Probiotic potential risk score
| ARGs | VFs | PGs | PPRS |
|---|---|---|---|
| 4 | 0 | 0 | 4.00 |
PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).
Antibiotic resistance genes
Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)
| Query ID | Begin | End | ARO name | ARO accession | CARD name | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| FACJAAOP_651 | 132 | 2057 | tet(Q) | ARO:3000191 | tet(Q) | 96.41 | 97.56 | Z21523.1 |
| FACJAAOP_147 | 78 | 1043 | CfxA2 | ARO:3003002 | CfxA2 | 99.38 | 100.00 | AF118110.1 |
RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)
ResFinder
| Query ID | Begin | End | Resistance gene | Phenotype | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| FACJAAOP_651 | 132 | 2057 | tet(Q) | Doxycycline, Tetracycline, Minocycline | 99.84 | 100.00 | L33696 |
| FACJAAOP_147 | 78 | 1043 | cfxA3 | Ampicillin | 99.17 | 100.00 | AF472622 |
| FACJAAOP_147 | 78 | 1043 | cfxA4 | Unknown Beta-lactam | 99.17 | 100.00 | AY769933 |
| FACJAAOP_147 | 78 | 1043 | cfxA5 | Unknown Beta-lactam | 99.17 | 100.00 | AY769934 |
| FACJAAOP_147 | 78 | 1043 | cfxA | Cefoxitin, Ampicillin | 99.17 | 100.00 | U38243 |
| FACJAAOP_177 | 31395 | 32858 | msr(D) | Erythromycin, Azithromycin, Telithromycin, Quinupristin, Pristinamycin IA, Virginiamycin S | 97.54 | 100.00 | AF274302 |
| FACJAAOP_177 | 30055 | 31269 | mef(A) | Erythromycin, Azithromycin | 94.24 | 99.75 | AF227520 |
| FACJAAOP_177 | 33630 | 34091 | erm(G) | Erythromycin, Lincomycin, Clindamycin, Quinupristin, Pristinamycin IA, Virginiamycin S | 99.57 | 62.86 | L42817 |
ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)
AMRFinderPlus
| Query ID | Begin | End | Gene symbol | Sequence name | Method | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| FACJAAOP_651 | 132 | 2054 | tet(Q) | tetracycline resistance ribosomal protection protein Tet(Q) | BLASTX | 99.53 | 100.00 | WP_063856407.1 |
| FACJAAOP_147 | 78 | 1040 | cfxA | CfxA family broad-spectrum class A beta-lactamase | BLASTX | 99.38 | 100.00 | WP_004339683.1 |
| FACJAAOP_177 | 31395 | 32855 | msr(D) | ABC-F type ribosomal protection protein Msr(D) | BLASTX | 97.13 | 100.00 | WP_000420313.1 |
| FACJAAOP_177 | 30055 | 31278 | mef(A) | macrolide efflux MFS transporter Mef(A) | BLASTX | 96.57 | 100.00 | WP_012102963.1 |
| FACJAAOP_177 | 33630 | 34091 | erm(G) | 23S rRNA (adenine(2058)-N(6))-methyltransferase Erm(G) | PARTIAL_CONTIG_ENDX | 100.00 | 63.11 | WP_063844787.1 |
AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)
Virulence factors
Virulence Factor Database (VFDB)
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | VF name | VF category | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | |||||||||
BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)
VirulenceFinder
| Query ID | Begin | End | Database | Virulence factor | Protein function | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)
Pathogenic genes
PHI-base
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | Function | Identity | Coverage | Gene ID |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)
Plasmid
PlasmidFinder
| Query ID | Begin | End | Plasmid | Query / Template | Identity | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|
| FACJAAOP_418 | 473 | 1053 | repUS2 | 584 / 681 | 80.48 | BFU30316 |
PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)
PlasmidHunter
| Query ID | Prediction | Chromosome | Plasmid |
|---|---|---|---|
| FACJAAOP_1 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_2 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_3 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_4 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_5 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_6 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_7 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_8 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_9 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_10 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_11 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_12 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_13 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_14 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_15 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_16 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_17 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_18 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_19 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_20 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_21 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_22 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_23 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_24 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_25 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_26 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_27 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_28 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_29 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_30 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_31 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_32 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_33 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_34 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_35 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_36 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_37 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_38 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_39 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_40 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_41 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_42 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_43 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_44 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_45 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_46 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_47 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_48 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_49 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_50 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_51 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_52 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_53 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_54 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_55 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_56 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_57 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_58 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_59 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_60 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_61 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_62 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_63 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_64 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_65 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_66 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_67 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_68 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_69 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_70 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_71 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_72 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_73 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_74 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_75 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_76 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_77 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_78 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_79 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_80 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_81 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_82 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_83 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_84 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_85 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_86 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_87 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_88 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_89 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_90 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_91 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_92 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_93 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_94 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_95 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_96 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_97 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_98 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_99 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_100 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_101 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_102 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_103 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_104 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_105 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_106 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_107 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_108 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_109 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_110 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_111 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_112 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_113 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_114 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_115 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_116 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_117 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_118 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_119 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_120 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_121 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_122 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_123 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_124 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_125 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_126 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_127 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_128 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_129 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_130 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_131 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_132 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_133 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_134 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_135 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_136 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_137 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_138 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_139 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_140 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_141 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_142 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_143 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_144 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_145 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_146 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_147 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_148 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_149 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_150 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_151 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_152 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_153 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_154 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_155 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_156 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_157 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_158 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_159 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_160 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_161 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_162 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_163 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_164 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_165 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_166 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_167 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_168 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_169 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_170 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_171 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_172 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_173 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_174 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_175 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_176 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_177 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_178 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_179 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_180 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_181 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_182 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_183 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_184 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_185 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_186 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_187 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_188 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_189 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_190 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_191 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_192 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_193 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_194 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_195 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_196 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_197 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_198 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_199 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_200 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_201 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_202 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_203 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_204 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_205 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_206 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_207 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_208 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_209 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_210 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_211 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_212 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_213 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_214 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_215 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_216 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_217 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_218 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_219 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_220 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_221 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_222 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_223 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_224 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_225 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_226 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_227 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_228 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_229 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_230 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_231 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_232 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_233 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_234 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_235 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_236 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_237 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_238 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_239 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| FACJAAOP_240 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| FACJAAOP_241 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
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