Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
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PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
DPAPDPGF_311698347541FalseMyoviridaeVOG4548, VOG4548, VOG6414, VOG0322, VOG6545, VOG4632, VOG4609, VOG11033, VOG4966, VOG4677, VOG6414, VOG0327, VOG6005, VOG0198, VOG0796, VOG1886, VOG0720, VOG4564, VOG4555, VOG4572, VOG4623, VOG3888, VOG1900, VOG4870, VOG5612, VOG3890, VOG3891, VOG3892, VOG5793, VOG4865, VOG4885, VOG3894, VOG4550, VOG4691, VOG4862, VOG5763, VOG9945, VOG4705, VOG0861, VOG7017, VOG10045, VOG0703, VOG4910, VOG9573, VOG3808, VOG0058, VOG8937

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements