Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
1001.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
MDILJFEF_133011203cepAARO:3003559cepA99.67100.00U05883.1

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
MDILJFEF_133011203cepAUnknown Beta-lactam99.78100.00L13472

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
MDILJFEF_133011200cepACepA family extended-spectrum class A beta-lactamaseBLASTX99.67100.00WP_005795628.1

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
MDILJFEF_10.01.00.0
MDILJFEF_20.01.00.0
MDILJFEF_30.01.00.0
MDILJFEF_40.01.00.0
MDILJFEF_50.01.00.0
MDILJFEF_60.01.00.0
MDILJFEF_70.01.00.0
MDILJFEF_80.01.00.0
MDILJFEF_90.01.00.0
MDILJFEF_100.01.00.0
MDILJFEF_110.01.00.0
MDILJFEF_120.01.00.0
MDILJFEF_130.01.00.0
MDILJFEF_140.01.00.0
MDILJFEF_151.00.01.0
MDILJFEF_160.01.00.0
MDILJFEF_171.00.01.0
MDILJFEF_180.01.00.0
MDILJFEF_191.00.01.0
MDILJFEF_200.01.00.0
MDILJFEF_210.01.00.0
MDILJFEF_220.01.00.0
MDILJFEF_230.01.00.0
MDILJFEF_240.01.00.0
MDILJFEF_251.00.01.0
MDILJFEF_260.01.00.0
MDILJFEF_271.00.01.0
MDILJFEF_280.01.00.0
MDILJFEF_290.01.00.0
MDILJFEF_301.00.01.0
MDILJFEF_311.00.01.0
MDILJFEF_321.00.01.0
MDILJFEF_331.00.01.0
MDILJFEF_340.01.00.0
MDILJFEF_351.00.01.0
MDILJFEF_360.01.00.0
MDILJFEF_370.01.00.0
MDILJFEF_380.01.00.0
MDILJFEF_390.01.00.0
MDILJFEF_400.01.00.0
MDILJFEF_410.01.00.0
MDILJFEF_420.01.00.0
MDILJFEF_430.01.00.0
MDILJFEF_440.01.00.0
MDILJFEF_451.00.01.0
MDILJFEF_460.01.00.0
MDILJFEF_471.00.01.0
MDILJFEF_480.01.00.0
MDILJFEF_490.01.00.0
MDILJFEF_500.01.00.0
MDILJFEF_510.01.00.0
MDILJFEF_520.01.00.0
MDILJFEF_530.01.00.0
MDILJFEF_540.01.00.0
MDILJFEF_551.00.01.0
MDILJFEF_560.01.00.0
MDILJFEF_570.01.00.0
MDILJFEF_580.01.00.0
MDILJFEF_591.00.01.0
MDILJFEF_600.01.00.0
MDILJFEF_610.01.00.0
MDILJFEF_620.01.00.0
MDILJFEF_630.01.00.0
MDILJFEF_640.01.00.0
MDILJFEF_651.00.01.0
MDILJFEF_660.01.00.0
MDILJFEF_670.01.00.0
MDILJFEF_680.01.00.0
MDILJFEF_690.01.00.0
MDILJFEF_700.01.00.0
MDILJFEF_710.01.00.0
MDILJFEF_720.01.00.0
MDILJFEF_730.01.00.0
MDILJFEF_740.01.00.0
MDILJFEF_750.01.00.0
MDILJFEF_760.01.00.0
MDILJFEF_770.01.00.0
MDILJFEF_781.00.01.0
MDILJFEF_790.01.00.0
MDILJFEF_800.01.00.0
MDILJFEF_810.01.00.0
MDILJFEF_820.01.00.0
MDILJFEF_831.00.01.0
MDILJFEF_840.01.00.0
MDILJFEF_850.01.00.0
MDILJFEF_860.01.00.0
MDILJFEF_870.01.00.0
MDILJFEF_880.01.00.0
MDILJFEF_890.01.00.0
MDILJFEF_900.01.00.0
MDILJFEF_910.01.00.0
MDILJFEF_920.01.00.0
MDILJFEF_931.00.01.0
MDILJFEF_940.01.00.0
MDILJFEF_951.00.01.0
MDILJFEF_960.01.00.0
MDILJFEF_970.01.00.0
MDILJFEF_980.01.00.0
MDILJFEF_991.00.01.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
No hit found

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements