Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
MDNPHBBN_11.00.01.0
MDNPHBBN_20.01.00.0
MDNPHBBN_30.01.00.0
MDNPHBBN_41.00.01.0
MDNPHBBN_51.00.01.0
MDNPHBBN_60.01.00.0
MDNPHBBN_71.00.01.0
MDNPHBBN_80.01.00.0
MDNPHBBN_91.00.01.0
MDNPHBBN_101.00.01.0
MDNPHBBN_110.01.00.0
MDNPHBBN_121.00.01.0
MDNPHBBN_131.00.01.0
MDNPHBBN_140.01.00.0
MDNPHBBN_150.01.00.0
MDNPHBBN_161.00.01.0
MDNPHBBN_171.00.01.0
MDNPHBBN_180.01.00.0
MDNPHBBN_190.01.00.0
MDNPHBBN_200.01.00.0
MDNPHBBN_211.00.01.0
MDNPHBBN_221.00.01.0
MDNPHBBN_230.01.00.0
MDNPHBBN_240.01.00.0
MDNPHBBN_251.00.01.0
MDNPHBBN_260.01.00.0
MDNPHBBN_271.00.01.0
MDNPHBBN_280.01.00.0
MDNPHBBN_290.01.00.0
MDNPHBBN_301.00.01.0
MDNPHBBN_311.00.01.0
MDNPHBBN_320.01.00.0
MDNPHBBN_331.00.01.0
MDNPHBBN_340.01.00.0
MDNPHBBN_351.00.01.0
MDNPHBBN_370.01.00.0
MDNPHBBN_381.00.01.0
MDNPHBBN_391.00.01.0
MDNPHBBN_400.01.00.0
MDNPHBBN_410.01.00.0
MDNPHBBN_420.01.00.0
MDNPHBBN_430.01.00.0
MDNPHBBN_440.01.00.0
MDNPHBBN_450.01.00.0
MDNPHBBN_461.00.01.0
MDNPHBBN_470.01.00.0
MDNPHBBN_481.00.01.0
MDNPHBBN_490.01.00.0
MDNPHBBN_501.00.01.0
MDNPHBBN_510.01.00.0
MDNPHBBN_520.01.00.0
MDNPHBBN_530.01.00.0
MDNPHBBN_540.01.00.0
MDNPHBBN_550.01.00.0
MDNPHBBN_560.01.00.0
MDNPHBBN_571.00.01.0
MDNPHBBN_580.01.00.0
MDNPHBBN_590.01.00.0
MDNPHBBN_600.01.00.0
MDNPHBBN_611.00.01.0
MDNPHBBN_620.01.00.0
MDNPHBBN_630.01.00.0
MDNPHBBN_640.01.00.0
MDNPHBBN_651.00.01.0
MDNPHBBN_661.00.01.0
MDNPHBBN_671.00.01.0
MDNPHBBN_680.01.00.0
MDNPHBBN_690.01.00.0
MDNPHBBN_700.01.00.0
MDNPHBBN_711.00.01.0
MDNPHBBN_720.01.00.0
MDNPHBBN_730.01.00.0
MDNPHBBN_740.01.00.0
MDNPHBBN_751.00.01.0
MDNPHBBN_770.01.00.0
MDNPHBBN_781.00.01.0
MDNPHBBN_790.01.00.0
MDNPHBBN_800.01.00.0
MDNPHBBN_810.01.00.0
MDNPHBBN_820.01.00.0
MDNPHBBN_830.01.00.0
MDNPHBBN_841.00.01.0
MDNPHBBN_851.00.01.0
MDNPHBBN_860.01.00.0
MDNPHBBN_870.01.00.0
MDNPHBBN_880.01.00.0
MDNPHBBN_890.01.00.0
MDNPHBBN_901.00.01.0
MDNPHBBN_911.00.01.0
MDNPHBBN_920.01.00.0
MDNPHBBN_930.01.00.0
MDNPHBBN_940.01.00.0
MDNPHBBN_951.00.01.0
MDNPHBBN_960.01.00.0
MDNPHBBN_971.00.01.0
MDNPHBBN_980.01.00.0
MDNPHBBN_991.00.01.0
MDNPHBBN_1000.01.00.0
MDNPHBBN_1010.01.00.0
MDNPHBBN_1020.01.00.0
MDNPHBBN_1031.00.01.0
MDNPHBBN_1040.01.00.0
MDNPHBBN_1050.01.00.0
MDNPHBBN_1061.00.01.0
MDNPHBBN_1070.01.00.0
MDNPHBBN_1080.01.00.0
MDNPHBBN_1090.01.00.0
MDNPHBBN_1100.01.00.0
MDNPHBBN_1110.01.00.0
MDNPHBBN_1121.00.01.0
MDNPHBBN_1130.01.00.0
MDNPHBBN_1141.00.01.0
MDNPHBBN_1151.00.01.0
MDNPHBBN_1161.00.01.0
MDNPHBBN_1170.01.00.0
MDNPHBBN_1181.00.01.0
MDNPHBBN_1190.01.00.0
MDNPHBBN_1200.01.00.0
MDNPHBBN_1211.00.01.0
MDNPHBBN_1221.00.01.0
MDNPHBBN_1231.00.01.0
MDNPHBBN_1240.01.00.0
MDNPHBBN_1251.00.01.0
MDNPHBBN_1261.00.01.0
MDNPHBBN_1271.00.01.0
MDNPHBBN_1280.01.00.0
MDNPHBBN_1291.00.01.0
MDNPHBBN_1301.00.01.0
MDNPHBBN_1310.01.00.0
MDNPHBBN_1320.01.00.0
MDNPHBBN_1331.00.01.0
MDNPHBBN_1341.00.01.0
MDNPHBBN_1351.00.01.0
MDNPHBBN_1360.01.00.0
MDNPHBBN_1371.00.01.0
MDNPHBBN_1380.01.00.0
MDNPHBBN_1391.00.01.0
MDNPHBBN_1400.01.00.0
MDNPHBBN_1410.01.00.0
MDNPHBBN_1420.01.00.0
MDNPHBBN_1431.00.01.0
MDNPHBBN_1440.01.00.0
MDNPHBBN_1450.01.00.0
MDNPHBBN_1460.01.00.0
MDNPHBBN_1470.01.00.0
MDNPHBBN_1480.01.00.0
MDNPHBBN_1491.00.01.0
MDNPHBBN_1501.00.01.0
MDNPHBBN_1511.00.01.0
MDNPHBBN_1520.01.00.0
MDNPHBBN_1531.00.01.0
MDNPHBBN_1540.01.00.0
MDNPHBBN_1550.01.00.0
MDNPHBBN_1561.00.01.0
MDNPHBBN_1571.00.01.0
MDNPHBBN_1580.01.00.0
MDNPHBBN_1590.01.00.0
MDNPHBBN_1600.01.00.0
MDNPHBBN_1611.00.01.0
MDNPHBBN_1620.01.00.0
MDNPHBBN_1631.00.01.0
MDNPHBBN_1640.01.00.0
MDNPHBBN_1650.01.00.0
MDNPHBBN_1660.01.00.0
MDNPHBBN_1670.01.00.0
MDNPHBBN_1681.00.01.0
MDNPHBBN_1691.00.01.0
MDNPHBBN_1701.00.01.0
MDNPHBBN_1711.00.01.0
MDNPHBBN_1721.00.01.0
MDNPHBBN_1730.01.00.0
MDNPHBBN_1740.01.00.0
MDNPHBBN_1751.00.01.0
MDNPHBBN_1760.01.00.0
MDNPHBBN_1770.01.00.0
MDNPHBBN_1780.01.00.0
MDNPHBBN_1790.01.00.0
MDNPHBBN_1801.00.01.0
MDNPHBBN_1810.01.00.0
MDNPHBBN_1820.01.00.0
MDNPHBBN_1830.01.00.0
MDNPHBBN_1841.00.01.0
MDNPHBBN_1850.01.00.0
MDNPHBBN_1861.00.01.0
MDNPHBBN_1870.01.00.0
MDNPHBBN_1881.00.01.0
MDNPHBBN_1890.01.00.0
MDNPHBBN_1900.01.00.0
MDNPHBBN_1911.00.01.0
MDNPHBBN_1921.00.01.0
MDNPHBBN_1930.01.00.0
MDNPHBBN_1950.01.00.0
MDNPHBBN_1961.00.01.0
MDNPHBBN_1970.01.00.0
MDNPHBBN_1981.00.01.0
MDNPHBBN_1990.01.00.0
MDNPHBBN_2000.01.00.0
MDNPHBBN_2010.01.00.0
MDNPHBBN_2020.01.00.0
MDNPHBBN_2031.00.01.0
MDNPHBBN_2040.01.00.0
MDNPHBBN_2050.01.00.0
MDNPHBBN_2061.00.01.0
MDNPHBBN_2070.01.00.0
MDNPHBBN_2081.00.01.0
MDNPHBBN_2091.00.01.0
MDNPHBBN_2101.00.01.0
MDNPHBBN_2111.00.01.0
MDNPHBBN_2120.01.00.0
MDNPHBBN_2131.00.01.0
MDNPHBBN_2140.01.00.0
MDNPHBBN_2151.00.01.0
MDNPHBBN_2160.01.00.0
MDNPHBBN_2170.01.00.0
MDNPHBBN_2181.00.01.0
MDNPHBBN_2191.00.01.0
MDNPHBBN_2200.01.00.0
MDNPHBBN_2210.01.00.0
MDNPHBBN_2220.01.00.0
MDNPHBBN_2230.01.00.0
MDNPHBBN_2240.01.00.0
MDNPHBBN_2250.01.00.0
MDNPHBBN_2260.01.00.0
MDNPHBBN_2270.01.00.0
MDNPHBBN_2280.01.00.0
MDNPHBBN_2291.00.01.0
MDNPHBBN_2300.01.00.0
MDNPHBBN_2310.01.00.0
MDNPHBBN_2321.00.01.0
MDNPHBBN_2331.00.01.0
MDNPHBBN_2341.00.01.0
MDNPHBBN_2351.00.01.0
MDNPHBBN_2361.00.01.0
MDNPHBBN_2370.01.00.0
MDNPHBBN_2381.00.01.0
MDNPHBBN_2390.01.00.0
MDNPHBBN_2400.01.00.0
MDNPHBBN_2411.00.01.0
MDNPHBBN_2421.00.01.0
MDNPHBBN_2430.01.00.0
MDNPHBBN_2440.01.00.0
MDNPHBBN_2450.01.00.0
MDNPHBBN_2460.01.00.0
MDNPHBBN_2470.01.00.0
MDNPHBBN_2480.01.00.0
MDNPHBBN_2491.00.01.0
MDNPHBBN_2501.00.01.0
MDNPHBBN_2510.01.00.0
MDNPHBBN_2520.01.00.0
MDNPHBBN_2530.01.00.0
MDNPHBBN_2541.00.01.0
MDNPHBBN_2550.01.00.0
MDNPHBBN_2561.00.01.0
MDNPHBBN_2571.00.01.0
MDNPHBBN_2581.00.01.0
MDNPHBBN_2590.01.00.0
MDNPHBBN_2600.01.00.0
MDNPHBBN_2610.01.00.0
MDNPHBBN_2620.01.00.0
MDNPHBBN_2631.00.01.0
MDNPHBBN_2641.00.01.0
MDNPHBBN_2660.01.00.0
MDNPHBBN_2671.00.01.0
MDNPHBBN_2680.01.00.0
MDNPHBBN_2691.00.01.0
MDNPHBBN_2700.01.00.0
MDNPHBBN_2710.01.00.0
MDNPHBBN_2720.01.00.0
MDNPHBBN_2730.01.00.0
MDNPHBBN_2741.00.01.0
MDNPHBBN_2751.00.01.0
MDNPHBBN_2761.00.01.0
MDNPHBBN_2771.00.01.0
MDNPHBBN_2781.00.01.0
MDNPHBBN_2790.01.00.0
MDNPHBBN_2801.00.01.0
MDNPHBBN_2810.01.00.0
MDNPHBBN_2821.00.01.0
MDNPHBBN_2830.01.00.0
MDNPHBBN_2841.00.01.0
MDNPHBBN_2851.00.01.0
MDNPHBBN_2861.00.01.0
MDNPHBBN_2870.01.00.0
MDNPHBBN_2881.00.01.0
MDNPHBBN_2891.00.01.0
MDNPHBBN_2901.00.01.0
MDNPHBBN_2911.00.01.0
MDNPHBBN_2920.01.00.0
MDNPHBBN_2930.01.00.0
MDNPHBBN_2941.00.01.0
MDNPHBBN_2951.00.01.0
MDNPHBBN_2960.01.00.0
MDNPHBBN_2970.01.00.0
MDNPHBBN_2981.00.01.0
MDNPHBBN_2990.01.00.0
MDNPHBBN_3000.01.00.0
MDNPHBBN_3010.01.00.0
MDNPHBBN_3021.00.01.0
MDNPHBBN_3031.00.01.0
MDNPHBBN_3041.00.01.0
MDNPHBBN_3050.01.00.0
MDNPHBBN_3060.01.00.0
MDNPHBBN_3071.00.01.0
MDNPHBBN_3081.00.01.0
MDNPHBBN_3091.00.01.0
MDNPHBBN_3101.00.01.0
MDNPHBBN_3110.01.00.0
MDNPHBBN_3120.01.00.0
MDNPHBBN_3130.01.00.0
MDNPHBBN_3141.00.01.0
MDNPHBBN_3150.01.00.0
MDNPHBBN_3160.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
MDNPHBBN_203011553583FalseSiphoviridaeVOG0226,
MDNPHBBN_67820816644FalseMyoviridaeVOG4662,
MDNPHBBN_1871502117542FalseMyoviridaeVOG8520,
MDNPHBBN_214544527444FalseMyoviridaeVOG0979,
MDNPHBBN_310572523125FalseSiphoviridaeVOG4360,

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements