Probiotic potential risk score
| ARGs | VFs | PGs | PPRS |
|---|---|---|---|
| 1 | 0 | 0 | 1.00 |
PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).
Antibiotic resistance genes
Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)
| Query ID | Begin | End | ARO name | ARO accession | CARD name | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)
ResFinder
| Query ID | Begin | End | Resistance gene | Phenotype | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| HONLNNHN_113 | 18438 | 19304 | ant(6)-Ia | Streptomycin | 99.65 | 100.00 | KF864551 |
ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)
AMRFinderPlus
| Query ID | Begin | End | Gene symbol | Sequence name | Method | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| HONLNNHN_113 | 18438 | 19301 | aadE | aminoglycoside 6-adenylyltransferase AadE | BLASTX | 99.65 | 100.00 | WP_001255868.1 |
AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)
Virulence factors
Virulence Factor Database (VFDB)
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | VF name | VF category | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | |||||||||
BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)
VirulenceFinder
| Query ID | Begin | End | Database | Virulence factor | Protein function | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)
Pathogenic genes
PHI-base
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | Function | Identity | Coverage | Gene ID |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)
Plasmid
PlasmidFinder
| Query ID | Begin | End | Plasmid | Query / Template | Identity | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||
PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)
PlasmidHunter
| Query ID | Prediction | Chromosome | Plasmid |
|---|---|---|---|
| HONLNNHN_1 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_2 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_3 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_4 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_5 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_6 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_7 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_8 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_9 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_10 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_11 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_12 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_13 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_14 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_15 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_16 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_17 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_18 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_19 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_20 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_21 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_22 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_23 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_24 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_25 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_26 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_28 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_29 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_30 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_31 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_32 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_33 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_34 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_35 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_36 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_37 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_38 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_39 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_40 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_41 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_42 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_43 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_44 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_45 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_46 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_47 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_48 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_49 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_50 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_51 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_53 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_54 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_55 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_56 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_58 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_59 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_60 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_61 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_62 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_63 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_64 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_65 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_66 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_67 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_68 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_69 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_70 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_71 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_72 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_73 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_74 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_75 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_76 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_77 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_78 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_79 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_80 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_81 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_82 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_83 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_84 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_86 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_87 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_88 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_89 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_90 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_91 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_92 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_93 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_94 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_95 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_96 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_97 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_98 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_99 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_100 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_101 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_102 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_103 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_104 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_105 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_106 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_107 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_108 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_109 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_110 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_111 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_112 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_113 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_114 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_115 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_116 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_117 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_118 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_120 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_121 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_122 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_123 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_124 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_125 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_126 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_131 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_132 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_134 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_135 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_136 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_137 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_139 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_140 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_142 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_143 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_144 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_145 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_146 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_147 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_148 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_149 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_150 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_151 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_153 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_154 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_156 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_158 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_169 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_180 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_191 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_202 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_213 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_224 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_225 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_236 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_247 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_258 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_269 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_280 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_291 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_302 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_313 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_324 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_335 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_336 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_347 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_358 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_369 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_378 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_379 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_380 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_381 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_382 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_383 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_384 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_385 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_386 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_387 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_388 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_389 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_390 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_391 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_392 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_393 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_394 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_395 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_396 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_397 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_398 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_399 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_400 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_401 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_402 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_403 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_404 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_405 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_406 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_407 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_408 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_409 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_410 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_411 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_412 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_413 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_414 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_415 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_416 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_417 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_418 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_419 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_420 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_421 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_422 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_423 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_424 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_425 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_426 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_427 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_428 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_429 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_430 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_431 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_432 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_433 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_434 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_435 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_436 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| HONLNNHN_437 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| HONLNNHN_438 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)
Prophage
Phigaro
| Query ID | Begin | End | Transposable | Taxonomy | pVOGs |
|---|---|---|---|---|---|
| HONLNNHN_102 | 15775 | 44961 | False | Siphoviridae | VOG4779, |
| HONLNNHN_158 | 1902 | 16188 | True | Siphoviridae | VOG0221, |
| HONLNNHN_202 | 24054 | 31191 | False | Siphoviridae | VOG4841, |
| HONLNNHN_291 | 4111 | 11559 | False | Siphoviridae | VOG0611, |
| HONLNNHN_389 | 2476 | 12078 | False | Siphoviridae | VOG5716, |
Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)