Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0022.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
HEJMEPDI_66159446160150WalR1.63e-112transcriptional regulatory protein83.40100.00EPH95667
HEJMEPDI_92922029023CspR6.56e-34cold shock protein89.39100.00AAO82613

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
HEJMEPDI_61.00.01.0
HEJMEPDI_90.01.00.0
HEJMEPDI_160.01.00.0
HEJMEPDI_220.01.00.0
HEJMEPDI_260.01.00.0
HEJMEPDI_271.00.01.0
HEJMEPDI_281.00.01.0
HEJMEPDI_290.01.00.0
HEJMEPDI_300.01.00.0
HEJMEPDI_310.01.00.0
HEJMEPDI_321.00.01.0
HEJMEPDI_330.01.00.0
HEJMEPDI_340.01.00.0
HEJMEPDI_350.01.00.0
HEJMEPDI_361.00.01.0
HEJMEPDI_371.00.01.0
HEJMEPDI_380.01.00.0
HEJMEPDI_390.01.00.0
HEJMEPDI_401.00.01.0
HEJMEPDI_410.01.00.0
HEJMEPDI_420.01.00.0
HEJMEPDI_430.01.00.0
HEJMEPDI_441.00.01.0
HEJMEPDI_450.01.00.0
HEJMEPDI_460.01.00.0
HEJMEPDI_470.01.00.0
HEJMEPDI_480.01.00.0
HEJMEPDI_490.01.00.0
HEJMEPDI_501.00.01.0
HEJMEPDI_510.01.00.0
HEJMEPDI_530.01.00.0
HEJMEPDI_540.01.00.0
HEJMEPDI_551.00.01.0
HEJMEPDI_560.01.00.0
HEJMEPDI_570.01.00.0
HEJMEPDI_580.01.00.0
HEJMEPDI_591.00.01.0
HEJMEPDI_620.01.00.0
HEJMEPDI_631.00.01.0
HEJMEPDI_641.00.01.0
HEJMEPDI_650.01.00.0
HEJMEPDI_660.01.00.0
HEJMEPDI_670.01.00.0
HEJMEPDI_681.00.01.0
HEJMEPDI_691.00.01.0
HEJMEPDI_700.01.00.0
HEJMEPDI_720.01.00.0
HEJMEPDI_730.01.00.0
HEJMEPDI_750.01.00.0
HEJMEPDI_770.01.00.0
HEJMEPDI_781.00.01.0
HEJMEPDI_791.00.01.0
HEJMEPDI_801.00.01.0
HEJMEPDI_810.01.00.0
HEJMEPDI_821.00.01.0
HEJMEPDI_850.01.00.0
HEJMEPDI_871.00.01.0
HEJMEPDI_890.01.00.0
HEJMEPDI_900.01.00.0
HEJMEPDI_910.01.00.0
HEJMEPDI_921.00.01.0
HEJMEPDI_931.00.01.0
HEJMEPDI_951.00.01.0
HEJMEPDI_971.00.01.0
HEJMEPDI_1160.01.00.0
HEJMEPDI_1180.01.00.0
HEJMEPDI_1191.00.01.0
HEJMEPDI_1200.01.00.0
HEJMEPDI_1211.00.01.0
HEJMEPDI_1221.00.01.0
HEJMEPDI_1230.01.00.0
HEJMEPDI_1260.01.00.0
HEJMEPDI_1271.00.01.0
HEJMEPDI_1280.01.00.0
HEJMEPDI_1290.01.00.0
HEJMEPDI_1301.00.01.0
HEJMEPDI_1310.01.00.0
HEJMEPDI_1370.01.00.0
HEJMEPDI_1390.01.00.0
HEJMEPDI_1431.00.01.0
HEJMEPDI_1470.01.00.0
HEJMEPDI_1481.00.01.0
HEJMEPDI_1491.00.01.0
HEJMEPDI_1530.01.00.0
HEJMEPDI_1561.00.01.0
HEJMEPDI_1570.01.00.0
HEJMEPDI_1601.00.01.0
HEJMEPDI_1630.01.00.0
HEJMEPDI_1650.01.00.0
HEJMEPDI_1661.00.01.0
HEJMEPDI_1740.01.00.0
HEJMEPDI_1801.00.01.0
HEJMEPDI_1840.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
HEJMEPDI_910108739FalseSiphoviridaeVOG4693, VOG6623, VOG9860, VOG11003, VOG8987, VOG1638, VOG6238, VOG4566, VOG0186, VOG1309, VOG8241, VOG1305, VOG6495
HEJMEPDI_1685510583FalseSiphoviridaeVOG4609, VOG4632, VOG6545, VOG0322, VOG4548, VOG0321, VOG4967, VOG6450, VOG10867, VOG0181, VOG10059, VOG8520, VOG0862
HEJMEPDI_41155122968FalseSiphoviridaeVOG4570, VOG4549, VOG0796, VOG4544, VOG0720, VOG4564, VOG4555, VOG3434, VOG1887, VOG1322, VOG4713, VOG0723, VOG5660, VOG0724, VOG0799, VOG0725, VOG0800, VOG4605, VOG4599, VOG6455, VOG7896
HEJMEPDI_668276293511FalseSiphoviridaeVOG0204, VOG4568, VOG4556, VOG5051, VOG4544, VOG4581, VOG4841, VOG0205, VOG4606, VOG4632, VOG1581
HEJMEPDI_13113778168FalseSiphoviridaeVOG4566, VOG11003, VOG1309, VOG4600, VOG10867, VOG0181, VOG4552, VOG5353, VOG6495, VOG4602

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements