Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0022.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
EOLNIKPJ_7950785782WalR2.66e-115transcriptional regulatory protein84.25100.00EPH95667
EOLNIKPJ_1301348113287CspR9.03e-31cold shock protein84.6198.48AAO82613
EOLNIKPJ_1301348113284CspA1.39e-30cold shock protein84.85100.00CAA62903

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
EOLNIKPJ_3023333393repUS731061 / 110197.17CP002654
EOLNIKPJ_9922143248rep381044 / 110482.57CP002655

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
EOLNIKPJ_31.00.01.0
EOLNIKPJ_41.00.01.0
EOLNIKPJ_50.01.00.0
EOLNIKPJ_61.00.01.0
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EOLNIKPJ_160.01.00.0
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EOLNIKPJ_181.00.01.0
EOLNIKPJ_230.01.00.0
EOLNIKPJ_270.01.00.0
EOLNIKPJ_301.00.01.0
EOLNIKPJ_340.01.00.0
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EOLNIKPJ_400.01.00.0
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EOLNIKPJ_1300.01.00.0
EOLNIKPJ_1310.01.00.0
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EOLNIKPJ_1330.01.00.0
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EOLNIKPJ_1380.01.00.0
EOLNIKPJ_1390.01.00.0
EOLNIKPJ_1400.01.00.0
EOLNIKPJ_1410.01.00.0
EOLNIKPJ_1430.01.00.0
EOLNIKPJ_1441.00.01.0
EOLNIKPJ_1460.01.00.0
EOLNIKPJ_1471.00.01.0
EOLNIKPJ_1500.01.00.0
EOLNIKPJ_1540.01.00.0
EOLNIKPJ_1551.00.01.0
EOLNIKPJ_1571.00.01.0
EOLNIKPJ_1581.00.01.0
EOLNIKPJ_1601.00.01.0
EOLNIKPJ_1610.01.00.0
EOLNIKPJ_1631.00.01.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
EOLNIKPJ_75632435295FalseSiphoviridaeVOG0189, VOG5047, VOG4567, VOG0198, VOG4841, VOG4581, VOG1886, VOG0202, VOG4556, VOG4573, VOG4553, VOG0204, VOG0205, VOG0207, VOG4586, VOG0660, VOG6163, VOG4605, VOG4599, VOG10957, VOG8870
EOLNIKPJ_84520716358FalseSiphoviridaeVOG3477, VOG0198, VOG0204, VOG4568, VOG4556, VOG2935, VOG4544, VOG4581, VOG4841, VOG0205, VOG4609
EOLNIKPJ_105265637110FalseSiphoviridaeVOG8615, VOG1638, VOG11003, VOG6495, VOG0181, VOG7298, VOG1302, VOG1309, VOG0186, VOG5046, VOG0189, VOG4552, VOG4693, VOG0198, VOG1183, VOG5616, VOG0796, VOG10227, VOG0720, VOG4564, VOG3434, VOG1887, VOG4713, VOG0723, VOG5660, VOG0799, VOG0725, VOG1323, VOG4545, VOG0801, VOG3462, VOG3463, VOG4660, VOG4705, VOG8294, VOG1637

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements