Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
1001.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
HCIBMOPF_144857750496tet(32)ARO:3000196tet(32)98.75100.00EU722333.1

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
HCIBMOPF_144857750496tet(32)Doxycycline, Tetracycline, Minocycline100.00100.00EF626943

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
HCIBMOPF_144858050496tet(32)tetracycline resistance ribosomal protection protein Tet(32)EXACTX100.00100.00WP_002602099.1

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
HCIBMOPF_10.01.00.0
HCIBMOPF_20.01.00.0
HCIBMOPF_30.01.00.0
HCIBMOPF_40.01.00.0
HCIBMOPF_50.01.00.0
HCIBMOPF_60.01.00.0
HCIBMOPF_70.01.00.0
HCIBMOPF_80.01.00.0
HCIBMOPF_90.01.00.0
HCIBMOPF_100.01.00.0
HCIBMOPF_110.01.00.0
HCIBMOPF_120.01.00.0
HCIBMOPF_130.01.00.0
HCIBMOPF_140.01.00.0
HCIBMOPF_150.01.00.0
HCIBMOPF_160.01.00.0
HCIBMOPF_170.01.00.0
HCIBMOPF_180.01.00.0
HCIBMOPF_190.01.00.0
HCIBMOPF_200.01.00.0
HCIBMOPF_210.01.00.0
HCIBMOPF_220.01.00.0
HCIBMOPF_230.01.00.0
HCIBMOPF_241.00.01.0
HCIBMOPF_251.00.01.0
HCIBMOPF_260.01.00.0
HCIBMOPF_271.00.01.0
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HCIBMOPF_300.01.00.0
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HCIBMOPF_320.01.00.0
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HCIBMOPF_340.01.00.0
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HCIBMOPF_560.01.00.0
HCIBMOPF_590.01.00.0
HCIBMOPF_600.01.00.0
HCIBMOPF_610.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
HCIBMOPF_12110581119641FalseSiphoviridaeVOG0052,
HCIBMOPF_45136986140775FalseSiphoviridaeVOG4360,
HCIBMOPF_45145133171187FalseMyoviridaeVOG0249,

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements