Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0011.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
BFBAALIL_74954249739CspA8.60e-30cold shock protein86.36100.00CAA62903
BFBAALIL_74954249736CspR1.56e-28cold shock protein84.6198.48AAO82613

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
BFBAALIL_10.01.00.0
BFBAALIL_20.01.00.0
BFBAALIL_30.01.00.0
BFBAALIL_40.01.00.0
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BFBAALIL_60.01.00.0
BFBAALIL_70.01.00.0
BFBAALIL_80.01.00.0
BFBAALIL_90.01.00.0
BFBAALIL_100.01.00.0
BFBAALIL_110.01.00.0
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BFBAALIL_130.01.00.0
BFBAALIL_140.01.00.0
BFBAALIL_150.01.00.0
BFBAALIL_160.01.00.0
BFBAALIL_170.01.00.0
BFBAALIL_180.01.00.0
BFBAALIL_190.01.00.0
BFBAALIL_200.01.00.0
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BFBAALIL_580.01.00.0
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BFBAALIL_600.01.00.0
BFBAALIL_610.01.00.0
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BFBAALIL_631.00.01.0
BFBAALIL_650.01.00.0
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BFBAALIL_670.01.00.0
BFBAALIL_681.00.01.0
BFBAALIL_691.00.01.0
BFBAALIL_701.00.01.0
BFBAALIL_720.01.00.0
BFBAALIL_731.00.01.0
BFBAALIL_741.00.01.0
BFBAALIL_751.00.01.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
BFBAALIL_24882287335FalseSiphoviridaeVOG5897, VOG4615, VOG0703, VOG1637, VOG10223, VOG4856, VOG9997, VOG10972, VOG3462, VOG0801, VOG6163, VOG9471, VOG2225, VOG4586, VOG0704, VOG0539, VOG4589, VOG0204, VOG4553, VOG4568, VOG4556, VOG4544, VOG4581, VOG4841, VOG4618, VOG0198, VOG4566, VOG0226, VOG0186, VOG1309, VOG2228, VOG2228, VOG1638, VOG1300, VOG4552, VOG9667, VOG0862
BFBAALIL_28915016525FalseMyoviridaeVOG0083, VOG0382, VOG0384, VOG0205, VOG0226

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements