Probiotic potential risk score
| ARGs | VFs | PGs | PPRS |
|---|---|---|---|
| 5 | 0 | 0 | 5.00 |
PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).
Antibiotic resistance genes
Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)
| Query ID | Begin | End | ARO name | ARO accession | CARD name | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ONFFCOJN_7 | 10132 | 11022 | CblA-1 | ARO:3002999 | CblA-1 | 100.00 | 100.00 | GQ343019.1 |
| ONFFCOJN_113 | 4547 | 6520 | tet(Q) | ARO:3000191 | tet(Q) | 96.35 | 100.00 | Z21523.1 |
| ONFFCOJN_194 | 72 | 1037 | CfxA2 | ARO:3003002 | CfxA2 | 99.69 | 100.00 | AF118110.1 |
RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)
ResFinder
| Query ID | Begin | End | Resistance gene | Phenotype | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ONFFCOJN_113 | 4547 | 6472 | tet(Q) | Doxycycline, Tetracycline, Minocycline | 99.84 | 100.00 | L33696 |
| ONFFCOJN_194 | 72 | 1037 | cfxA3 | Ampicillin | 99.79 | 100.00 | AF472622 |
| ONFFCOJN_194 | 72 | 1037 | cfxA4 | Unknown Beta-lactam | 99.79 | 100.00 | AY769933 |
| ONFFCOJN_194 | 72 | 1037 | cfxA5 | Unknown Beta-lactam | 99.79 | 100.00 | AY769934 |
| ONFFCOJN_194 | 72 | 1037 | cfxA | Cefoxitin, Ampicillin | 99.79 | 100.00 | U38243 |
| ONFFCOJN_261 | 88 | 1551 | msr(D) | Erythromycin, Azithromycin, Telithromycin, Quinupristin, Pristinamycin IA, Virginiamycin S | 97.54 | 100.00 | AF274302 |
| ONFFCOJN_37 | 4 | 1052 | mef(A) | Erythromycin, Azithromycin | 94.85 | 86.12 | AF227520 |
ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)
AMRFinderPlus
| Query ID | Begin | End | Gene symbol | Sequence name | Method | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ONFFCOJN_7 | 10132 | 11019 | cblA | CblA family class A beta-lactamase | EXACTX | 100.00 | 100.00 | WP_005827792.1 |
| ONFFCOJN_194 | 72 | 1034 | cfxA | CfxA family broad-spectrum class A beta-lactamase | BLASTX | 99.69 | 100.00 | WP_004339683.1 |
| ONFFCOJN_113 | 4550 | 6472 | tet(Q) | tetracycline resistance ribosomal protection protein Tet(Q) | BLASTX | 99.53 | 100.00 | WP_063856407.1 |
| ONFFCOJN_37 | 3 | 1052 | mef(A) | macrolide efflux MFS transporter Mef(A) | PARTIAL_CONTIG_ENDX | 97.43 | 85.78 | WP_012102963.1 |
| ONFFCOJN_261 | 91 | 1551 | msr(D) | ABC-F type ribosomal protection protein Msr(D) | BLASTX | 97.13 | 100.00 | WP_000420313.1 |
AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)
Virulence factors
Virulence Factor Database (VFDB)
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | VF name | VF category | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | |||||||||
BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)
VirulenceFinder
| Query ID | Begin | End | Database | Virulence factor | Protein function | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)
Pathogenic genes
PHI-base
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | Function | Identity | Coverage | Gene ID |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)
Plasmid
PlasmidFinder
| Query ID | Begin | End | Plasmid | Query / Template | Identity | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|
| ONFFCOJN_223 | 2092 | 2672 | repUS2 | 584 / 681 | 80.48 | BFU30316 |
PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)
PlasmidHunter
| Query ID | Prediction | Chromosome | Plasmid |
|---|---|---|---|
| ONFFCOJN_1 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_2 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_3 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_4 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_5 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_6 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_7 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_8 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_9 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_10 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_11 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_12 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_13 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_14 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_15 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_16 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_17 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_18 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_19 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_20 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_21 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_22 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_23 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_24 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_25 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_26 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_27 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_28 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_29 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_30 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_31 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_32 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_33 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_34 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_35 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_36 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_37 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_38 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_39 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_40 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_41 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_42 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_43 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_44 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_45 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_46 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_47 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_48 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_49 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_50 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_51 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_52 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_53 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_54 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_55 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_56 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_57 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_58 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_59 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_60 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_61 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_62 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_63 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_64 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_65 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_66 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_67 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_68 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_69 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_70 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_71 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_72 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_73 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_74 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_75 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_76 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_77 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_78 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_79 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_80 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_81 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_82 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_83 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_84 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_85 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_86 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_87 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_88 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_89 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_90 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_91 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_92 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_93 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_94 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_95 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_96 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_97 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_98 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_99 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_100 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_101 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_102 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_103 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_104 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_105 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_106 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_107 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_108 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_109 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_110 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_111 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_112 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_113 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_114 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_115 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_116 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_117 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_118 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_119 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_120 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_121 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_122 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_123 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_124 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_125 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_126 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_127 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_128 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_129 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_130 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_131 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_132 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_133 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_134 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_135 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_136 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_137 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_138 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_139 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_140 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_141 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_142 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_143 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_144 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_145 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_146 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_147 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_148 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_149 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_150 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_151 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_152 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_153 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_154 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_155 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_156 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_157 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_158 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_159 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_160 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_161 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_162 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_163 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_164 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_165 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_166 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_167 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_168 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_169 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_170 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_171 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_172 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_173 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_174 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_175 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_176 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_177 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_178 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_179 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_180 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_181 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_182 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_183 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_184 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_185 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_186 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_187 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_188 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_189 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_190 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_191 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_192 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_193 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_194 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_195 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_196 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_197 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_198 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_199 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_200 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_201 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_202 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_203 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_204 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_205 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_206 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_207 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_208 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_209 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_210 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_211 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_212 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_213 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_214 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_215 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_216 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_217 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_218 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_219 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_220 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_221 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_222 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_223 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_224 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_225 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_226 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_227 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_228 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_229 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_230 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_231 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_232 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_233 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_234 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_235 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_237 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_238 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_239 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_240 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_241 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| ONFFCOJN_242 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| ONFFCOJN_243 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
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