Probiotic potential risk score
| ARGs | VFs | PGs | PPRS |
|---|---|---|---|
| 5 | 0 | 0 | 5.00 |
PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).
Antibiotic resistance genes
Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)
| Query ID | Begin | End | ARO name | ARO accession | CARD name | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| JMHEIALN_47 | 22645 | 23535 | CblA-1 | ARO:3002999 | CblA-1 | 99.32 | 100.00 | GQ343019.1 |
| JMHEIALN_73 | 19356 | 20492 | tet(X) | ARO:3000205 | tet(X) | 99.47 | 97.42 | M37699.1 |
| JMHEIALN_73 | 18018 | 19157 | tet(X1) | ARO:3005166 | tet(X1) | 99.72 | 105.57 | AJ311171.1 |
| JMHEIALN_29 | 136 | 999 | aadS | ARO:3004683 | aadS | 100.00 | 100.00 | M72415.1 |
RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)
ResFinder
| Query ID | Begin | End | Resistance gene | Phenotype | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| JMHEIALN_85 | 97 | 749 | erm(F) | Erythromycin, Lincomycin, Clindamycin, Quinupristin, Pristinamycin IA, Virginiamycin S | 99.85 | 81.52 | M17808 |
| JMHEIALN_73 | 19326 | 20492 | tet(X) | Doxycycline, Tetracycline, Minocycline, Tigecycline | 99.83 | 100.00 | M37699 |
ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)
AMRFinderPlus
| Query ID | Begin | End | Gene symbol | Sequence name | Method | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| JMHEIALN_29 | 139 | 999 | aadS | aminoglycoside 6-adenylyltransferase AadS | EXACTX | 100.00 | 100.00 | WP_003013318.1 |
| JMHEIALN_73 | 19326 | 20489 | tet(X2) | tetracycline-inactivating monooxygenase Tet(X2) | EXACTX | 100.00 | 100.00 | WP_008651082.1 |
| JMHEIALN_73 | 18018 | 19154 | tet(X1) | tetracycline-inactivating monooxygenase Tet(X1) | BLASTX | 99.74 | 100.00 | WP_204376222.1 |
| JMHEIALN_85 | 99 | 746 | erm(F) | 23S rRNA (adenine(2058)-N(6))-methyltransferase Erm(F) | PARTIALX | 99.54 | 81.20 | WP_002682030.1 |
| JMHEIALN_47 | 22645 | 23532 | cblA | CblA family class A beta-lactamase | BLASTX | 99.32 | 100.00 | WP_005827792.1 |
AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)
Virulence factors
Virulence Factor Database (VFDB)
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | VF name | VF category | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | |||||||||
BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)
VirulenceFinder
| Query ID | Begin | End | Database | Virulence factor | Protein function | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)
Pathogenic genes
PHI-base
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | Function | Identity | Coverage | Gene ID |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)
Plasmid
PlasmidFinder
| Query ID | Begin | End | Plasmid | Query / Template | Identity | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||
PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)
PlasmidHunter
| Query ID | Prediction | Chromosome | Plasmid |
|---|---|---|---|
| JMHEIALN_1 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_2 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_3 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_4 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_5 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_6 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_7 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_8 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_9 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_10 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_11 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_12 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_13 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_14 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_15 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_16 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_17 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_18 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_19 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_20 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_21 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_22 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_23 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_24 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_25 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_26 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_27 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_28 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_29 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_30 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_31 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_32 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_33 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_34 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_35 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_36 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_37 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_38 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_39 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_40 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_41 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_42 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_43 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_44 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_45 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_46 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_47 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_48 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_49 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_50 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_51 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_52 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_53 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_54 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_55 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_57 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_58 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_59 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_60 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_61 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_62 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_63 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_64 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_65 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_66 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_67 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_68 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_69 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_70 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_71 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_72 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_73 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_74 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_75 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_76 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_77 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_78 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_79 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_80 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_81 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_82 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_83 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_84 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_85 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_86 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_87 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_88 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_89 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_90 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_91 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_92 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_93 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_94 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_95 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_96 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_97 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_98 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_99 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_100 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_101 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_102 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_103 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_104 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_105 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_106 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_107 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_108 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_109 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_110 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_111 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_112 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_114 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_115 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_116 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_117 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_118 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_119 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_120 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_121 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_122 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_123 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_124 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_125 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_126 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_127 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_128 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_129 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_130 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_131 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_132 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_133 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_134 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_135 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_136 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_137 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_138 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_139 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_140 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_141 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_142 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_143 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_144 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_145 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_147 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_148 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_149 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_150 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_151 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_152 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_153 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_154 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_155 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_156 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_157 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_158 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_159 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_160 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_161 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_162 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_163 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_164 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_165 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_166 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_167 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_168 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_169 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_170 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_171 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_172 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_173 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_174 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_175 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_176 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_177 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_179 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_180 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_181 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_182 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_183 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_184 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_185 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_186 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_187 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_188 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_189 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_190 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_191 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_192 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_193 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_194 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_195 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_196 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_197 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_198 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_199 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_200 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_201 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_202 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| JMHEIALN_203 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_204 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| JMHEIALN_205 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)
Prophage
Phigaro
| Query ID | Begin | End | Transposable | Taxonomy | pVOGs |
|---|---|---|---|---|---|
| JMHEIALN_112 | 1517 | 12093 | False | Siphoviridae | VOG0749, |
| JMHEIALN_191 | 8599 | 16845 | False | Siphoviridae | VOG4581, |
Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)