Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
IALBIOEG_10.01.00.0
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IALBIOEG_1750.01.00.0
IALBIOEG_1761.00.01.0
IALBIOEG_1771.00.01.0
IALBIOEG_1800.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
IALBIOEG_109983141969FalseMyoviridaeVOG0198, VOG0376, VOG2545, VOG0796, VOG7407, VOG1912, VOG5027, VOG4865, VOG1915, VOG6932, VOG1942, VOG4710, VOG1353, VOG1881, VOG1883, VOG1352, VOG4699, VOG0705, VOG1956, VOG1433, VOG1348, VOG0573, VOG4550, VOG4691, VOG4845, VOG1837, VOG9945, VOG4705
IALBIOEG_125436631632FalseSiphoviridaeVOG8608, VOG9091, VOG4659, VOG4633, VOG4545, VOG0701, VOG9763, VOG0698, VOG0697, VOG0696, VOG0695, VOG1329, VOG5924, VOG0686, VOG0692, VOG0691, VOG4544, VOG1517, VOG4618

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements