Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
HGEJJOLO_10.01.00.0
HGEJJOLO_20.01.00.0
HGEJJOLO_30.01.00.0
HGEJJOLO_41.00.01.0
HGEJJOLO_50.01.00.0
HGEJJOLO_60.01.00.0
HGEJJOLO_70.01.00.0
HGEJJOLO_80.01.00.0
HGEJJOLO_90.01.00.0
HGEJJOLO_100.01.00.0
HGEJJOLO_110.01.00.0
HGEJJOLO_120.01.00.0
HGEJJOLO_130.01.00.0
HGEJJOLO_140.01.00.0
HGEJJOLO_150.01.00.0
HGEJJOLO_160.01.00.0
HGEJJOLO_170.01.00.0
HGEJJOLO_180.01.00.0
HGEJJOLO_190.01.00.0
HGEJJOLO_200.01.00.0
HGEJJOLO_210.01.00.0
HGEJJOLO_220.01.00.0
HGEJJOLO_230.01.00.0
HGEJJOLO_240.01.00.0
HGEJJOLO_250.01.00.0
HGEJJOLO_260.01.00.0
HGEJJOLO_270.01.00.0
HGEJJOLO_280.01.00.0
HGEJJOLO_290.01.00.0
HGEJJOLO_300.01.00.0
HGEJJOLO_310.01.00.0
HGEJJOLO_320.01.00.0
HGEJJOLO_330.01.00.0
HGEJJOLO_340.01.00.0
HGEJJOLO_351.00.01.0
HGEJJOLO_360.01.00.0
HGEJJOLO_370.01.00.0
HGEJJOLO_380.01.00.0
HGEJJOLO_390.01.00.0
HGEJJOLO_400.01.00.0
HGEJJOLO_410.01.00.0
HGEJJOLO_420.01.00.0
HGEJJOLO_430.01.00.0
HGEJJOLO_440.01.00.0
HGEJJOLO_450.01.00.0
HGEJJOLO_460.01.00.0
HGEJJOLO_470.01.00.0
HGEJJOLO_480.01.00.0
HGEJJOLO_490.01.00.0
HGEJJOLO_500.01.00.0
HGEJJOLO_510.01.00.0
HGEJJOLO_521.00.01.0
HGEJJOLO_530.01.00.0
HGEJJOLO_540.01.00.0
HGEJJOLO_550.01.00.0
HGEJJOLO_561.00.01.0
HGEJJOLO_570.01.00.0
HGEJJOLO_580.01.00.0
HGEJJOLO_590.01.00.0
HGEJJOLO_600.01.00.0
HGEJJOLO_610.01.00.0
HGEJJOLO_631.00.01.0
HGEJJOLO_640.01.00.0
HGEJJOLO_651.00.01.0
HGEJJOLO_670.01.00.0
HGEJJOLO_680.01.00.0
HGEJJOLO_690.01.00.0
HGEJJOLO_700.01.00.0
HGEJJOLO_710.01.00.0
HGEJJOLO_720.01.00.0
HGEJJOLO_730.01.00.0
HGEJJOLO_741.00.01.0
HGEJJOLO_750.01.00.0
HGEJJOLO_761.00.01.0
HGEJJOLO_791.00.01.0
HGEJJOLO_810.01.00.0
HGEJJOLO_820.01.00.0
HGEJJOLO_830.01.00.0
HGEJJOLO_870.01.00.0
HGEJJOLO_880.01.00.0
HGEJJOLO_890.01.00.0
HGEJJOLO_911.00.01.0
HGEJJOLO_920.01.00.0
HGEJJOLO_930.01.00.0
HGEJJOLO_940.01.00.0
HGEJJOLO_951.00.01.0
HGEJJOLO_961.00.01.0
HGEJJOLO_971.00.01.0
HGEJJOLO_980.01.00.0
HGEJJOLO_991.00.01.0
HGEJJOLO_1001.00.01.0
HGEJJOLO_1011.00.01.0
HGEJJOLO_1020.01.00.0
HGEJJOLO_1030.01.00.0
HGEJJOLO_1040.01.00.0
HGEJJOLO_1061.00.01.0
HGEJJOLO_1101.00.01.0
HGEJJOLO_1110.01.00.0
HGEJJOLO_1121.00.01.0
HGEJJOLO_1130.01.00.0
HGEJJOLO_1151.00.01.0
HGEJJOLO_1161.00.01.0
HGEJJOLO_1171.00.01.0
HGEJJOLO_1200.01.00.0
HGEJJOLO_1230.01.00.0
HGEJJOLO_1251.00.01.0
HGEJJOLO_1270.01.00.0
HGEJJOLO_1281.00.01.0
HGEJJOLO_1300.01.00.0
HGEJJOLO_1310.01.00.0
HGEJJOLO_1330.01.00.0
HGEJJOLO_1380.01.00.0
HGEJJOLO_1390.01.00.0
HGEJJOLO_1400.01.00.0
HGEJJOLO_1411.00.01.0
HGEJJOLO_1420.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
No hit found

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements