Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
1001.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
EENPHKPP_3215422372TEM-116ARO:3000979TEM-116100.0096.50U36911.1

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
EENPHKPP_3215422373blaTEM-116Amoxicillin, Ampicillin, Cephalothin, Piperacillin, Ticarcillin99.7696.63AY425988

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
EENPHKPP_3215452372blaTEMTEM family class A beta-lactamaseBLASTX100.0096.50WP_000027050.1

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
EENPHKPP_1171440repUS16440 / 60099.77GQ900438
EENPHKPP_329971127ColRNAI131 / 13087.02DQ298019

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
EENPHKPP_10.01.00.0
EENPHKPP_20.01.00.0
EENPHKPP_30.01.00.0
EENPHKPP_40.01.00.0
EENPHKPP_50.01.00.0
EENPHKPP_61.00.01.0
EENPHKPP_70.01.00.0
EENPHKPP_81.00.01.0
EENPHKPP_91.00.01.0
EENPHKPP_100.01.00.0
EENPHKPP_110.01.00.0
EENPHKPP_120.01.00.0
EENPHKPP_130.01.00.0
EENPHKPP_140.01.00.0
EENPHKPP_150.01.00.0
EENPHKPP_160.01.00.0
EENPHKPP_171.00.01.0
EENPHKPP_180.01.00.0
EENPHKPP_190.01.00.0
EENPHKPP_200.01.00.0
EENPHKPP_211.00.01.0
EENPHKPP_220.01.00.0
EENPHKPP_230.01.00.0
EENPHKPP_240.01.00.0
EENPHKPP_251.00.01.0
EENPHKPP_261.00.01.0
EENPHKPP_270.01.00.0
EENPHKPP_280.01.00.0
EENPHKPP_300.01.00.0
EENPHKPP_311.00.01.0
EENPHKPP_321.00.01.0
EENPHKPP_330.01.00.0
EENPHKPP_340.01.00.0
EENPHKPP_350.01.00.0
EENPHKPP_360.01.00.0
EENPHKPP_371.00.01.0
EENPHKPP_381.00.01.0
EENPHKPP_390.01.00.0
EENPHKPP_400.01.00.0
EENPHKPP_410.01.00.0
EENPHKPP_420.01.00.0
EENPHKPP_430.01.00.0
EENPHKPP_440.01.00.0
EENPHKPP_451.00.01.0
EENPHKPP_460.01.00.0
EENPHKPP_470.01.00.0
EENPHKPP_480.01.00.0
EENPHKPP_491.00.01.0
EENPHKPP_501.00.01.0
EENPHKPP_510.01.00.0
EENPHKPP_521.00.01.0
EENPHKPP_530.01.00.0
EENPHKPP_541.00.01.0
EENPHKPP_551.00.01.0
EENPHKPP_561.00.01.0
EENPHKPP_571.00.01.0
EENPHKPP_580.01.00.0
EENPHKPP_591.00.01.0
EENPHKPP_611.00.01.0
EENPHKPP_620.01.00.0
EENPHKPP_630.01.00.0
EENPHKPP_640.01.00.0
EENPHKPP_651.00.01.0
EENPHKPP_660.01.00.0
EENPHKPP_671.00.01.0
EENPHKPP_680.01.00.0
EENPHKPP_691.00.01.0
EENPHKPP_701.00.01.0
EENPHKPP_710.01.00.0
EENPHKPP_770.01.00.0
EENPHKPP_830.01.00.0
EENPHKPP_880.01.00.0
EENPHKPP_890.01.00.0
EENPHKPP_960.01.00.0
EENPHKPP_1020.01.00.0
EENPHKPP_1090.01.00.0
EENPHKPP_1180.01.00.0
EENPHKPP_1230.01.00.0
EENPHKPP_1290.01.00.0
EENPHKPP_1360.01.00.0
EENPHKPP_1420.01.00.0
EENPHKPP_1490.01.00.0
EENPHKPP_1550.01.00.0
EENPHKPP_1560.01.00.0
EENPHKPP_1630.01.00.0
EENPHKPP_1690.01.00.0
EENPHKPP_1760.01.00.0
EENPHKPP_1800.01.00.0
EENPHKPP_1850.01.00.0
EENPHKPP_1910.01.00.0
EENPHKPP_1950.01.00.0
EENPHKPP_2020.01.00.0
EENPHKPP_2100.01.00.0
EENPHKPP_2150.01.00.0
EENPHKPP_2160.01.00.0
EENPHKPP_2210.01.00.0
EENPHKPP_2290.01.00.0
EENPHKPP_2350.01.00.0
EENPHKPP_2400.01.00.0
EENPHKPP_2470.01.00.0
EENPHKPP_2510.01.00.0
EENPHKPP_2590.01.00.0
EENPHKPP_2700.01.00.0
EENPHKPP_2811.00.01.0
EENPHKPP_2920.01.00.0
EENPHKPP_2930.01.00.0
EENPHKPP_3040.01.00.0
EENPHKPP_3150.01.00.0
EENPHKPP_3260.01.00.0
EENPHKPP_3350.01.00.0
EENPHKPP_3360.01.00.0
EENPHKPP_3370.01.00.0
EENPHKPP_3380.01.00.0
EENPHKPP_3390.01.00.0
EENPHKPP_3400.01.00.0
EENPHKPP_3410.01.00.0
EENPHKPP_3420.01.00.0
EENPHKPP_3430.01.00.0
EENPHKPP_3440.01.00.0
EENPHKPP_3450.01.00.0
EENPHKPP_3460.01.00.0
EENPHKPP_3470.01.00.0
EENPHKPP_3480.01.00.0
EENPHKPP_3490.01.00.0
EENPHKPP_3500.01.00.0
EENPHKPP_3510.01.00.0
EENPHKPP_3520.01.00.0
EENPHKPP_3530.01.00.0
EENPHKPP_3540.01.00.0
EENPHKPP_3550.01.00.0
EENPHKPP_3560.01.00.0
EENPHKPP_3570.01.00.0
EENPHKPP_3580.01.00.0
EENPHKPP_3590.01.00.0
EENPHKPP_3600.01.00.0
EENPHKPP_3610.01.00.0
EENPHKPP_3620.01.00.0
EENPHKPP_3630.01.00.0
EENPHKPP_3640.01.00.0
EENPHKPP_3650.01.00.0
EENPHKPP_3660.01.00.0
EENPHKPP_3670.01.00.0
EENPHKPP_3680.01.00.0
EENPHKPP_3690.01.00.0
EENPHKPP_3700.01.00.0
EENPHKPP_3710.01.00.0
EENPHKPP_3720.01.00.0
EENPHKPP_3730.01.00.0
EENPHKPP_3740.01.00.0
EENPHKPP_3751.00.01.0
EENPHKPP_3760.01.00.0
EENPHKPP_3770.01.00.0
EENPHKPP_3780.01.00.0
EENPHKPP_3790.01.00.0
EENPHKPP_3800.01.00.0
EENPHKPP_3810.01.00.0
EENPHKPP_3821.00.01.0
EENPHKPP_3830.01.00.0
EENPHKPP_3850.01.00.0
EENPHKPP_3860.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
EENPHKPP_375484736417FalseSiphoviridaeVOG9708, VOG0283, VOG4566, VOG0189, VOG0226, VOG9667, VOG9667, VOG0198, VOG0796, VOG4544, VOG0691, VOG0692, VOG5047, VOG0692, VOG9317, VOG1329, VOG0695, VOG0696, VOG0697, VOG0698, VOG0701, VOG4545, VOG4633, VOG4659, VOG5357

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements