Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
2002.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
ENAJNLPB_667484775812CfxA2ARO:3003002CfxA2100.00100.00AF118110.1
ENAJNLPB_794940051346tet(Q)ARO:3000191tet(Q)96.3998.63Z21523.1

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
ENAJNLPB_667484775812cfxA3Ampicillin99.90100.00AF472622
ENAJNLPB_667484775812cfxA4Unknown Beta-lactam99.90100.00AY769933
ENAJNLPB_667484775812cfxA5Unknown Beta-lactam99.90100.00AY769934
ENAJNLPB_667484775812cfxACefoxitin, Ampicillin99.90100.00U38243
ENAJNLPB_794943451346tet(Q)Doxycycline, Tetracycline, Minocycline99.8499.33L33696

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
ENAJNLPB_667485075812cfxACfxA family broad-spectrum class A beta-lactamaseEXACTX100.00100.00WP_004339683.1
ENAJNLPB_794943351346tet(Q)tetracycline resistance ribosomal protection protein Tet(Q)BLASTX99.3799.53WP_063856407.1

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
ENAJNLPB_10.01.00.0
ENAJNLPB_20.01.00.0
ENAJNLPB_30.01.00.0
ENAJNLPB_40.01.00.0
ENAJNLPB_51.00.01.0
ENAJNLPB_60.01.00.0
ENAJNLPB_70.01.00.0
ENAJNLPB_81.00.01.0
ENAJNLPB_91.00.01.0
ENAJNLPB_100.01.00.0
ENAJNLPB_110.01.00.0
ENAJNLPB_120.01.00.0
ENAJNLPB_131.00.01.0
ENAJNLPB_141.00.01.0
ENAJNLPB_150.01.00.0
ENAJNLPB_160.01.00.0
ENAJNLPB_180.01.00.0
ENAJNLPB_191.00.01.0
ENAJNLPB_201.00.01.0
ENAJNLPB_211.00.01.0
ENAJNLPB_220.01.00.0
ENAJNLPB_231.00.01.0
ENAJNLPB_241.00.01.0
ENAJNLPB_251.00.01.0
ENAJNLPB_261.00.01.0
ENAJNLPB_271.00.01.0
ENAJNLPB_281.00.01.0
ENAJNLPB_290.01.00.0
ENAJNLPB_300.01.00.0
ENAJNLPB_311.00.01.0
ENAJNLPB_321.00.01.0
ENAJNLPB_330.01.00.0
ENAJNLPB_341.00.01.0
ENAJNLPB_350.01.00.0
ENAJNLPB_360.01.00.0
ENAJNLPB_371.00.01.0
ENAJNLPB_381.00.01.0
ENAJNLPB_391.00.01.0
ENAJNLPB_401.00.01.0
ENAJNLPB_410.01.00.0
ENAJNLPB_420.01.00.0
ENAJNLPB_430.01.00.0
ENAJNLPB_440.01.00.0
ENAJNLPB_450.01.00.0
ENAJNLPB_460.01.00.0
ENAJNLPB_470.01.00.0
ENAJNLPB_480.01.00.0
ENAJNLPB_490.01.00.0
ENAJNLPB_500.01.00.0
ENAJNLPB_510.01.00.0
ENAJNLPB_520.01.00.0
ENAJNLPB_530.01.00.0
ENAJNLPB_540.01.00.0
ENAJNLPB_550.01.00.0
ENAJNLPB_560.01.00.0
ENAJNLPB_570.01.00.0
ENAJNLPB_580.01.00.0
ENAJNLPB_590.01.00.0
ENAJNLPB_600.01.00.0
ENAJNLPB_610.01.00.0
ENAJNLPB_620.01.00.0
ENAJNLPB_630.01.00.0
ENAJNLPB_640.01.00.0
ENAJNLPB_650.01.00.0
ENAJNLPB_660.01.00.0
ENAJNLPB_670.01.00.0
ENAJNLPB_680.01.00.0
ENAJNLPB_690.01.00.0
ENAJNLPB_700.01.00.0
ENAJNLPB_710.01.00.0
ENAJNLPB_720.01.00.0
ENAJNLPB_730.01.00.0
ENAJNLPB_740.01.00.0
ENAJNLPB_750.01.00.0
ENAJNLPB_760.01.00.0
ENAJNLPB_770.01.00.0
ENAJNLPB_780.01.00.0
ENAJNLPB_790.01.00.0
ENAJNLPB_800.01.00.0
ENAJNLPB_810.01.00.0
ENAJNLPB_820.01.00.0
ENAJNLPB_830.01.00.0
ENAJNLPB_840.01.00.0
ENAJNLPB_850.01.00.0
ENAJNLPB_860.01.00.0
ENAJNLPB_870.01.00.0
ENAJNLPB_880.01.00.0
ENAJNLPB_890.01.00.0
ENAJNLPB_900.01.00.0
ENAJNLPB_910.01.00.0
ENAJNLPB_920.01.00.0
ENAJNLPB_930.01.00.0
ENAJNLPB_940.01.00.0
ENAJNLPB_950.01.00.0
ENAJNLPB_960.01.00.0
ENAJNLPB_970.01.00.0
ENAJNLPB_980.01.00.0
ENAJNLPB_990.01.00.0
ENAJNLPB_1000.01.00.0
ENAJNLPB_1010.01.00.0
ENAJNLPB_1020.01.00.0
ENAJNLPB_1030.01.00.0
ENAJNLPB_1040.01.00.0
ENAJNLPB_1050.01.00.0
ENAJNLPB_1060.01.00.0
ENAJNLPB_1070.01.00.0
ENAJNLPB_1080.01.00.0
ENAJNLPB_1090.01.00.0
ENAJNLPB_1100.01.00.0
ENAJNLPB_1111.00.01.0
ENAJNLPB_1120.01.00.0
ENAJNLPB_1130.01.00.0
ENAJNLPB_1140.01.00.0
ENAJNLPB_1150.01.00.0
ENAJNLPB_1160.01.00.0
ENAJNLPB_1170.01.00.0
ENAJNLPB_1180.01.00.0
ENAJNLPB_1190.01.00.0
ENAJNLPB_1200.01.00.0
ENAJNLPB_1210.01.00.0
ENAJNLPB_1220.01.00.0
ENAJNLPB_1230.01.00.0
ENAJNLPB_1240.01.00.0
ENAJNLPB_1250.01.00.0
ENAJNLPB_1260.01.00.0
ENAJNLPB_1270.01.00.0
ENAJNLPB_1280.01.00.0
ENAJNLPB_1290.01.00.0
ENAJNLPB_1300.01.00.0
ENAJNLPB_1310.01.00.0
ENAJNLPB_1320.01.00.0
ENAJNLPB_1330.01.00.0
ENAJNLPB_1340.01.00.0
ENAJNLPB_1350.01.00.0
ENAJNLPB_1361.00.01.0
ENAJNLPB_1370.01.00.0
ENAJNLPB_1380.01.00.0
ENAJNLPB_1390.01.00.0
ENAJNLPB_1400.01.00.0
ENAJNLPB_1410.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
No hit found

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements