Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
1001.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
IMDEBNKP_881335713557vanU-Gglycopeptide resistance transcriptional regulator VanU-GPARTIALX80.6089.33WP_021418929.1

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
IMDEBNKP_11.00.01.0
IMDEBNKP_21.00.01.0
IMDEBNKP_30.01.00.0
IMDEBNKP_41.00.01.0
IMDEBNKP_61.00.01.0
IMDEBNKP_71.00.01.0
IMDEBNKP_81.00.01.0
IMDEBNKP_91.00.01.0
IMDEBNKP_100.01.00.0
IMDEBNKP_110.01.00.0
IMDEBNKP_121.00.01.0
IMDEBNKP_131.00.01.0
IMDEBNKP_141.00.01.0
IMDEBNKP_151.00.01.0
IMDEBNKP_161.00.01.0
IMDEBNKP_171.00.01.0
IMDEBNKP_181.00.01.0
IMDEBNKP_191.00.01.0
IMDEBNKP_200.01.00.0
IMDEBNKP_211.00.01.0
IMDEBNKP_220.01.00.0
IMDEBNKP_241.00.01.0
IMDEBNKP_250.01.00.0
IMDEBNKP_260.01.00.0
IMDEBNKP_270.01.00.0
IMDEBNKP_290.01.00.0
IMDEBNKP_301.00.01.0
IMDEBNKP_310.01.00.0
IMDEBNKP_320.01.00.0
IMDEBNKP_330.01.00.0
IMDEBNKP_341.00.01.0
IMDEBNKP_350.01.00.0
IMDEBNKP_360.01.00.0
IMDEBNKP_370.01.00.0
IMDEBNKP_381.00.01.0
IMDEBNKP_391.00.01.0
IMDEBNKP_400.01.00.0
IMDEBNKP_421.00.01.0
IMDEBNKP_431.00.01.0
IMDEBNKP_440.01.00.0
IMDEBNKP_451.00.01.0
IMDEBNKP_460.01.00.0
IMDEBNKP_470.01.00.0
IMDEBNKP_480.01.00.0
IMDEBNKP_490.01.00.0
IMDEBNKP_500.01.00.0
IMDEBNKP_510.01.00.0
IMDEBNKP_520.01.00.0
IMDEBNKP_530.01.00.0
IMDEBNKP_540.01.00.0
IMDEBNKP_550.01.00.0
IMDEBNKP_560.01.00.0
IMDEBNKP_570.01.00.0
IMDEBNKP_580.01.00.0
IMDEBNKP_590.01.00.0
IMDEBNKP_600.01.00.0
IMDEBNKP_610.01.00.0
IMDEBNKP_620.01.00.0
IMDEBNKP_630.01.00.0
IMDEBNKP_641.00.01.0
IMDEBNKP_650.01.00.0
IMDEBNKP_660.01.00.0
IMDEBNKP_670.01.00.0
IMDEBNKP_680.01.00.0
IMDEBNKP_691.00.01.0
IMDEBNKP_700.01.00.0
IMDEBNKP_710.01.00.0
IMDEBNKP_720.01.00.0
IMDEBNKP_730.01.00.0
IMDEBNKP_740.01.00.0
IMDEBNKP_750.01.00.0
IMDEBNKP_760.01.00.0
IMDEBNKP_771.00.01.0
IMDEBNKP_780.01.00.0
IMDEBNKP_790.01.00.0
IMDEBNKP_800.01.00.0
IMDEBNKP_811.00.01.0
IMDEBNKP_820.01.00.0
IMDEBNKP_830.01.00.0
IMDEBNKP_840.01.00.0
IMDEBNKP_850.01.00.0
IMDEBNKP_860.01.00.0
IMDEBNKP_870.01.00.0
IMDEBNKP_880.01.00.0
IMDEBNKP_890.01.00.0
IMDEBNKP_901.00.01.0
IMDEBNKP_911.00.01.0
IMDEBNKP_921.00.01.0
IMDEBNKP_931.00.01.0
IMDEBNKP_941.00.01.0
IMDEBNKP_950.01.00.0
IMDEBNKP_960.01.00.0
IMDEBNKP_971.00.01.0
IMDEBNKP_980.01.00.0
IMDEBNKP_990.01.00.0
IMDEBNKP_1000.01.00.0
IMDEBNKP_1010.01.00.0
IMDEBNKP_1020.01.00.0
IMDEBNKP_1030.01.00.0
IMDEBNKP_1041.00.01.0
IMDEBNKP_1050.01.00.0
IMDEBNKP_1060.01.00.0
IMDEBNKP_1070.01.00.0
IMDEBNKP_1081.00.01.0
IMDEBNKP_1090.01.00.0
IMDEBNKP_1100.01.00.0
IMDEBNKP_1111.00.01.0
IMDEBNKP_1121.00.01.0
IMDEBNKP_1130.01.00.0
IMDEBNKP_1140.01.00.0
IMDEBNKP_1150.01.00.0
IMDEBNKP_1160.01.00.0
IMDEBNKP_1171.00.01.0
IMDEBNKP_1180.01.00.0
IMDEBNKP_1190.01.00.0
IMDEBNKP_1200.01.00.0
IMDEBNKP_1210.01.00.0
IMDEBNKP_1221.00.01.0
IMDEBNKP_1231.00.01.0
IMDEBNKP_1241.00.01.0
IMDEBNKP_1251.00.01.0
IMDEBNKP_1270.01.00.0
IMDEBNKP_1281.00.01.0
IMDEBNKP_1290.01.00.0
IMDEBNKP_1301.00.01.0
IMDEBNKP_1321.00.01.0
IMDEBNKP_1331.00.01.0
IMDEBNKP_1340.01.00.0
IMDEBNKP_1360.01.00.0
IMDEBNKP_1370.01.00.0
IMDEBNKP_1381.00.01.0
IMDEBNKP_1391.00.01.0
IMDEBNKP_1400.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
No hit found

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements