Probiotic potential risk score
| ARGs | VFs | PGs | PPRS |
|---|---|---|---|
| 1 | 0 | 0 | 1.00 |
PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).
Antibiotic resistance genes
Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)
| Query ID | Begin | End | ARO name | ARO accession | CARD name | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AEOJNBKB_12 | 89901 | 91826 | tet(Q) | ARO:3000191 | tet(Q) | 96.41 | 97.56 | Z21523.1 |
RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)
ResFinder
| Query ID | Begin | End | Resistance gene | Phenotype | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AEOJNBKB_12 | 89901 | 91826 | tet(Q) | Doxycycline, Tetracycline, Minocycline | 99.84 | 100.00 | L33696 |
ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)
AMRFinderPlus
| Query ID | Begin | End | Gene symbol | Sequence name | Method | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AEOJNBKB_12 | 89901 | 91823 | tet(Q) | tetracycline resistance ribosomal protection protein Tet(Q) | BLASTX | 99.53 | 100.00 | WP_063856407.1 |
AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)
Virulence factors
Virulence Factor Database (VFDB)
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | VF name | VF category | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | |||||||||
BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)
VirulenceFinder
| Query ID | Begin | End | Database | Virulence factor | Protein function | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)
Pathogenic genes
PHI-base
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | Function | Identity | Coverage | Gene ID |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)
Plasmid
PlasmidFinder
| Query ID | Begin | End | Plasmid | Query / Template | Identity | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|
| AEOJNBKB_57 | 556 | 1136 | repUS2 | 584 / 681 | 80.48 | BFU30316 |
PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)
PlasmidHunter
| Query ID | Prediction | Chromosome | Plasmid |
|---|---|---|---|
| AEOJNBKB_1 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_2 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_3 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_4 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_5 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_6 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_7 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_8 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_9 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_10 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_11 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_12 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_13 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_14 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_15 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_16 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_17 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_18 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_19 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_20 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_21 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_22 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_23 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_24 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_25 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_26 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_27 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_28 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_29 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_30 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_31 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_32 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_33 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_34 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_35 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_36 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| AEOJNBKB_37 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_38 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_39 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_40 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_41 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_42 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_43 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_44 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_45 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| AEOJNBKB_46 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_47 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_48 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| AEOJNBKB_49 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_50 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| AEOJNBKB_52 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| AEOJNBKB_53 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_54 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| AEOJNBKB_55 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_56 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| AEOJNBKB_57 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| AEOJNBKB_58 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| AEOJNBKB_59 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_60 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_61 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_62 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_63 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_64 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_65 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_66 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_67 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| AEOJNBKB_68 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| AEOJNBKB_69 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| AEOJNBKB_70 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_71 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| AEOJNBKB_72 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| AEOJNBKB_73 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| AEOJNBKB_74 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| AEOJNBKB_75 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| AEOJNBKB_76 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_77 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| AEOJNBKB_78 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)
Prophage
Phigaro
| Query ID | Begin | End | Transposable | Taxonomy | pVOGs |
|---|---|---|---|---|---|
| AEOJNBKB_31 | 7846 | 20351 | False | Siphoviridae | VOG3691, |
Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)