Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0022.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
KIINLOME_276332562621WalR1.63e-112transcriptional regulatory protein83.40100.00EPH95667
KIINLOME_472922029023CspR6.56e-34cold shock protein89.39100.00AAO82613

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
KIINLOME_31.00.01.0
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KIINLOME_1790.01.00.0
KIINLOME_1820.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
KIINLOME_27129260140009FalseSiphoviridaeVOG1581, VOG4632, VOG4606, VOG0205, VOG4841, VOG4581, VOG4544, VOG5051, VOG4556, VOG4568, VOG0204
KIINLOME_3985510583FalseSiphoviridaeVOG4609, VOG4632, VOG6545, VOG0322, VOG4548, VOG0321, VOG4967, VOG6450, VOG10867, VOG0181, VOG10059, VOG8520, VOG0862
KIINLOME_4710108739FalseSiphoviridaeVOG4693, VOG6623, VOG9860, VOG11003, VOG8987, VOG1638, VOG6238, VOG4566, VOG0186, VOG1309, VOG8241, VOG1305, VOG6495
KIINLOME_561927426065FalseSiphoviridaeVOG4602, VOG6495, VOG5353, VOG4552, VOG0181, VOG10867, VOG4600, VOG1309, VOG11003
KIINLOME_6198022397FalseSiphoviridaeVOG7888, VOG7896, VOG6455, VOG4599, VOG4605, VOG0800, VOG0725, VOG0799, VOG0724, VOG5660, VOG0723, VOG4713, VOG1322, VOG1887, VOG3434, VOG4555, VOG4564, VOG0720, VOG4544, VOG0796, VOG4549

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements