Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
PJKALHPE_10.01.00.0
PJKALHPE_20.01.00.0
PJKALHPE_30.01.00.0
PJKALHPE_40.01.00.0
PJKALHPE_50.01.00.0
PJKALHPE_60.01.00.0
PJKALHPE_70.01.00.0
PJKALHPE_80.01.00.0
PJKALHPE_90.01.00.0
PJKALHPE_100.01.00.0
PJKALHPE_110.01.00.0
PJKALHPE_120.01.00.0
PJKALHPE_130.01.00.0
PJKALHPE_140.01.00.0
PJKALHPE_150.01.00.0
PJKALHPE_160.01.00.0
PJKALHPE_170.01.00.0
PJKALHPE_180.01.00.0
PJKALHPE_190.01.00.0
PJKALHPE_200.01.00.0
PJKALHPE_210.01.00.0
PJKALHPE_221.00.01.0
PJKALHPE_230.01.00.0
PJKALHPE_240.01.00.0
PJKALHPE_250.01.00.0
PJKALHPE_260.01.00.0
PJKALHPE_270.01.00.0
PJKALHPE_280.01.00.0
PJKALHPE_290.01.00.0
PJKALHPE_301.00.01.0
PJKALHPE_310.01.00.0
PJKALHPE_320.01.00.0
PJKALHPE_330.01.00.0
PJKALHPE_340.01.00.0
PJKALHPE_350.01.00.0
PJKALHPE_361.00.01.0
PJKALHPE_371.00.01.0
PJKALHPE_380.01.00.0
PJKALHPE_390.01.00.0
PJKALHPE_400.01.00.0
PJKALHPE_410.01.00.0
PJKALHPE_420.01.00.0
PJKALHPE_430.01.00.0
PJKALHPE_440.01.00.0
PJKALHPE_450.01.00.0
PJKALHPE_460.01.00.0
PJKALHPE_470.01.00.0
PJKALHPE_481.00.01.0
PJKALHPE_490.01.00.0
PJKALHPE_500.01.00.0
PJKALHPE_510.01.00.0
PJKALHPE_520.01.00.0
PJKALHPE_530.01.00.0
PJKALHPE_540.01.00.0
PJKALHPE_550.01.00.0
PJKALHPE_561.00.01.0
PJKALHPE_570.01.00.0
PJKALHPE_581.00.01.0
PJKALHPE_590.01.00.0
PJKALHPE_600.01.00.0
PJKALHPE_610.01.00.0
PJKALHPE_620.01.00.0
PJKALHPE_630.01.00.0
PJKALHPE_640.01.00.0
PJKALHPE_650.01.00.0
PJKALHPE_660.01.00.0
PJKALHPE_670.01.00.0
PJKALHPE_680.01.00.0
PJKALHPE_690.01.00.0
PJKALHPE_701.00.01.0
PJKALHPE_710.01.00.0
PJKALHPE_720.01.00.0
PJKALHPE_730.01.00.0
PJKALHPE_740.01.00.0
PJKALHPE_750.01.00.0
PJKALHPE_760.01.00.0
PJKALHPE_770.01.00.0
PJKALHPE_780.01.00.0
PJKALHPE_790.01.00.0
PJKALHPE_800.01.00.0
PJKALHPE_810.01.00.0
PJKALHPE_820.01.00.0
PJKALHPE_830.01.00.0
PJKALHPE_841.00.01.0
PJKALHPE_850.01.00.0
PJKALHPE_860.01.00.0
PJKALHPE_871.00.01.0
PJKALHPE_880.01.00.0
PJKALHPE_890.01.00.0
PJKALHPE_900.01.00.0
PJKALHPE_910.01.00.0
PJKALHPE_920.01.00.0
PJKALHPE_930.01.00.0
PJKALHPE_940.01.00.0
PJKALHPE_950.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
PJKALHPE_1130043137455FalseUnknownVOG0226,

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements