Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0011.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
NBAAGDBM_851033910142CspR1.22e-29cold shock protein81.82100.00AAO82613
NBAAGDBM_851033910142CspA2.27e-29cold shock protein80.30100.00CAA62903

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
NBAAGDBM_10.01.00.0
NBAAGDBM_30.01.00.0
NBAAGDBM_40.01.00.0
NBAAGDBM_60.01.00.0
NBAAGDBM_81.00.01.0
NBAAGDBM_90.01.00.0
NBAAGDBM_131.00.01.0
NBAAGDBM_140.01.00.0
NBAAGDBM_150.01.00.0
NBAAGDBM_160.01.00.0
NBAAGDBM_170.01.00.0
NBAAGDBM_191.00.01.0
NBAAGDBM_200.01.00.0
NBAAGDBM_210.01.00.0
NBAAGDBM_220.01.00.0
NBAAGDBM_230.01.00.0
NBAAGDBM_240.01.00.0
NBAAGDBM_260.01.00.0
NBAAGDBM_270.01.00.0
NBAAGDBM_280.01.00.0
NBAAGDBM_290.01.00.0
NBAAGDBM_310.01.00.0
NBAAGDBM_320.01.00.0
NBAAGDBM_330.01.00.0
NBAAGDBM_350.01.00.0
NBAAGDBM_360.01.00.0
NBAAGDBM_370.01.00.0
NBAAGDBM_380.01.00.0
NBAAGDBM_390.01.00.0
NBAAGDBM_400.01.00.0
NBAAGDBM_410.01.00.0
NBAAGDBM_431.00.01.0
NBAAGDBM_441.00.01.0
NBAAGDBM_450.01.00.0
NBAAGDBM_460.01.00.0
NBAAGDBM_470.01.00.0
NBAAGDBM_480.01.00.0
NBAAGDBM_500.01.00.0
NBAAGDBM_510.01.00.0
NBAAGDBM_521.00.01.0
NBAAGDBM_530.01.00.0
NBAAGDBM_561.00.01.0
NBAAGDBM_570.01.00.0
NBAAGDBM_580.01.00.0
NBAAGDBM_590.01.00.0
NBAAGDBM_600.01.00.0
NBAAGDBM_610.01.00.0
NBAAGDBM_620.01.00.0
NBAAGDBM_641.00.01.0
NBAAGDBM_650.01.00.0
NBAAGDBM_660.01.00.0
NBAAGDBM_670.01.00.0
NBAAGDBM_680.01.00.0
NBAAGDBM_690.01.00.0
NBAAGDBM_700.01.00.0
NBAAGDBM_711.00.01.0
NBAAGDBM_720.01.00.0
NBAAGDBM_730.01.00.0
NBAAGDBM_740.01.00.0
NBAAGDBM_750.01.00.0
NBAAGDBM_760.01.00.0
NBAAGDBM_770.01.00.0
NBAAGDBM_790.01.00.0
NBAAGDBM_800.01.00.0
NBAAGDBM_811.00.01.0
NBAAGDBM_820.01.00.0
NBAAGDBM_831.00.01.0
NBAAGDBM_840.01.00.0
NBAAGDBM_850.01.00.0
NBAAGDBM_860.01.00.0
NBAAGDBM_880.01.00.0
NBAAGDBM_891.00.01.0
NBAAGDBM_900.01.00.0
NBAAGDBM_910.01.00.0
NBAAGDBM_920.01.00.0
NBAAGDBM_940.01.00.0
NBAAGDBM_951.00.01.0
NBAAGDBM_960.01.00.0
NBAAGDBM_970.01.00.0
NBAAGDBM_981.00.01.0
NBAAGDBM_990.01.00.0
NBAAGDBM_1000.01.00.0
NBAAGDBM_1010.01.00.0
NBAAGDBM_1031.00.01.0
NBAAGDBM_1050.01.00.0
NBAAGDBM_1061.00.01.0
NBAAGDBM_1070.01.00.0
NBAAGDBM_1081.00.01.0
NBAAGDBM_1090.01.00.0
NBAAGDBM_1100.01.00.0
NBAAGDBM_1110.01.00.0
NBAAGDBM_1120.01.00.0
NBAAGDBM_1130.01.00.0
NBAAGDBM_1140.01.00.0
NBAAGDBM_1150.01.00.0
NBAAGDBM_1160.01.00.0
NBAAGDBM_1171.00.01.0
NBAAGDBM_1180.01.00.0
NBAAGDBM_1190.01.00.0
NBAAGDBM_1201.00.01.0
NBAAGDBM_1210.01.00.0
NBAAGDBM_1221.00.01.0
NBAAGDBM_1230.01.00.0
NBAAGDBM_1240.01.00.0
NBAAGDBM_1250.01.00.0
NBAAGDBM_1260.01.00.0
NBAAGDBM_1270.01.00.0
NBAAGDBM_1281.00.01.0
NBAAGDBM_1290.01.00.0
NBAAGDBM_1300.01.00.0
NBAAGDBM_1311.00.01.0
NBAAGDBM_1320.01.00.0
NBAAGDBM_1330.01.00.0
NBAAGDBM_1341.00.01.0
NBAAGDBM_1350.01.00.0
NBAAGDBM_1370.01.00.0
NBAAGDBM_1380.01.00.0
NBAAGDBM_1390.01.00.0
NBAAGDBM_1400.01.00.0
NBAAGDBM_1410.01.00.0
NBAAGDBM_1420.01.00.0
NBAAGDBM_1431.00.01.0
NBAAGDBM_1440.01.00.0
NBAAGDBM_1450.01.00.0
NBAAGDBM_1460.01.00.0
NBAAGDBM_1470.01.00.0
NBAAGDBM_1480.01.00.0
NBAAGDBM_1501.00.01.0
NBAAGDBM_1510.01.00.0
NBAAGDBM_1520.01.00.0
NBAAGDBM_1540.01.00.0
NBAAGDBM_1570.01.00.0
NBAAGDBM_1600.01.00.0
NBAAGDBM_1610.01.00.0
NBAAGDBM_1620.01.00.0
NBAAGDBM_1641.00.01.0
NBAAGDBM_1650.01.00.0
NBAAGDBM_1670.01.00.0
NBAAGDBM_1680.01.00.0
NBAAGDBM_1690.01.00.0
NBAAGDBM_1701.00.01.0
NBAAGDBM_1710.01.00.0
NBAAGDBM_1720.01.00.0
NBAAGDBM_1741.00.01.0
NBAAGDBM_1750.01.00.0
NBAAGDBM_1760.01.00.0
NBAAGDBM_1770.01.00.0
NBAAGDBM_1780.01.00.0
NBAAGDBM_1790.01.00.0
NBAAGDBM_1820.01.00.0
NBAAGDBM_1831.00.01.0
NBAAGDBM_1840.01.00.0
NBAAGDBM_1850.01.00.0
NBAAGDBM_1860.01.00.0
NBAAGDBM_1890.01.00.0
NBAAGDBM_1900.01.00.0
NBAAGDBM_1910.01.00.0
NBAAGDBM_1921.00.01.0
NBAAGDBM_1931.00.01.0
NBAAGDBM_1941.00.01.0
NBAAGDBM_1951.00.01.0
NBAAGDBM_1961.00.01.0
NBAAGDBM_1971.00.01.0
NBAAGDBM_1980.01.00.0
NBAAGDBM_1990.01.00.0
NBAAGDBM_2000.01.00.0
NBAAGDBM_2010.01.00.0
NBAAGDBM_2031.00.01.0
NBAAGDBM_2040.01.00.0
NBAAGDBM_2050.01.00.0
NBAAGDBM_2060.01.00.0
NBAAGDBM_2080.01.00.0
NBAAGDBM_2090.01.00.0
NBAAGDBM_2100.01.00.0
NBAAGDBM_2111.00.01.0
NBAAGDBM_2120.01.00.0
NBAAGDBM_2130.01.00.0
NBAAGDBM_2141.00.01.0
NBAAGDBM_2150.01.00.0
NBAAGDBM_2161.00.01.0
NBAAGDBM_2171.00.01.0
NBAAGDBM_2181.00.01.0
NBAAGDBM_2200.01.00.0
NBAAGDBM_2210.01.00.0
NBAAGDBM_2241.00.01.0
NBAAGDBM_2250.01.00.0
NBAAGDBM_2260.01.00.0
NBAAGDBM_2270.01.00.0
NBAAGDBM_2280.01.00.0
NBAAGDBM_2290.01.00.0
NBAAGDBM_2300.01.00.0
NBAAGDBM_2311.00.01.0
NBAAGDBM_2321.00.01.0
NBAAGDBM_2330.01.00.0
NBAAGDBM_2340.01.00.0
NBAAGDBM_2350.01.00.0
NBAAGDBM_2370.01.00.0
NBAAGDBM_2381.00.01.0
NBAAGDBM_2391.00.01.0
NBAAGDBM_2400.01.00.0
NBAAGDBM_2410.01.00.0
NBAAGDBM_2420.01.00.0
NBAAGDBM_2430.01.00.0
NBAAGDBM_2451.00.01.0
NBAAGDBM_2470.01.00.0
NBAAGDBM_2481.00.01.0
NBAAGDBM_2490.01.00.0
NBAAGDBM_2510.01.00.0
NBAAGDBM_2520.01.00.0
NBAAGDBM_2530.01.00.0
NBAAGDBM_2540.01.00.0
NBAAGDBM_2561.00.01.0
NBAAGDBM_2571.00.01.0
NBAAGDBM_2580.01.00.0
NBAAGDBM_2600.01.00.0
NBAAGDBM_2610.01.00.0
NBAAGDBM_2620.01.00.0
NBAAGDBM_2680.01.00.0
NBAAGDBM_2690.01.00.0
NBAAGDBM_2710.01.00.0
NBAAGDBM_2720.01.00.0
NBAAGDBM_2730.01.00.0
NBAAGDBM_2740.01.00.0
NBAAGDBM_2750.01.00.0
NBAAGDBM_2770.01.00.0
NBAAGDBM_2780.01.00.0
NBAAGDBM_2790.01.00.0
NBAAGDBM_2810.01.00.0
NBAAGDBM_2821.00.01.0
NBAAGDBM_2830.01.00.0
NBAAGDBM_2840.01.00.0
NBAAGDBM_2850.01.00.0
NBAAGDBM_2861.00.01.0
NBAAGDBM_2870.01.00.0
NBAAGDBM_2880.01.00.0
NBAAGDBM_2911.00.01.0
NBAAGDBM_2930.01.00.0
NBAAGDBM_2940.01.00.0
NBAAGDBM_2950.01.00.0
NBAAGDBM_2970.01.00.0
NBAAGDBM_3000.01.00.0
NBAAGDBM_3030.01.00.0
NBAAGDBM_3060.01.00.0
NBAAGDBM_3091.00.01.0
NBAAGDBM_3130.01.00.0
NBAAGDBM_3170.01.00.0
NBAAGDBM_3200.01.00.0
NBAAGDBM_3220.01.00.0
NBAAGDBM_3240.01.00.0
NBAAGDBM_3261.00.01.0
NBAAGDBM_3270.01.00.0
NBAAGDBM_3280.01.00.0
NBAAGDBM_3290.01.00.0
NBAAGDBM_3310.01.00.0
NBAAGDBM_3350.01.00.0
NBAAGDBM_3360.01.00.0
NBAAGDBM_3410.01.00.0
NBAAGDBM_3421.00.01.0
NBAAGDBM_3430.01.00.0
NBAAGDBM_3460.01.00.0
NBAAGDBM_3481.00.01.0
NBAAGDBM_3490.01.00.0
NBAAGDBM_3500.01.00.0
NBAAGDBM_3520.01.00.0
NBAAGDBM_3550.01.00.0
NBAAGDBM_3570.01.00.0
NBAAGDBM_3580.01.00.0
NBAAGDBM_3600.01.00.0
NBAAGDBM_3630.01.00.0
NBAAGDBM_3640.01.00.0
NBAAGDBM_3650.01.00.0
NBAAGDBM_3660.01.00.0
NBAAGDBM_3710.01.00.0
NBAAGDBM_3721.00.01.0
NBAAGDBM_3740.01.00.0
NBAAGDBM_3750.01.00.0
NBAAGDBM_3760.01.00.0
NBAAGDBM_3790.01.00.0
NBAAGDBM_3800.01.00.0
NBAAGDBM_3810.01.00.0
NBAAGDBM_3820.01.00.0
NBAAGDBM_3830.01.00.0
NBAAGDBM_3840.01.00.0
NBAAGDBM_3850.01.00.0
NBAAGDBM_3880.01.00.0
NBAAGDBM_3890.01.00.0
NBAAGDBM_3920.01.00.0
NBAAGDBM_3930.01.00.0
NBAAGDBM_3941.00.01.0
NBAAGDBM_3951.00.01.0
NBAAGDBM_3961.00.01.0
NBAAGDBM_3970.01.00.0
NBAAGDBM_3980.01.00.0
NBAAGDBM_4021.00.01.0
NBAAGDBM_4030.01.00.0
NBAAGDBM_4040.01.00.0
NBAAGDBM_4060.01.00.0
NBAAGDBM_4070.01.00.0
NBAAGDBM_4090.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
NBAAGDBM_341864629968FalseSiphoviridaeVOG11003, VOG0052, VOG10679, VOG7438, VOG1047, VOG1047, VOG0021, VOG0026, VOG4606, VOG0327, VOG4548, VOG0198, VOG4581, VOG4571, VOG4544, VOG4556, VOG4573, VOG4553, VOG0204, VOG4589, VOG0641

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements