Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
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PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
MLMIAKCI_331015629351FalseSiphoviridaeVOG4633, VOG4545, VOG0209, VOG0207, VOG0205, VOG0204, VOG4553, VOG4573, VOG4556, VOG0202, VOG1886, VOG9761, VOG4581, VOG4841, VOG0198
MLMIAKCI_121737126629FalseMyoviridaeVOG0638, VOG5318, VOG4618, VOG1837, VOG7407, VOG1912, VOG5027, VOG1915, VOG1942, VOG4710, VOG1353, VOG1883, VOG1352, VOG4699
MLMIAKCI_332783035414FalseSiphoviridaeVOG4705, VOG8608, VOG8868, VOG6474, VOG1594, VOG8355, VOG4659, VOG4633, VOG8263, VOG0660, VOG0209, VOG4586, VOG0207, VOG0205, VOG0204, VOG4553, VOG4573, VOG4556, VOG0202, VOG1886, VOG10115, VOG4581, VOG4841, VOG0198, VOG3519, VOG0327, VOG3307, VOG5278, VOG3307, VOG3307
MLMIAKCI_345528035563FalseMyoviridaeVOG0198, VOG0686, VOG0796, VOG7407, VOG1912, VOG1912, VOG5027, VOG4865, VOG1915, VOG2779, VOG1942, VOG4778, VOG1353, VOG1881, VOG1883, VOG1352, VOG4699, VOG6307, VOG1956, VOG1433, VOG1348, VOG0573, VOG4550, VOG4691, VOG4620, VOG0173, VOG5913, VOG4397, VOG9945

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements