Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0011.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
DBDHBBOL_11410561253CspA4.48e-30cold shock protein84.85100.00CAA62903
DBDHBBOL_11410561250CspR1.33e-29cold shock protein86.1598.48AAO82613

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
DBDHBBOL_10.01.00.0
DBDHBBOL_20.01.00.0
DBDHBBOL_30.01.00.0
DBDHBBOL_40.01.00.0
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DBDHBBOL_60.01.00.0
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DBDHBBOL_81.00.01.0
DBDHBBOL_90.01.00.0
DBDHBBOL_101.00.01.0
DBDHBBOL_110.01.00.0
DBDHBBOL_120.01.00.0
DBDHBBOL_130.01.00.0
DBDHBBOL_140.01.00.0
DBDHBBOL_150.01.00.0
DBDHBBOL_160.01.00.0
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DBDHBBOL_1410.01.00.0
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DBDHBBOL_1510.01.00.0
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DBDHBBOL_1610.01.00.0
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DBDHBBOL_1701.00.01.0
DBDHBBOL_1710.01.00.0
DBDHBBOL_1720.01.00.0
DBDHBBOL_1730.01.00.0
DBDHBBOL_1740.01.00.0
DBDHBBOL_1751.00.01.0
DBDHBBOL_1760.01.00.0
DBDHBBOL_1770.01.00.0
DBDHBBOL_1780.01.00.0
DBDHBBOL_1800.01.00.0
DBDHBBOL_1810.01.00.0
DBDHBBOL_1820.01.00.0
DBDHBBOL_1830.01.00.0
DBDHBBOL_1840.01.00.0
DBDHBBOL_1861.00.01.0
DBDHBBOL_1870.01.00.0
DBDHBBOL_1880.01.00.0
DBDHBBOL_1890.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
DBDHBBOL_131355127343FalseSiphoviridaeVOG1637, VOG10223, VOG4856, VOG9997, VOG10972, VOG3462, VOG0801, VOG8263, VOG6698, VOG4586, VOG0207, VOG0205, VOG0204, VOG4553, VOG4573, VOG4556
DBDHBBOL_153623116175FalseMyoviridaeVOG0226, VOG0205, VOG0384, VOG0382, VOG0083, VOG5235
DBDHBBOL_170437717742FalseSiphoviridaeVOG3705, VOG5494, VOG4821, VOG0862, VOG8520, VOG5353, VOG6450, VOG2228, VOG4552, VOG2228, VOG2228, VOG6135, VOG0535, VOG0283, VOG0226, VOG0514, VOG4566, VOG0189, VOG8685, VOG4693

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements