Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
2002.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
AHOGLHNO_100173891175816tet(Q)ARO:3000191tet(Q)96.4197.56Z21523.1
AHOGLHNO_622069021592CepA-44ARO:3006225CepA-4499.33100.00NG_050386.1

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
AHOGLHNO_622069021592cepAUnknown Beta-lactam99.89100.00U05887
AHOGLHNO_100173891175816tet(Q)Doxycycline, Tetracycline, Minocycline99.84100.00L33696

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
AHOGLHNO_622069021589cepACepA family extended-spectrum class A beta-lactamaseBLASTX99.67100.00WP_005816369.1
AHOGLHNO_100173891175813tet(Q)tetracycline resistance ribosomal protection protein Tet(Q)BLASTX99.53100.00WP_063856407.1

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
AHOGLHNO_110.01.00.0
AHOGLHNO_220.01.00.0
AHOGLHNO_320.01.00.0
AHOGLHNO_430.01.00.0
AHOGLHNO_510.01.00.0
AHOGLHNO_520.01.00.0
AHOGLHNO_530.01.00.0
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AHOGLHNO_550.01.00.0
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AHOGLHNO_1011.00.01.0
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AHOGLHNO_1100.01.00.0
AHOGLHNO_1110.01.00.0
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AHOGLHNO_1171.00.01.0
AHOGLHNO_1181.00.01.0
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AHOGLHNO_1201.00.01.0
AHOGLHNO_1211.00.01.0
AHOGLHNO_1220.01.00.0
AHOGLHNO_1231.00.01.0
AHOGLHNO_1241.00.01.0
AHOGLHNO_1251.00.01.0
AHOGLHNO_1330.01.00.0
AHOGLHNO_1440.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
AHOGLHNO_11150270157722FalseUnknownVOG0982,
AHOGLHNO_57352378365456FalseSiphoviridaeVOG11071,

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements