Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
1001.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
DLMJIIAF_111145610146347ErmBARO:3000375ErmB98.7898.79AF242872.1

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
DLMJIIAF_111145610146347erm(B)Erythromycin, Lincomycin, Clindamycin, Quinupristin, Pristinamycin IA, Virginiamycin S100.00100.00U18931

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
DLMJIIAF_111145613146347erm(B)23S rRNA (adenine(2058)-N(6))-methyltransferase Erm(B)EXACTX100.00100.00WP_002292226.1

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
DLMJIIAF_10.01.00.0
DLMJIIAF_20.01.00.0
DLMJIIAF_130.01.00.0
DLMJIIAF_240.01.00.0
DLMJIIAF_350.01.00.0
DLMJIIAF_460.01.00.0
DLMJIIAF_570.01.00.0
DLMJIIAF_680.01.00.0
DLMJIIAF_790.01.00.0
DLMJIIAF_890.01.00.0
DLMJIIAF_1000.01.00.0
DLMJIIAF_1110.01.00.0
DLMJIIAF_1120.01.00.0
DLMJIIAF_1230.01.00.0
DLMJIIAF_1340.01.00.0
DLMJIIAF_1450.01.00.0
DLMJIIAF_1560.01.00.0
DLMJIIAF_1670.01.00.0
DLMJIIAF_1780.01.00.0
DLMJIIAF_1890.01.00.0
DLMJIIAF_2000.01.00.0
DLMJIIAF_2110.01.00.0
DLMJIIAF_2220.01.00.0
DLMJIIAF_2230.01.00.0
DLMJIIAF_2340.01.00.0
DLMJIIAF_2440.01.00.0
DLMJIIAF_2551.00.01.0
DLMJIIAF_2660.01.00.0
DLMJIIAF_2770.01.00.0
DLMJIIAF_2880.01.00.0
DLMJIIAF_2990.01.00.0
DLMJIIAF_3101.00.01.0
DLMJIIAF_3210.01.00.0
DLMJIIAF_3320.01.00.0
DLMJIIAF_3331.00.01.0
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DLMJIIAF_3650.01.00.0
DLMJIIAF_3760.01.00.0
DLMJIIAF_3871.00.01.0
DLMJIIAF_3980.01.00.0
DLMJIIAF_4091.00.01.0
DLMJIIAF_4200.01.00.0
DLMJIIAF_4310.01.00.0
DLMJIIAF_4420.01.00.0
DLMJIIAF_4430.01.00.0
DLMJIIAF_4530.01.00.0
DLMJIIAF_4640.01.00.0
DLMJIIAF_4751.00.01.0
DLMJIIAF_4861.00.01.0
DLMJIIAF_4971.00.01.0
DLMJIIAF_5080.01.00.0
DLMJIIAF_5300.01.00.0
DLMJIIAF_5520.01.00.0
DLMJIIAF_5531.00.01.0
DLMJIIAF_6600.01.00.0
DLMJIIAF_6710.01.00.0
DLMJIIAF_6820.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
DLMJIIAF_1417027473707TrueMyoviridaeVOG0275,
DLMJIIAF_571123434238TrueUnknownVOG4972,
DLMJIIAF_111142692152280FalseSiphoviridaeVOG0090,

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements