Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
FDKMJMEP_10.01.00.0
FDKMJMEP_20.01.00.0
FDKMJMEP_30.01.00.0
FDKMJMEP_40.01.00.0
FDKMJMEP_50.01.00.0
FDKMJMEP_61.00.01.0
FDKMJMEP_70.01.00.0
FDKMJMEP_80.01.00.0
FDKMJMEP_91.00.01.0
FDKMJMEP_100.01.00.0
FDKMJMEP_110.01.00.0
FDKMJMEP_120.01.00.0
FDKMJMEP_130.01.00.0
FDKMJMEP_140.01.00.0
FDKMJMEP_150.01.00.0
FDKMJMEP_160.01.00.0
FDKMJMEP_170.01.00.0
FDKMJMEP_180.01.00.0
FDKMJMEP_190.01.00.0
FDKMJMEP_201.00.01.0
FDKMJMEP_210.01.00.0
FDKMJMEP_220.01.00.0
FDKMJMEP_230.01.00.0
FDKMJMEP_240.01.00.0
FDKMJMEP_250.01.00.0
FDKMJMEP_261.00.01.0
FDKMJMEP_270.01.00.0
FDKMJMEP_280.01.00.0
FDKMJMEP_290.01.00.0
FDKMJMEP_300.01.00.0
FDKMJMEP_310.01.00.0
FDKMJMEP_320.01.00.0
FDKMJMEP_330.01.00.0
FDKMJMEP_340.01.00.0
FDKMJMEP_350.01.00.0
FDKMJMEP_360.01.00.0
FDKMJMEP_370.01.00.0
FDKMJMEP_380.01.00.0
FDKMJMEP_391.00.01.0
FDKMJMEP_400.01.00.0
FDKMJMEP_410.01.00.0
FDKMJMEP_420.01.00.0
FDKMJMEP_430.01.00.0
FDKMJMEP_440.01.00.0
FDKMJMEP_450.01.00.0
FDKMJMEP_460.01.00.0
FDKMJMEP_470.01.00.0
FDKMJMEP_480.01.00.0
FDKMJMEP_491.00.01.0
FDKMJMEP_500.01.00.0
FDKMJMEP_510.01.00.0
FDKMJMEP_520.01.00.0
FDKMJMEP_530.01.00.0
FDKMJMEP_540.01.00.0
FDKMJMEP_551.00.01.0
FDKMJMEP_560.01.00.0
FDKMJMEP_570.01.00.0
FDKMJMEP_580.01.00.0
FDKMJMEP_590.01.00.0
FDKMJMEP_600.01.00.0
FDKMJMEP_610.01.00.0
FDKMJMEP_620.01.00.0
FDKMJMEP_630.01.00.0
FDKMJMEP_640.01.00.0
FDKMJMEP_650.01.00.0
FDKMJMEP_660.01.00.0
FDKMJMEP_670.01.00.0
FDKMJMEP_680.01.00.0
FDKMJMEP_690.01.00.0
FDKMJMEP_700.01.00.0
FDKMJMEP_710.01.00.0
FDKMJMEP_720.01.00.0
FDKMJMEP_730.01.00.0
FDKMJMEP_740.01.00.0
FDKMJMEP_751.00.01.0
FDKMJMEP_760.01.00.0
FDKMJMEP_771.00.01.0
FDKMJMEP_780.01.00.0
FDKMJMEP_790.01.00.0
FDKMJMEP_800.01.00.0
FDKMJMEP_810.01.00.0
FDKMJMEP_820.01.00.0
FDKMJMEP_830.01.00.0
FDKMJMEP_840.01.00.0
FDKMJMEP_850.01.00.0
FDKMJMEP_861.00.01.0
FDKMJMEP_870.01.00.0
FDKMJMEP_880.01.00.0
FDKMJMEP_890.01.00.0
FDKMJMEP_900.01.00.0
FDKMJMEP_910.01.00.0
FDKMJMEP_920.01.00.0
FDKMJMEP_930.01.00.0
FDKMJMEP_940.01.00.0
FDKMJMEP_950.01.00.0
FDKMJMEP_960.01.00.0
FDKMJMEP_970.01.00.0
FDKMJMEP_980.01.00.0
FDKMJMEP_990.01.00.0
FDKMJMEP_1000.01.00.0
FDKMJMEP_1010.01.00.0
FDKMJMEP_1020.01.00.0
FDKMJMEP_1030.01.00.0
FDKMJMEP_1040.01.00.0
FDKMJMEP_1050.01.00.0
FDKMJMEP_1060.01.00.0
FDKMJMEP_1070.01.00.0
FDKMJMEP_1080.01.00.0
FDKMJMEP_1091.00.01.0
FDKMJMEP_1101.00.01.0
FDKMJMEP_1110.01.00.0
FDKMJMEP_1120.01.00.0
FDKMJMEP_1130.01.00.0
FDKMJMEP_1140.01.00.0
FDKMJMEP_1150.01.00.0
FDKMJMEP_1160.01.00.0
FDKMJMEP_1170.01.00.0
FDKMJMEP_1180.01.00.0
FDKMJMEP_1190.01.00.0
FDKMJMEP_1200.01.00.0
FDKMJMEP_1210.01.00.0
FDKMJMEP_1220.01.00.0
FDKMJMEP_1230.01.00.0
FDKMJMEP_1241.00.01.0
FDKMJMEP_1250.01.00.0
FDKMJMEP_1260.01.00.0
FDKMJMEP_1270.01.00.0
FDKMJMEP_1280.01.00.0
FDKMJMEP_1290.01.00.0
FDKMJMEP_1300.01.00.0
FDKMJMEP_1310.01.00.0
FDKMJMEP_1320.01.00.0
FDKMJMEP_1330.01.00.0
FDKMJMEP_1340.01.00.0
FDKMJMEP_1350.01.00.0
FDKMJMEP_1360.01.00.0
FDKMJMEP_1370.01.00.0
FDKMJMEP_1380.01.00.0
FDKMJMEP_1390.01.00.0
FDKMJMEP_1400.01.00.0
FDKMJMEP_1410.01.00.0
FDKMJMEP_1420.01.00.0
FDKMJMEP_1430.01.00.0
FDKMJMEP_1440.01.00.0
FDKMJMEP_1450.01.00.0
FDKMJMEP_1460.01.00.0
FDKMJMEP_1470.01.00.0
FDKMJMEP_1480.01.00.0
FDKMJMEP_1490.01.00.0
FDKMJMEP_1500.01.00.0
FDKMJMEP_1510.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
No hit found

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements