Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0022.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
EHOBGICB_58358165112WalR3.65e-114transcriptional regulatory protein83.40100.00EPH95667
EHOBGICB_1691890618709CspR2.72e-34cold shock protein89.39100.00AAO82613

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
EHOBGICB_10.01.00.0
EHOBGICB_40.01.00.0
EHOBGICB_70.01.00.0
EHOBGICB_91.00.01.0
EHOBGICB_111.00.01.0
EHOBGICB_130.01.00.0
EHOBGICB_151.00.01.0
EHOBGICB_161.00.01.0
EHOBGICB_180.01.00.0
EHOBGICB_191.00.01.0
EHOBGICB_210.01.00.0
EHOBGICB_220.01.00.0
EHOBGICB_230.01.00.0
EHOBGICB_240.01.00.0
EHOBGICB_251.00.01.0
EHOBGICB_260.01.00.0
EHOBGICB_270.01.00.0
EHOBGICB_280.01.00.0
EHOBGICB_301.00.01.0
EHOBGICB_310.01.00.0
EHOBGICB_321.00.01.0
EHOBGICB_331.00.01.0
EHOBGICB_340.01.00.0
EHOBGICB_351.00.01.0
EHOBGICB_360.01.00.0
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EHOBGICB_1230.01.00.0
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EHOBGICB_5330.01.00.0
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Prophage


Phigaro

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Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements