Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
KOOHJBEN_10.01.00.0
KOOHJBEN_20.01.00.0
KOOHJBEN_30.01.00.0
KOOHJBEN_41.00.01.0
KOOHJBEN_50.01.00.0
KOOHJBEN_60.01.00.0
KOOHJBEN_70.01.00.0
KOOHJBEN_80.01.00.0
KOOHJBEN_90.01.00.0
KOOHJBEN_100.01.00.0
KOOHJBEN_110.01.00.0
KOOHJBEN_120.01.00.0
KOOHJBEN_130.01.00.0
KOOHJBEN_140.01.00.0
KOOHJBEN_150.01.00.0
KOOHJBEN_160.01.00.0
KOOHJBEN_170.01.00.0
KOOHJBEN_180.01.00.0
KOOHJBEN_190.01.00.0
KOOHJBEN_200.01.00.0
KOOHJBEN_210.01.00.0
KOOHJBEN_220.01.00.0
KOOHJBEN_230.01.00.0
KOOHJBEN_240.01.00.0
KOOHJBEN_250.01.00.0
KOOHJBEN_261.00.01.0
KOOHJBEN_270.01.00.0
KOOHJBEN_280.01.00.0
KOOHJBEN_290.01.00.0
KOOHJBEN_300.01.00.0
KOOHJBEN_310.01.00.0
KOOHJBEN_320.01.00.0
KOOHJBEN_330.01.00.0
KOOHJBEN_340.01.00.0
KOOHJBEN_351.00.01.0
KOOHJBEN_360.01.00.0
KOOHJBEN_370.01.00.0
KOOHJBEN_380.01.00.0
KOOHJBEN_390.01.00.0
KOOHJBEN_401.00.01.0
KOOHJBEN_410.01.00.0
KOOHJBEN_420.01.00.0
KOOHJBEN_430.01.00.0
KOOHJBEN_440.01.00.0
KOOHJBEN_450.01.00.0
KOOHJBEN_460.01.00.0
KOOHJBEN_470.01.00.0
KOOHJBEN_481.00.01.0
KOOHJBEN_490.01.00.0
KOOHJBEN_500.01.00.0
KOOHJBEN_510.01.00.0
KOOHJBEN_521.00.01.0
KOOHJBEN_530.01.00.0
KOOHJBEN_541.00.01.0
KOOHJBEN_550.01.00.0
KOOHJBEN_560.01.00.0
KOOHJBEN_570.01.00.0
KOOHJBEN_580.01.00.0
KOOHJBEN_590.01.00.0
KOOHJBEN_600.01.00.0
KOOHJBEN_610.01.00.0
KOOHJBEN_620.01.00.0
KOOHJBEN_630.01.00.0
KOOHJBEN_640.01.00.0
KOOHJBEN_650.01.00.0
KOOHJBEN_660.01.00.0
KOOHJBEN_670.01.00.0
KOOHJBEN_680.01.00.0
KOOHJBEN_691.00.01.0
KOOHJBEN_700.01.00.0
KOOHJBEN_710.01.00.0
KOOHJBEN_720.01.00.0
KOOHJBEN_730.01.00.0
KOOHJBEN_741.00.01.0
KOOHJBEN_750.01.00.0
KOOHJBEN_761.00.01.0
KOOHJBEN_770.01.00.0
KOOHJBEN_780.01.00.0
KOOHJBEN_790.01.00.0
KOOHJBEN_800.01.00.0
KOOHJBEN_810.01.00.0
KOOHJBEN_821.00.01.0
KOOHJBEN_830.01.00.0
KOOHJBEN_841.00.01.0
KOOHJBEN_850.01.00.0
KOOHJBEN_860.01.00.0
KOOHJBEN_870.01.00.0
KOOHJBEN_880.01.00.0
KOOHJBEN_890.01.00.0
KOOHJBEN_900.01.00.0
KOOHJBEN_910.01.00.0
KOOHJBEN_920.01.00.0
KOOHJBEN_930.01.00.0
KOOHJBEN_940.01.00.0
KOOHJBEN_950.01.00.0
KOOHJBEN_961.00.01.0
KOOHJBEN_970.01.00.0
KOOHJBEN_980.01.00.0
KOOHJBEN_990.01.00.0
KOOHJBEN_1001.00.01.0
KOOHJBEN_1010.01.00.0
KOOHJBEN_1020.01.00.0
KOOHJBEN_1030.01.00.0
KOOHJBEN_1040.01.00.0
KOOHJBEN_1050.01.00.0
KOOHJBEN_1060.01.00.0
KOOHJBEN_1070.01.00.0
KOOHJBEN_1080.01.00.0
KOOHJBEN_1091.00.01.0
KOOHJBEN_1100.01.00.0
KOOHJBEN_1111.00.01.0
KOOHJBEN_1121.00.01.0
KOOHJBEN_1130.01.00.0
KOOHJBEN_1140.01.00.0
KOOHJBEN_1151.00.01.0
KOOHJBEN_1161.00.01.0
KOOHJBEN_1170.01.00.0
KOOHJBEN_1181.00.01.0
KOOHJBEN_1190.01.00.0
KOOHJBEN_1200.01.00.0
KOOHJBEN_1211.00.01.0
KOOHJBEN_1221.00.01.0
KOOHJBEN_1230.01.00.0
KOOHJBEN_1240.01.00.0
KOOHJBEN_1250.01.00.0
KOOHJBEN_1260.01.00.0
KOOHJBEN_1271.00.01.0
KOOHJBEN_1281.00.01.0
KOOHJBEN_1290.01.00.0
KOOHJBEN_1300.01.00.0
KOOHJBEN_1310.01.00.0
KOOHJBEN_1320.01.00.0
KOOHJBEN_1331.00.01.0
KOOHJBEN_1341.00.01.0
KOOHJBEN_1350.01.00.0
KOOHJBEN_1361.00.01.0
KOOHJBEN_1370.01.00.0
KOOHJBEN_1380.01.00.0
KOOHJBEN_1391.00.01.0
KOOHJBEN_1401.00.01.0
KOOHJBEN_1420.01.00.0
KOOHJBEN_1431.00.01.0
KOOHJBEN_1440.01.00.0
KOOHJBEN_1451.00.01.0
KOOHJBEN_1460.01.00.0
KOOHJBEN_1470.01.00.0
KOOHJBEN_1481.00.01.0
KOOHJBEN_1490.01.00.0
KOOHJBEN_1501.00.01.0
KOOHJBEN_1510.01.00.0
KOOHJBEN_1521.00.01.0
KOOHJBEN_1530.01.00.0
KOOHJBEN_1541.00.01.0
KOOHJBEN_1551.00.01.0
KOOHJBEN_1561.00.01.0
KOOHJBEN_1571.00.01.0
KOOHJBEN_1580.01.00.0
KOOHJBEN_1591.00.01.0
KOOHJBEN_1601.00.01.0
KOOHJBEN_1611.00.01.0
KOOHJBEN_1620.01.00.0
KOOHJBEN_1631.00.01.0
KOOHJBEN_1640.01.00.0
KOOHJBEN_1650.01.00.0
KOOHJBEN_1661.00.01.0
KOOHJBEN_1671.00.01.0
KOOHJBEN_1681.00.01.0
KOOHJBEN_1691.00.01.0
KOOHJBEN_1701.00.01.0
KOOHJBEN_1711.00.01.0
KOOHJBEN_1731.00.01.0
KOOHJBEN_1750.01.00.0
KOOHJBEN_1761.00.01.0
KOOHJBEN_1771.00.01.0
KOOHJBEN_1781.00.01.0
KOOHJBEN_1791.00.01.0
KOOHJBEN_1801.00.01.0
KOOHJBEN_1811.00.01.0
KOOHJBEN_1820.01.00.0
KOOHJBEN_1831.00.01.0
KOOHJBEN_1840.01.00.0
KOOHJBEN_1851.00.01.0
KOOHJBEN_1860.01.00.0
KOOHJBEN_1871.00.01.0
KOOHJBEN_1881.00.01.0
KOOHJBEN_1891.00.01.0
KOOHJBEN_1901.00.01.0
KOOHJBEN_1911.00.01.0
KOOHJBEN_1921.00.01.0
KOOHJBEN_1930.01.00.0
KOOHJBEN_1941.00.01.0
KOOHJBEN_1951.00.01.0
KOOHJBEN_1961.00.01.0
KOOHJBEN_1971.00.01.0
KOOHJBEN_1981.00.01.0
KOOHJBEN_1990.01.00.0
KOOHJBEN_2000.01.00.0
KOOHJBEN_2011.00.01.0
KOOHJBEN_2021.00.01.0
KOOHJBEN_2031.00.01.0
KOOHJBEN_2041.00.01.0
KOOHJBEN_2051.00.01.0
KOOHJBEN_2061.00.01.0
KOOHJBEN_2071.00.01.0
KOOHJBEN_2081.00.01.0
KOOHJBEN_2091.00.01.0
KOOHJBEN_2101.00.01.0
KOOHJBEN_2111.00.01.0
KOOHJBEN_2121.00.01.0
KOOHJBEN_2131.00.01.0
KOOHJBEN_2141.00.01.0
KOOHJBEN_2151.00.01.0
KOOHJBEN_2171.00.01.0
KOOHJBEN_2180.01.00.0
KOOHJBEN_2191.00.01.0
KOOHJBEN_2211.00.01.0
KOOHJBEN_2221.00.01.0
KOOHJBEN_2231.00.01.0
KOOHJBEN_2241.00.01.0
KOOHJBEN_2251.00.01.0
KOOHJBEN_2260.01.00.0
KOOHJBEN_2270.01.00.0
KOOHJBEN_2281.00.01.0
KOOHJBEN_2291.00.01.0
KOOHJBEN_2301.00.01.0
KOOHJBEN_2311.00.01.0
KOOHJBEN_2321.00.01.0
KOOHJBEN_2330.01.00.0
KOOHJBEN_2341.00.01.0
KOOHJBEN_2351.00.01.0
KOOHJBEN_2361.00.01.0
KOOHJBEN_2371.00.01.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
KOOHJBEN_4340639885FalseMyoviridaeVOG4705, VOG9945, VOG5913, VOG4845, VOG4691, VOG4550, VOG0573, VOG1348, VOG1433, VOG1956, VOG6163, VOG4699, VOG1352, VOG1883, VOG1881, VOG1353, VOG4778, VOG1942, VOG1915, VOG4918, VOG5027, VOG1912, VOG7407, VOG0796, VOG2545, VOG0376, VOG4455, VOG0198, VOG4693, VOG4732, VOG0189, VOG4566
KOOHJBEN_44140742987FalseSiphoviridaeVOG1250, VOG8609
KOOHJBEN_61412623935FalseMyoviridaeVOG0348, VOG0382, VOG0384, VOG0226, VOG2880, VOG6085

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements