Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
BMEMPLHF_10.01.00.0
BMEMPLHF_50.01.00.0
BMEMPLHF_60.01.00.0
BMEMPLHF_80.01.00.0
BMEMPLHF_90.01.00.0
BMEMPLHF_100.01.00.0
BMEMPLHF_120.01.00.0
BMEMPLHF_160.01.00.0
BMEMPLHF_170.01.00.0
BMEMPLHF_190.01.00.0
BMEMPLHF_220.01.00.0
BMEMPLHF_230.01.00.0
BMEMPLHF_280.01.00.0
BMEMPLHF_320.01.00.0
BMEMPLHF_330.01.00.0
BMEMPLHF_340.01.00.0
BMEMPLHF_360.01.00.0
BMEMPLHF_370.01.00.0
BMEMPLHF_390.01.00.0
BMEMPLHF_420.01.00.0
BMEMPLHF_430.01.00.0
BMEMPLHF_440.01.00.0
BMEMPLHF_450.01.00.0
BMEMPLHF_460.01.00.0
BMEMPLHF_480.01.00.0
BMEMPLHF_490.01.00.0
BMEMPLHF_500.01.00.0
BMEMPLHF_510.01.00.0
BMEMPLHF_530.01.00.0
BMEMPLHF_540.01.00.0
BMEMPLHF_551.00.01.0
BMEMPLHF_560.01.00.0
BMEMPLHF_570.01.00.0
BMEMPLHF_590.01.00.0
BMEMPLHF_610.01.00.0
BMEMPLHF_690.01.00.0
BMEMPLHF_700.01.00.0
BMEMPLHF_710.01.00.0
BMEMPLHF_750.01.00.0
BMEMPLHF_760.01.00.0
BMEMPLHF_770.01.00.0
BMEMPLHF_780.01.00.0
BMEMPLHF_790.01.00.0
BMEMPLHF_800.01.00.0
BMEMPLHF_830.01.00.0
BMEMPLHF_870.01.00.0
BMEMPLHF_880.01.00.0
BMEMPLHF_891.00.01.0
BMEMPLHF_900.01.00.0
BMEMPLHF_911.00.01.0
BMEMPLHF_930.01.00.0
BMEMPLHF_940.01.00.0
BMEMPLHF_970.01.00.0
BMEMPLHF_980.01.00.0
BMEMPLHF_1000.01.00.0
BMEMPLHF_1010.01.00.0
BMEMPLHF_1031.00.01.0
BMEMPLHF_1041.00.01.0
BMEMPLHF_1080.01.00.0
BMEMPLHF_1090.01.00.0
BMEMPLHF_1100.01.00.0
BMEMPLHF_1110.01.00.0
BMEMPLHF_1120.01.00.0
BMEMPLHF_1130.01.00.0
BMEMPLHF_1161.00.01.0
BMEMPLHF_1170.01.00.0
BMEMPLHF_1180.01.00.0
BMEMPLHF_1190.01.00.0
BMEMPLHF_1220.01.00.0
BMEMPLHF_1250.01.00.0
BMEMPLHF_1260.01.00.0
BMEMPLHF_1270.01.00.0
BMEMPLHF_1290.01.00.0
BMEMPLHF_1300.01.00.0
BMEMPLHF_1310.01.00.0
BMEMPLHF_1331.00.01.0
BMEMPLHF_1340.01.00.0
BMEMPLHF_1360.01.00.0
BMEMPLHF_1410.01.00.0
BMEMPLHF_1420.01.00.0
BMEMPLHF_1450.01.00.0
BMEMPLHF_1461.00.01.0
BMEMPLHF_1490.01.00.0
BMEMPLHF_1501.00.01.0
BMEMPLHF_1510.01.00.0
BMEMPLHF_1520.01.00.0
BMEMPLHF_1530.01.00.0
BMEMPLHF_1540.01.00.0
BMEMPLHF_1570.01.00.0
BMEMPLHF_1610.01.00.0
BMEMPLHF_1670.01.00.0
BMEMPLHF_1700.01.00.0
BMEMPLHF_1720.01.00.0
BMEMPLHF_1730.01.00.0
BMEMPLHF_1740.01.00.0
BMEMPLHF_1761.00.01.0
BMEMPLHF_1770.01.00.0
BMEMPLHF_1791.00.01.0
BMEMPLHF_1820.01.00.0
BMEMPLHF_1830.01.00.0
BMEMPLHF_1840.01.00.0
BMEMPLHF_1860.01.00.0
BMEMPLHF_1870.01.00.0
BMEMPLHF_1890.01.00.0
BMEMPLHF_1920.01.00.0
BMEMPLHF_1930.01.00.0
BMEMPLHF_1961.00.01.0
BMEMPLHF_1990.01.00.0
BMEMPLHF_2010.01.00.0
BMEMPLHF_2020.01.00.0
BMEMPLHF_2040.01.00.0
BMEMPLHF_2060.01.00.0
BMEMPLHF_2090.01.00.0
BMEMPLHF_2100.01.00.0
BMEMPLHF_2130.01.00.0
BMEMPLHF_2150.01.00.0
BMEMPLHF_2160.01.00.0
BMEMPLHF_2170.01.00.0
BMEMPLHF_2201.00.01.0
BMEMPLHF_2210.01.00.0
BMEMPLHF_2220.01.00.0
BMEMPLHF_2230.01.00.0
BMEMPLHF_2250.01.00.0
BMEMPLHF_2260.01.00.0
BMEMPLHF_2300.01.00.0
BMEMPLHF_2310.01.00.0
BMEMPLHF_2330.01.00.0
BMEMPLHF_2340.01.00.0
BMEMPLHF_2350.01.00.0
BMEMPLHF_2360.01.00.0
BMEMPLHF_2390.01.00.0
BMEMPLHF_2420.01.00.0
BMEMPLHF_2490.01.00.0
BMEMPLHF_2501.00.01.0
BMEMPLHF_2510.01.00.0
BMEMPLHF_2530.01.00.0
BMEMPLHF_2541.00.01.0
BMEMPLHF_2570.01.00.0
BMEMPLHF_2610.01.00.0
BMEMPLHF_2630.01.00.0
BMEMPLHF_2650.01.00.0
BMEMPLHF_2661.00.01.0
BMEMPLHF_2670.01.00.0
BMEMPLHF_2680.01.00.0
BMEMPLHF_2690.01.00.0
BMEMPLHF_2700.01.00.0
BMEMPLHF_2711.00.01.0
BMEMPLHF_2740.01.00.0
BMEMPLHF_2760.01.00.0
BMEMPLHF_2781.00.01.0
BMEMPLHF_2800.01.00.0
BMEMPLHF_2820.01.00.0
BMEMPLHF_2830.01.00.0
BMEMPLHF_2840.01.00.0
BMEMPLHF_2880.01.00.0
BMEMPLHF_2890.01.00.0
BMEMPLHF_2900.01.00.0
BMEMPLHF_2920.01.00.0
BMEMPLHF_2930.01.00.0
BMEMPLHF_2970.01.00.0
BMEMPLHF_2990.01.00.0
BMEMPLHF_3011.00.01.0
BMEMPLHF_3021.00.01.0
BMEMPLHF_3030.01.00.0
BMEMPLHF_3050.01.00.0
BMEMPLHF_3061.00.01.0
BMEMPLHF_3070.01.00.0
BMEMPLHF_3080.01.00.0
BMEMPLHF_3090.01.00.0
BMEMPLHF_3100.01.00.0
BMEMPLHF_3110.01.00.0
BMEMPLHF_3130.01.00.0
BMEMPLHF_3140.01.00.0
BMEMPLHF_3150.01.00.0
BMEMPLHF_3160.01.00.0
BMEMPLHF_3170.01.00.0
BMEMPLHF_3180.01.00.0
BMEMPLHF_3190.01.00.0
BMEMPLHF_3200.01.00.0
BMEMPLHF_3220.01.00.0
BMEMPLHF_3230.01.00.0
BMEMPLHF_3240.01.00.0
BMEMPLHF_3290.01.00.0
BMEMPLHF_3300.01.00.0
BMEMPLHF_3310.01.00.0
BMEMPLHF_3320.01.00.0
BMEMPLHF_3330.01.00.0
BMEMPLHF_3350.01.00.0
BMEMPLHF_3360.01.00.0
BMEMPLHF_3370.01.00.0
BMEMPLHF_3411.00.01.0
BMEMPLHF_3440.01.00.0
BMEMPLHF_3450.01.00.0
BMEMPLHF_3460.01.00.0
BMEMPLHF_3490.01.00.0
BMEMPLHF_3500.01.00.0
BMEMPLHF_3510.01.00.0
BMEMPLHF_3520.01.00.0
BMEMPLHF_3530.01.00.0
BMEMPLHF_3540.01.00.0
BMEMPLHF_3560.01.00.0
BMEMPLHF_3590.01.00.0
BMEMPLHF_3600.01.00.0
BMEMPLHF_3610.01.00.0
BMEMPLHF_3630.01.00.0
BMEMPLHF_3640.01.00.0
BMEMPLHF_3650.01.00.0
BMEMPLHF_3700.01.00.0
BMEMPLHF_3750.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
No hit found

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements