Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0101.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
JLAAJOJE_6454856074cepAUnknown Beta-lactam100.0065.34U05887

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
JLAAJOJE_6454856072cepACepA family extended-spectrum class A beta-lactamasePARTIAL_CONTIG_ENDX100.0065.33WP_010992371.1

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
JLAAJOJE_953200533198bft-10.0BFT B. fragilis toxin, subtype 1Exotoxin100.00100.00BAA77276
JLAAJOJE_953200533198bft-20.0BFT B. fragilis toxin, subtype 2Exotoxin94.89100.00BAA77277
JLAAJOJE_953200533198bft-30.0BFT B. fragilis toxin, subtype 3Exotoxin94.47100.00BAA77275

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
JLAAJOJE_10.01.00.0
JLAAJOJE_20.01.00.0
JLAAJOJE_30.01.00.0
JLAAJOJE_40.01.00.0
JLAAJOJE_51.00.01.0
JLAAJOJE_60.01.00.0
JLAAJOJE_70.01.00.0
JLAAJOJE_80.01.00.0
JLAAJOJE_90.01.00.0
JLAAJOJE_100.01.00.0
JLAAJOJE_110.01.00.0
JLAAJOJE_120.01.00.0
JLAAJOJE_130.01.00.0
JLAAJOJE_140.01.00.0
JLAAJOJE_151.00.01.0
JLAAJOJE_161.00.01.0
JLAAJOJE_170.01.00.0
JLAAJOJE_180.01.00.0
JLAAJOJE_190.01.00.0
JLAAJOJE_201.00.01.0
JLAAJOJE_210.01.00.0
JLAAJOJE_220.01.00.0
JLAAJOJE_230.01.00.0
JLAAJOJE_240.01.00.0
JLAAJOJE_250.01.00.0
JLAAJOJE_260.01.00.0
JLAAJOJE_270.01.00.0
JLAAJOJE_281.00.01.0
JLAAJOJE_290.01.00.0
JLAAJOJE_300.01.00.0
JLAAJOJE_310.01.00.0
JLAAJOJE_320.01.00.0
JLAAJOJE_330.01.00.0
JLAAJOJE_340.01.00.0
JLAAJOJE_350.01.00.0
JLAAJOJE_360.01.00.0
JLAAJOJE_371.00.01.0
JLAAJOJE_380.01.00.0
JLAAJOJE_390.01.00.0
JLAAJOJE_400.01.00.0
JLAAJOJE_410.01.00.0
JLAAJOJE_420.01.00.0
JLAAJOJE_430.01.00.0
JLAAJOJE_440.01.00.0
JLAAJOJE_450.01.00.0
JLAAJOJE_460.01.00.0
JLAAJOJE_470.01.00.0
JLAAJOJE_480.01.00.0
JLAAJOJE_490.01.00.0
JLAAJOJE_500.01.00.0
JLAAJOJE_510.01.00.0
JLAAJOJE_520.01.00.0
JLAAJOJE_530.01.00.0
JLAAJOJE_541.00.01.0
JLAAJOJE_550.01.00.0
JLAAJOJE_560.01.00.0
JLAAJOJE_570.01.00.0
JLAAJOJE_580.01.00.0
JLAAJOJE_590.01.00.0
JLAAJOJE_600.01.00.0
JLAAJOJE_611.00.01.0
JLAAJOJE_620.01.00.0
JLAAJOJE_630.01.00.0
JLAAJOJE_641.00.01.0
JLAAJOJE_650.01.00.0
JLAAJOJE_660.01.00.0
JLAAJOJE_670.01.00.0
JLAAJOJE_680.01.00.0
JLAAJOJE_690.01.00.0
JLAAJOJE_700.01.00.0
JLAAJOJE_710.01.00.0
JLAAJOJE_721.00.01.0
JLAAJOJE_730.01.00.0
JLAAJOJE_740.01.00.0
JLAAJOJE_750.01.00.0
JLAAJOJE_760.01.00.0
JLAAJOJE_770.01.00.0
JLAAJOJE_780.01.00.0
JLAAJOJE_790.01.00.0
JLAAJOJE_800.01.00.0
JLAAJOJE_811.00.01.0
JLAAJOJE_820.01.00.0
JLAAJOJE_830.01.00.0
JLAAJOJE_840.01.00.0
JLAAJOJE_850.01.00.0
JLAAJOJE_861.00.01.0
JLAAJOJE_870.01.00.0
JLAAJOJE_880.01.00.0
JLAAJOJE_890.01.00.0
JLAAJOJE_900.01.00.0
JLAAJOJE_910.01.00.0
JLAAJOJE_920.01.00.0
JLAAJOJE_930.01.00.0
JLAAJOJE_940.01.00.0
JLAAJOJE_951.00.01.0
JLAAJOJE_960.01.00.0
JLAAJOJE_970.01.00.0
JLAAJOJE_980.01.00.0
JLAAJOJE_990.01.00.0
JLAAJOJE_1000.01.00.0
JLAAJOJE_1010.01.00.0
JLAAJOJE_1020.01.00.0
JLAAJOJE_1030.01.00.0
JLAAJOJE_1040.01.00.0
JLAAJOJE_1050.01.00.0
JLAAJOJE_1061.00.01.0
JLAAJOJE_1070.01.00.0
JLAAJOJE_1080.01.00.0
JLAAJOJE_1090.01.00.0
JLAAJOJE_1100.01.00.0
JLAAJOJE_1110.01.00.0
JLAAJOJE_1121.00.01.0
JLAAJOJE_1131.00.01.0
JLAAJOJE_1140.01.00.0
JLAAJOJE_1151.00.01.0
JLAAJOJE_1160.01.00.0
JLAAJOJE_1170.01.00.0
JLAAJOJE_1180.01.00.0
JLAAJOJE_1190.01.00.0
JLAAJOJE_1200.01.00.0
JLAAJOJE_1210.01.00.0
JLAAJOJE_1220.01.00.0
JLAAJOJE_1230.01.00.0
JLAAJOJE_1240.01.00.0
JLAAJOJE_1250.01.00.0
JLAAJOJE_1260.01.00.0
JLAAJOJE_1270.01.00.0
JLAAJOJE_1280.01.00.0
JLAAJOJE_1290.01.00.0
JLAAJOJE_1300.01.00.0
JLAAJOJE_1310.01.00.0
JLAAJOJE_1320.01.00.0
JLAAJOJE_1331.00.01.0
JLAAJOJE_1340.01.00.0
JLAAJOJE_1350.01.00.0
JLAAJOJE_1361.00.01.0
JLAAJOJE_1371.00.01.0
JLAAJOJE_1381.00.01.0
JLAAJOJE_1390.01.00.0
JLAAJOJE_1400.01.00.0
JLAAJOJE_1410.01.00.0
JLAAJOJE_1420.01.00.0
JLAAJOJE_1431.00.01.0
JLAAJOJE_1440.01.00.0
JLAAJOJE_1450.01.00.0
JLAAJOJE_1460.01.00.0
JLAAJOJE_1471.00.01.0
JLAAJOJE_1480.01.00.0
JLAAJOJE_1490.01.00.0
JLAAJOJE_1500.01.00.0
JLAAJOJE_1510.01.00.0
JLAAJOJE_1520.01.00.0
JLAAJOJE_1530.01.00.0
JLAAJOJE_1540.01.00.0
JLAAJOJE_1550.01.00.0
JLAAJOJE_1560.01.00.0
JLAAJOJE_1570.01.00.0
JLAAJOJE_1581.00.01.0
JLAAJOJE_1590.01.00.0
JLAAJOJE_1600.01.00.0
JLAAJOJE_1610.01.00.0
JLAAJOJE_1620.01.00.0
JLAAJOJE_1630.01.00.0
JLAAJOJE_1640.01.00.0
JLAAJOJE_1650.01.00.0
JLAAJOJE_1660.01.00.0
JLAAJOJE_1670.01.00.0
JLAAJOJE_1680.01.00.0
JLAAJOJE_1690.01.00.0
JLAAJOJE_1700.01.00.0
JLAAJOJE_1710.01.00.0
JLAAJOJE_1720.01.00.0
JLAAJOJE_1730.01.00.0
JLAAJOJE_1740.01.00.0
JLAAJOJE_1750.01.00.0
JLAAJOJE_1760.01.00.0
JLAAJOJE_1770.01.00.0
JLAAJOJE_1781.00.01.0
JLAAJOJE_1790.01.00.0
JLAAJOJE_1800.01.00.0
JLAAJOJE_1810.01.00.0
JLAAJOJE_1821.00.01.0
JLAAJOJE_1830.01.00.0
JLAAJOJE_1840.01.00.0
JLAAJOJE_1850.01.00.0
JLAAJOJE_1860.01.00.0
JLAAJOJE_1871.00.01.0
JLAAJOJE_1880.01.00.0
JLAAJOJE_1890.01.00.0
JLAAJOJE_1901.00.01.0
JLAAJOJE_1910.01.00.0
JLAAJOJE_1920.01.00.0
JLAAJOJE_1930.01.00.0
JLAAJOJE_1940.01.00.0
JLAAJOJE_1950.01.00.0
JLAAJOJE_1960.01.00.0
JLAAJOJE_1970.01.00.0
JLAAJOJE_1980.01.00.0
JLAAJOJE_1990.01.00.0
JLAAJOJE_2000.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
No hit found

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements