGBKF_56563913535FalseMyoviridaeVOG2793,

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements