Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
LDEMOHEN_10.01.00.0
LDEMOHEN_20.01.00.0
LDEMOHEN_30.01.00.0
LDEMOHEN_41.00.01.0
LDEMOHEN_50.01.00.0
LDEMOHEN_60.01.00.0
LDEMOHEN_70.01.00.0
LDEMOHEN_80.01.00.0
LDEMOHEN_90.01.00.0
LDEMOHEN_100.01.00.0
LDEMOHEN_110.01.00.0
LDEMOHEN_120.01.00.0
LDEMOHEN_130.01.00.0
LDEMOHEN_140.01.00.0
LDEMOHEN_150.01.00.0
LDEMOHEN_160.01.00.0
LDEMOHEN_171.00.01.0
LDEMOHEN_180.01.00.0
LDEMOHEN_190.01.00.0
LDEMOHEN_200.01.00.0
LDEMOHEN_210.01.00.0
LDEMOHEN_220.01.00.0
LDEMOHEN_230.01.00.0
LDEMOHEN_240.01.00.0
LDEMOHEN_250.01.00.0
LDEMOHEN_260.01.00.0
LDEMOHEN_270.01.00.0
LDEMOHEN_280.01.00.0
LDEMOHEN_290.01.00.0
LDEMOHEN_300.01.00.0
LDEMOHEN_310.01.00.0
LDEMOHEN_320.01.00.0
LDEMOHEN_330.01.00.0
LDEMOHEN_341.00.01.0
LDEMOHEN_350.01.00.0
LDEMOHEN_360.01.00.0
LDEMOHEN_370.01.00.0
LDEMOHEN_380.01.00.0
LDEMOHEN_391.00.01.0
LDEMOHEN_400.01.00.0
LDEMOHEN_410.01.00.0
LDEMOHEN_420.01.00.0
LDEMOHEN_430.01.00.0
LDEMOHEN_440.01.00.0
LDEMOHEN_451.00.01.0
LDEMOHEN_460.01.00.0
LDEMOHEN_470.01.00.0
LDEMOHEN_480.01.00.0
LDEMOHEN_490.01.00.0
LDEMOHEN_500.01.00.0
LDEMOHEN_510.01.00.0
LDEMOHEN_521.00.01.0
LDEMOHEN_530.01.00.0
LDEMOHEN_540.01.00.0
LDEMOHEN_550.01.00.0
LDEMOHEN_560.01.00.0
LDEMOHEN_570.01.00.0
LDEMOHEN_580.01.00.0
LDEMOHEN_590.01.00.0
LDEMOHEN_600.01.00.0
LDEMOHEN_610.01.00.0
LDEMOHEN_620.01.00.0
LDEMOHEN_631.00.01.0
LDEMOHEN_640.01.00.0
LDEMOHEN_650.01.00.0
LDEMOHEN_660.01.00.0
LDEMOHEN_670.01.00.0
LDEMOHEN_680.01.00.0
LDEMOHEN_690.01.00.0
LDEMOHEN_700.01.00.0
LDEMOHEN_710.01.00.0
LDEMOHEN_720.01.00.0
LDEMOHEN_730.01.00.0
LDEMOHEN_740.01.00.0
LDEMOHEN_750.01.00.0
LDEMOHEN_760.01.00.0
LDEMOHEN_770.01.00.0
LDEMOHEN_780.01.00.0
LDEMOHEN_790.01.00.0
LDEMOHEN_800.01.00.0
LDEMOHEN_810.01.00.0
LDEMOHEN_820.01.00.0
LDEMOHEN_830.01.00.0
LDEMOHEN_840.01.00.0
LDEMOHEN_850.01.00.0
LDEMOHEN_860.01.00.0
LDEMOHEN_870.01.00.0
LDEMOHEN_881.00.01.0
LDEMOHEN_890.01.00.0
LDEMOHEN_900.01.00.0
LDEMOHEN_911.00.01.0
LDEMOHEN_920.01.00.0
LDEMOHEN_930.01.00.0
LDEMOHEN_940.01.00.0
LDEMOHEN_950.01.00.0
LDEMOHEN_960.01.00.0
LDEMOHEN_970.01.00.0
LDEMOHEN_980.01.00.0
LDEMOHEN_990.01.00.0
LDEMOHEN_1000.01.00.0
LDEMOHEN_1010.01.00.0
LDEMOHEN_1020.01.00.0
LDEMOHEN_1030.01.00.0
LDEMOHEN_1040.01.00.0
LDEMOHEN_1050.01.00.0
LDEMOHEN_1060.01.00.0
LDEMOHEN_1070.01.00.0
LDEMOHEN_1080.01.00.0
LDEMOHEN_1090.01.00.0
LDEMOHEN_1100.01.00.0
LDEMOHEN_1110.01.00.0
LDEMOHEN_1120.01.00.0
LDEMOHEN_1130.01.00.0
LDEMOHEN_1140.01.00.0
LDEMOHEN_1151.00.01.0
LDEMOHEN_1160.01.00.0
LDEMOHEN_1170.01.00.0
LDEMOHEN_1180.01.00.0
LDEMOHEN_1190.01.00.0
LDEMOHEN_1200.01.00.0
LDEMOHEN_1210.01.00.0
LDEMOHEN_1221.00.01.0
LDEMOHEN_1230.01.00.0
LDEMOHEN_1240.01.00.0
LDEMOHEN_1250.01.00.0
LDEMOHEN_1260.01.00.0
LDEMOHEN_1270.01.00.0
LDEMOHEN_1280.01.00.0
LDEMOHEN_1290.01.00.0
LDEMOHEN_1300.01.00.0
LDEMOHEN_1310.01.00.0
LDEMOHEN_1320.01.00.0
LDEMOHEN_1330.01.00.0
LDEMOHEN_1341.00.01.0
LDEMOHEN_1350.01.00.0
LDEMOHEN_1360.01.00.0
LDEMOHEN_1370.01.00.0
LDEMOHEN_1380.01.00.0
LDEMOHEN_1390.01.00.0
LDEMOHEN_1400.01.00.0
LDEMOHEN_1410.01.00.0
LDEMOHEN_1420.01.00.0
LDEMOHEN_1430.01.00.0
LDEMOHEN_1440.01.00.0
LDEMOHEN_1450.01.00.0
LDEMOHEN_1460.01.00.0
LDEMOHEN_1470.01.00.0
LDEMOHEN_1481.00.01.0
LDEMOHEN_1490.01.00.0
LDEMOHEN_1500.01.00.0
LDEMOHEN_1510.01.00.0
LDEMOHEN_1520.01.00.0
LDEMOHEN_1530.01.00.0
LDEMOHEN_1540.01.00.0
LDEMOHEN_1550.01.00.0
LDEMOHEN_1560.01.00.0
LDEMOHEN_1570.01.00.0
LDEMOHEN_1580.01.00.0
LDEMOHEN_1590.01.00.0
LDEMOHEN_1600.01.00.0
LDEMOHEN_1610.01.00.0
LDEMOHEN_1620.01.00.0
LDEMOHEN_1630.01.00.0
LDEMOHEN_1640.01.00.0
LDEMOHEN_1650.01.00.0
LDEMOHEN_1660.01.00.0
LDEMOHEN_1671.00.01.0
LDEMOHEN_1680.01.00.0
LDEMOHEN_1690.01.00.0
LDEMOHEN_1700.01.00.0
LDEMOHEN_1710.01.00.0
LDEMOHEN_1720.01.00.0
LDEMOHEN_1731.00.01.0
LDEMOHEN_1740.01.00.0
LDEMOHEN_1750.01.00.0
LDEMOHEN_1760.01.00.0
LDEMOHEN_1770.01.00.0
LDEMOHEN_1780.01.00.0
LDEMOHEN_1790.01.00.0
LDEMOHEN_1800.01.00.0
LDEMOHEN_1810.01.00.0
LDEMOHEN_1820.01.00.0
LDEMOHEN_1830.01.00.0
LDEMOHEN_1840.01.00.0
LDEMOHEN_1850.01.00.0
LDEMOHEN_1860.01.00.0
LDEMOHEN_1871.00.01.0
LDEMOHEN_1880.01.00.0
LDEMOHEN_1890.01.00.0
LDEMOHEN_1900.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
LDEMOHEN_862573837104FalseSiphoviridaeVOG4581,

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements