Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0101.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
CBMKFIEI_83542165etpB0.0EtpAAdherence99.34100.00WP_000260524

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
CBMKFIEI_83542165virulence_ecolietpB EtpB Nonfimbrial adhesin/TPS transporter100.0100.00LR882976

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
CBMKFIEI_11.00.01.0
CBMKFIEI_20.01.00.0
CBMKFIEI_30.01.00.0
CBMKFIEI_40.01.00.0
CBMKFIEI_50.01.00.0
CBMKFIEI_60.01.00.0
CBMKFIEI_70.01.00.0
CBMKFIEI_81.00.01.0
CBMKFIEI_90.01.00.0
CBMKFIEI_100.01.00.0
CBMKFIEI_110.01.00.0
CBMKFIEI_120.01.00.0
CBMKFIEI_130.01.00.0
CBMKFIEI_140.01.00.0
CBMKFIEI_150.01.00.0
CBMKFIEI_161.00.01.0
CBMKFIEI_170.01.00.0
CBMKFIEI_180.01.00.0
CBMKFIEI_190.01.00.0
CBMKFIEI_200.01.00.0
CBMKFIEI_210.01.00.0
CBMKFIEI_220.01.00.0
CBMKFIEI_230.01.00.0
CBMKFIEI_241.00.01.0
CBMKFIEI_251.00.01.0
CBMKFIEI_260.01.00.0
CBMKFIEI_270.01.00.0
CBMKFIEI_281.00.01.0
CBMKFIEI_290.01.00.0
CBMKFIEI_300.01.00.0
CBMKFIEI_311.00.01.0
CBMKFIEI_320.01.00.0
CBMKFIEI_331.00.01.0
CBMKFIEI_340.01.00.0
CBMKFIEI_350.01.00.0
CBMKFIEI_361.00.01.0
CBMKFIEI_370.01.00.0
CBMKFIEI_380.01.00.0
CBMKFIEI_390.01.00.0
CBMKFIEI_400.01.00.0
CBMKFIEI_411.00.01.0
CBMKFIEI_420.01.00.0
CBMKFIEI_430.01.00.0
CBMKFIEI_440.01.00.0
CBMKFIEI_450.01.00.0
CBMKFIEI_460.01.00.0
CBMKFIEI_470.01.00.0
CBMKFIEI_480.01.00.0
CBMKFIEI_491.00.01.0
CBMKFIEI_500.01.00.0
CBMKFIEI_510.01.00.0
CBMKFIEI_520.01.00.0
CBMKFIEI_530.01.00.0
CBMKFIEI_541.00.01.0
CBMKFIEI_551.00.01.0
CBMKFIEI_560.01.00.0
CBMKFIEI_570.01.00.0
CBMKFIEI_580.01.00.0
CBMKFIEI_590.01.00.0
CBMKFIEI_600.01.00.0
CBMKFIEI_610.01.00.0
CBMKFIEI_620.01.00.0
CBMKFIEI_630.01.00.0
CBMKFIEI_640.01.00.0
CBMKFIEI_650.01.00.0
CBMKFIEI_660.01.00.0
CBMKFIEI_670.01.00.0
CBMKFIEI_680.01.00.0
CBMKFIEI_690.01.00.0
CBMKFIEI_700.01.00.0
CBMKFIEI_711.00.01.0
CBMKFIEI_720.01.00.0
CBMKFIEI_730.01.00.0
CBMKFIEI_740.01.00.0
CBMKFIEI_750.01.00.0
CBMKFIEI_761.00.01.0
CBMKFIEI_770.01.00.0
CBMKFIEI_780.01.00.0
CBMKFIEI_790.01.00.0
CBMKFIEI_800.01.00.0
CBMKFIEI_810.01.00.0
CBMKFIEI_820.01.00.0
CBMKFIEI_830.01.00.0
CBMKFIEI_840.01.00.0
CBMKFIEI_850.01.00.0
CBMKFIEI_860.01.00.0
CBMKFIEI_870.01.00.0
CBMKFIEI_880.01.00.0
CBMKFIEI_891.00.01.0
CBMKFIEI_900.01.00.0
CBMKFIEI_911.00.01.0
CBMKFIEI_920.01.00.0
CBMKFIEI_930.01.00.0
CBMKFIEI_940.01.00.0
CBMKFIEI_950.01.00.0
CBMKFIEI_960.01.00.0
CBMKFIEI_970.01.00.0
CBMKFIEI_980.01.00.0
CBMKFIEI_990.01.00.0
CBMKFIEI_1000.01.00.0
CBMKFIEI_1010.01.00.0
CBMKFIEI_1020.01.00.0
CBMKFIEI_1030.01.00.0
CBMKFIEI_1040.01.00.0
CBMKFIEI_1050.01.00.0
CBMKFIEI_1060.01.00.0
CBMKFIEI_1070.01.00.0
CBMKFIEI_1080.01.00.0
CBMKFIEI_1090.01.00.0
CBMKFIEI_1100.01.00.0
CBMKFIEI_1111.00.01.0
CBMKFIEI_1121.00.01.0
CBMKFIEI_1130.01.00.0
CBMKFIEI_1140.01.00.0
CBMKFIEI_1160.01.00.0
CBMKFIEI_1170.01.00.0
CBMKFIEI_1181.00.01.0
CBMKFIEI_1191.00.01.0
CBMKFIEI_1200.01.00.0
CBMKFIEI_1210.01.00.0
CBMKFIEI_1220.01.00.0
CBMKFIEI_1230.01.00.0
CBMKFIEI_1240.01.00.0
CBMKFIEI_1260.01.00.0
CBMKFIEI_1270.01.00.0
CBMKFIEI_1280.01.00.0
CBMKFIEI_1290.01.00.0
CBMKFIEI_1300.01.00.0
CBMKFIEI_1311.00.01.0
CBMKFIEI_1320.01.00.0
CBMKFIEI_1330.01.00.0
CBMKFIEI_1340.01.00.0
CBMKFIEI_1350.01.00.0
CBMKFIEI_1360.01.00.0
CBMKFIEI_1370.01.00.0
CBMKFIEI_1381.00.01.0
CBMKFIEI_1400.01.00.0
CBMKFIEI_1410.01.00.0
CBMKFIEI_1420.01.00.0
CBMKFIEI_1431.00.01.0
CBMKFIEI_1441.00.01.0
CBMKFIEI_1450.01.00.0
CBMKFIEI_1460.01.00.0
CBMKFIEI_1470.01.00.0
CBMKFIEI_1480.01.00.0
CBMKFIEI_1490.01.00.0
CBMKFIEI_1501.00.01.0
CBMKFIEI_1510.01.00.0
CBMKFIEI_1520.01.00.0
CBMKFIEI_1530.01.00.0
CBMKFIEI_1541.00.01.0
CBMKFIEI_1550.01.00.0
CBMKFIEI_1561.00.01.0
CBMKFIEI_1571.00.01.0
CBMKFIEI_1580.01.00.0
CBMKFIEI_1591.00.01.0
CBMKFIEI_1601.00.01.0
CBMKFIEI_1611.00.01.0
CBMKFIEI_1620.01.00.0
CBMKFIEI_1630.01.00.0
CBMKFIEI_1640.01.00.0
CBMKFIEI_1650.01.00.0
CBMKFIEI_1661.00.01.0
CBMKFIEI_1670.01.00.0
CBMKFIEI_1680.01.00.0
CBMKFIEI_1690.01.00.0
CBMKFIEI_1700.01.00.0
CBMKFIEI_1711.00.01.0
CBMKFIEI_1720.01.00.0
CBMKFIEI_1731.00.01.0
CBMKFIEI_1740.01.00.0
CBMKFIEI_1750.01.00.0
CBMKFIEI_1761.00.01.0
CBMKFIEI_1771.00.01.0
CBMKFIEI_1780.01.00.0
CBMKFIEI_1790.01.00.0
CBMKFIEI_1800.01.00.0
CBMKFIEI_1811.00.01.0
CBMKFIEI_1821.00.01.0
CBMKFIEI_1830.01.00.0
CBMKFIEI_1841.00.01.0
CBMKFIEI_1850.01.00.0
CBMKFIEI_1860.01.00.0
CBMKFIEI_1871.00.01.0
CBMKFIEI_1881.00.01.0
CBMKFIEI_1891.00.01.0
CBMKFIEI_1910.01.00.0
CBMKFIEI_1921.00.01.0
CBMKFIEI_1930.01.00.0
CBMKFIEI_1940.01.00.0
CBMKFIEI_1950.01.00.0
CBMKFIEI_1961.00.01.0
CBMKFIEI_1970.01.00.0
CBMKFIEI_1981.00.01.0
CBMKFIEI_1990.01.00.0
CBMKFIEI_2000.01.00.0
CBMKFIEI_2011.00.01.0
CBMKFIEI_2021.00.01.0
CBMKFIEI_2030.01.00.0
CBMKFIEI_2041.00.01.0
CBMKFIEI_2050.01.00.0
CBMKFIEI_2060.01.00.0
CBMKFIEI_2070.01.00.0
CBMKFIEI_2080.01.00.0
CBMKFIEI_2090.01.00.0
CBMKFIEI_2101.00.01.0
CBMKFIEI_2111.00.01.0
CBMKFIEI_2120.01.00.0
CBMKFIEI_2130.01.00.0
CBMKFIEI_2141.00.01.0
CBMKFIEI_2151.00.01.0
CBMKFIEI_2160.01.00.0
CBMKFIEI_2170.01.00.0
CBMKFIEI_2180.01.00.0
CBMKFIEI_2191.00.01.0
CBMKFIEI_2201.00.01.0
CBMKFIEI_2231.00.01.0
CBMKFIEI_2241.00.01.0
CBMKFIEI_2250.01.00.0
CBMKFIEI_2271.00.01.0
CBMKFIEI_2280.01.00.0
CBMKFIEI_2301.00.01.0
CBMKFIEI_2310.01.00.0
CBMKFIEI_2320.01.00.0
CBMKFIEI_2331.00.01.0
CBMKFIEI_2341.00.01.0
CBMKFIEI_2350.01.00.0
CBMKFIEI_2361.00.01.0
CBMKFIEI_2371.00.01.0
CBMKFIEI_2381.00.01.0
CBMKFIEI_2391.00.01.0
CBMKFIEI_2400.01.00.0
CBMKFIEI_2411.00.01.0
CBMKFIEI_2420.01.00.0
CBMKFIEI_2430.01.00.0
CBMKFIEI_2440.01.00.0
CBMKFIEI_2450.01.00.0
CBMKFIEI_2461.00.01.0
CBMKFIEI_2470.01.00.0
CBMKFIEI_2481.00.01.0
CBMKFIEI_2490.01.00.0
CBMKFIEI_2500.01.00.0
CBMKFIEI_2510.01.00.0
CBMKFIEI_2520.01.00.0
CBMKFIEI_2531.00.01.0
CBMKFIEI_2541.00.01.0
CBMKFIEI_2550.01.00.0
CBMKFIEI_2561.00.01.0
CBMKFIEI_2570.01.00.0
CBMKFIEI_2580.01.00.0
CBMKFIEI_2590.01.00.0
CBMKFIEI_2601.00.01.0
CBMKFIEI_2610.01.00.0
CBMKFIEI_2621.00.01.0
CBMKFIEI_2640.01.00.0
CBMKFIEI_2650.01.00.0
CBMKFIEI_2660.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
No hit found

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements