Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
DDAJDNLD_10.01.00.0
DDAJDNLD_21.00.01.0
DDAJDNLD_30.01.00.0
DDAJDNLD_40.01.00.0
DDAJDNLD_50.01.00.0
DDAJDNLD_60.01.00.0
DDAJDNLD_70.01.00.0
DDAJDNLD_81.00.01.0
DDAJDNLD_90.01.00.0
DDAJDNLD_100.01.00.0
DDAJDNLD_110.01.00.0
DDAJDNLD_120.01.00.0
DDAJDNLD_130.01.00.0
DDAJDNLD_140.01.00.0
DDAJDNLD_150.01.00.0
DDAJDNLD_160.01.00.0
DDAJDNLD_170.01.00.0
DDAJDNLD_180.01.00.0
DDAJDNLD_190.01.00.0
DDAJDNLD_200.01.00.0
DDAJDNLD_210.01.00.0
DDAJDNLD_220.01.00.0
DDAJDNLD_230.01.00.0
DDAJDNLD_240.01.00.0
DDAJDNLD_250.01.00.0
DDAJDNLD_260.01.00.0
DDAJDNLD_270.01.00.0
DDAJDNLD_280.01.00.0
DDAJDNLD_290.01.00.0
DDAJDNLD_301.00.01.0
DDAJDNLD_310.01.00.0
DDAJDNLD_320.01.00.0
DDAJDNLD_330.01.00.0
DDAJDNLD_340.01.00.0
DDAJDNLD_350.01.00.0
DDAJDNLD_360.01.00.0
DDAJDNLD_370.01.00.0
DDAJDNLD_380.01.00.0
DDAJDNLD_390.01.00.0
DDAJDNLD_400.01.00.0
DDAJDNLD_410.01.00.0
DDAJDNLD_420.01.00.0
DDAJDNLD_431.00.01.0
DDAJDNLD_440.01.00.0
DDAJDNLD_450.01.00.0
DDAJDNLD_460.01.00.0
DDAJDNLD_470.01.00.0
DDAJDNLD_480.01.00.0
DDAJDNLD_490.01.00.0
DDAJDNLD_500.01.00.0
DDAJDNLD_510.01.00.0
DDAJDNLD_520.01.00.0
DDAJDNLD_530.01.00.0
DDAJDNLD_541.00.01.0
DDAJDNLD_550.01.00.0
DDAJDNLD_560.01.00.0
DDAJDNLD_570.01.00.0
DDAJDNLD_581.00.01.0
DDAJDNLD_591.00.01.0
DDAJDNLD_600.01.00.0
DDAJDNLD_610.01.00.0
DDAJDNLD_620.01.00.0
DDAJDNLD_630.01.00.0
DDAJDNLD_640.01.00.0
DDAJDNLD_650.01.00.0
DDAJDNLD_661.00.01.0
DDAJDNLD_671.00.01.0
DDAJDNLD_681.00.01.0
DDAJDNLD_690.01.00.0
DDAJDNLD_700.01.00.0
DDAJDNLD_711.00.01.0
DDAJDNLD_720.01.00.0
DDAJDNLD_730.01.00.0
DDAJDNLD_740.01.00.0
DDAJDNLD_750.01.00.0
DDAJDNLD_760.01.00.0
DDAJDNLD_770.01.00.0
DDAJDNLD_780.01.00.0
DDAJDNLD_790.01.00.0
DDAJDNLD_800.01.00.0
DDAJDNLD_810.01.00.0
DDAJDNLD_820.01.00.0
DDAJDNLD_830.01.00.0
DDAJDNLD_840.01.00.0
DDAJDNLD_851.00.01.0
DDAJDNLD_860.01.00.0
DDAJDNLD_870.01.00.0
DDAJDNLD_880.01.00.0
DDAJDNLD_890.01.00.0
DDAJDNLD_901.00.01.0
DDAJDNLD_911.00.01.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
DDAJDNLD_17281827317FalseMyoviridaeVOG0198,

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements