Probiotic potential risk score
| ARGs | VFs | PGs | PPRS |
|---|---|---|---|
| 0 | 0 | 0 | 0.00 |
PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).
Antibiotic resistance genes
Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)
| Query ID | Begin | End | ARO name | ARO accession | CARD name | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)
ResFinder
| Query ID | Begin | End | Resistance gene | Phenotype | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | |||||||
ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)
AMRFinderPlus
| Query ID | Begin | End | Gene symbol | Sequence name | Method | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)
Virulence factors
Virulence Factor Database (VFDB)
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | VF name | VF category | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | |||||||||
BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)
VirulenceFinder
| Query ID | Begin | End | Database | Virulence factor | Protein function | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)
Pathogenic genes
PHI-base
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | Function | Identity | Coverage | Gene ID |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)
Plasmid
PlasmidFinder
| Query ID | Begin | End | Plasmid | Query / Template | Identity | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||
PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)
PlasmidHunter
| Query ID | Prediction | Chromosome | Plasmid |
|---|---|---|---|
| NFIAJNNM_1 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_2 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_3 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_4 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_5 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_6 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_7 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_8 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_9 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_10 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_11 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_12 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_13 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_14 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_15 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_16 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_17 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_18 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_19 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_20 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_21 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_22 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_23 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_24 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_25 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_26 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_27 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_28 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_29 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_30 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_31 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_32 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_33 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_34 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_35 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_36 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_37 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_38 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_39 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_40 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_41 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_42 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_43 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_44 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_45 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_46 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_47 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_48 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_49 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_50 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_51 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_52 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_53 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_54 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_55 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_56 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_57 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_58 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_59 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_60 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_61 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_62 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_63 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_64 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_65 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_66 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_67 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_68 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_69 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_70 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_71 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_72 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_73 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_74 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_75 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_76 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_77 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_78 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_79 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_80 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_81 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_82 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_83 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_84 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_85 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_86 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_87 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_88 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_89 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_90 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_91 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_92 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_93 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_94 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_95 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_96 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_97 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_98 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_99 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_100 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_101 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_102 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_103 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_104 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_105 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_106 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_107 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_108 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_109 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_110 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_111 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_112 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_113 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_114 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_115 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_116 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_117 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_118 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_119 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_120 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_121 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_122 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_123 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_124 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_125 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_126 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_127 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_128 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_129 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_130 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_131 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_132 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_133 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_134 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_135 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_136 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_137 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_138 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_139 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_140 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_141 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_142 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_143 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_144 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_145 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_146 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_147 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_148 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_149 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_150 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_151 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_152 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_153 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_154 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_155 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_156 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_157 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_158 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_159 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_160 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_161 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_162 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_163 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_164 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_165 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_166 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_167 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| NFIAJNNM_168 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_169 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_170 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| NFIAJNNM_171 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)
Prophage
Phigaro
| Query ID | Begin | End | Transposable | Taxonomy | pVOGs |
|---|---|---|---|---|---|
| NFIAJNNM_44 | 157584 | 165979 | False | Siphoviridae | VOG4581, |
| NFIAJNNM_48 | 14079 | 27291 | False | Siphoviridae | VOG4843, |
Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)