Probiotic potential risk score
| ARGs | VFs | PGs | PPRS |
|---|---|---|---|
| 3 | 0 | 1 | 3.16 |
PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).
Antibiotic resistance genes
Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)
| Query ID | Begin | End | ARO name | ARO accession | CARD name | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| JELDGKEC_257 | 1408 | 3354 | tet(Q) | ARO:3000191 | tet(Q) | 96.45 | 98.63 | Z21523.1 |
| JELDGKEC_491 | 1115 | 1915 | ErmF | ARO:3000498 | ErmF | 98.12 | 100.00 | M17124.1 |
| JELDGKEC_491 | 88 | 912 | OXA-347 | ARO:3001777 | OXA-347 | 100.00 | 100.00 | JN086160.1 |
RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)
ResFinder
| Query ID | Begin | End | Resistance gene | Phenotype | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| JELDGKEC_491 | 88 | 912 | blaOXA-347 | Unknown Beta-lactam | 100.00 | 100.00 | ACWG01000053 |
| JELDGKEC_257 | 1408 | 3333 | tet(Q) | Doxycycline, Tetracycline, Minocycline | 99.84 | 100.00 | L33696 |
| JELDGKEC_491 | 1115 | 1915 | erm(F) | Erythromycin, Lincomycin, Clindamycin, Quinupristin, Pristinamycin IA, Virginiamycin S | 99.25 | 100.00 | M17808 |
ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)
AMRFinderPlus
| Query ID | Begin | End | Gene symbol | Sequence name | Method | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| JELDGKEC_491 | 88 | 909 | blaOXA-347 | class D beta-lactamase OXA-347 | ALLELEX | 100.00 | 100.00 | WP_004295324.1 |
| JELDGKEC_257 | 1411 | 3333 | tet(Q) | tetracycline resistance ribosomal protection protein Tet(Q) | BLASTX | 99.53 | 100.00 | WP_063856407.1 |
| JELDGKEC_491 | 1118 | 1915 | erm(F) | 23S rRNA (adenine(2058)-N(6))-methyltransferase Erm(F) | BLASTX | 98.50 | 100.00 | WP_002682030.1 |
AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)
Virulence factors
Virulence Factor Database (VFDB)
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | VF name | VF category | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | |||||||||
BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)
VirulenceFinder
| Query ID | Begin | End | Database | Virulence factor | Protein function | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)
Pathogenic genes
PHI-base
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | Function | Identity | Coverage | Gene ID |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| JELDGKEC_552 | 1861 | 281 | GroEL | 0.0 | folding of newly synthesized proteins, preventing misfolding and aggregation | 86.72 | 96.70 | BAA04222 |
BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)
Plasmid
PlasmidFinder
| Query ID | Begin | End | Plasmid | Query / Template | Identity | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||
PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)
PlasmidHunter
| Query ID | Prediction | Chromosome | Plasmid |
|---|---|---|---|
| JELDGKEC_1 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_2 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_3 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_4 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_5 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_6 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_7 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_8 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_9 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_10 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_11 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_12 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_13 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_14 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_15 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_16 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_17 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_18 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_19 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_20 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_21 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_22 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_23 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_24 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_25 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_26 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_27 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_28 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_29 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_30 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_31 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_32 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_33 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_34 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_35 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_36 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_37 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_38 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_39 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_40 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_41 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_42 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_43 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_44 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_45 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_46 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_47 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_48 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_49 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_50 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_51 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_52 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_53 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_54 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_55 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_56 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_57 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_58 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_59 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_60 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_61 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_62 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_63 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_64 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_65 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_66 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_67 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_68 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_69 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_70 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_71 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_72 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_73 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_74 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_75 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_76 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_77 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_78 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_79 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_80 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_81 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_82 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_83 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_84 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_85 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_86 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_87 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_88 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_89 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_90 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_91 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_92 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_93 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_94 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_95 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_96 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_97 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_98 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_99 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_100 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_101 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_102 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_103 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_104 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_105 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_106 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_107 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_108 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_109 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_110 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_111 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_112 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_113 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_114 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_115 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_116 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_117 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_118 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_119 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_120 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_121 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_122 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_123 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_124 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_125 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_126 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_127 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_128 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_129 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_130 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_131 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_132 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_133 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_134 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_135 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_136 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_137 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_138 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_139 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_140 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_141 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_142 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_143 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_144 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_145 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_146 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_147 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_148 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_149 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_150 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_151 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_152 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_153 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_154 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_155 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_156 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_157 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_158 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_159 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_160 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_161 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_162 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_163 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_164 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_165 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_166 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_167 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_168 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_169 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_170 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_171 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_172 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_173 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_174 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_175 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_176 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_177 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_178 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_179 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_180 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_181 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_182 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_183 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_184 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_185 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_186 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_187 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_188 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_189 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_190 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_191 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_192 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_193 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_194 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_195 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_196 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_197 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_198 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_199 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_200 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_201 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_202 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_203 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_204 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_205 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_206 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_207 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_208 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_209 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_210 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_211 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_212 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_213 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_214 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_215 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_216 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_217 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_218 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_219 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_220 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_221 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_222 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_223 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_224 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_225 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_226 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_227 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_228 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_229 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_230 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_231 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_232 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_233 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_234 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_235 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_236 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_237 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_238 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_239 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_240 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_241 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_242 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_243 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_244 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_245 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_246 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_247 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_248 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_249 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_250 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_251 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_252 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_253 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JELDGKEC_254 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JELDGKEC_255 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
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PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)
Prophage
Phigaro
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Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)