Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
2002.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
OMNAFOGA_45022522746lnuCARO:3002837lnuC95.73100.00AY928180.1

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
OMNAFOGA_45022522746lnu(C)Lincomycin97.58100.00AY928180

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
gnl|Prokka|OMNAFOGA_45022552746lnu(C)lincosamide nucleotidyltransferase Lnu(C)BLASTX95.73100.00WP_063851341.1

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
OMNAFOGA_11.00.01.0
OMNAFOGA_20.01.00.0
OMNAFOGA_31.00.01.0
OMNAFOGA_40.01.00.0
OMNAFOGA_51.00.01.0
OMNAFOGA_60.01.00.0
OMNAFOGA_70.01.00.0
OMNAFOGA_80.01.00.0
OMNAFOGA_91.00.01.0
OMNAFOGA_101.00.01.0
OMNAFOGA_110.01.00.0
OMNAFOGA_121.00.01.0
OMNAFOGA_131.00.01.0
OMNAFOGA_141.00.01.0
OMNAFOGA_151.00.01.0
OMNAFOGA_161.00.01.0
OMNAFOGA_170.01.00.0
OMNAFOGA_180.01.00.0
OMNAFOGA_191.00.01.0
OMNAFOGA_201.00.01.0
OMNAFOGA_211.00.01.0
OMNAFOGA_221.00.01.0
OMNAFOGA_231.00.01.0
OMNAFOGA_241.00.01.0
OMNAFOGA_251.00.01.0
OMNAFOGA_261.00.01.0
OMNAFOGA_271.00.01.0
OMNAFOGA_281.00.01.0
OMNAFOGA_290.01.00.0
OMNAFOGA_301.00.01.0
OMNAFOGA_310.01.00.0
OMNAFOGA_321.00.01.0
OMNAFOGA_330.01.00.0
OMNAFOGA_340.01.00.0
OMNAFOGA_351.00.01.0
OMNAFOGA_361.00.01.0
OMNAFOGA_370.01.00.0
OMNAFOGA_381.00.01.0
OMNAFOGA_391.00.01.0
OMNAFOGA_400.01.00.0
OMNAFOGA_411.00.01.0
OMNAFOGA_420.01.00.0
OMNAFOGA_430.01.00.0
OMNAFOGA_441.00.01.0
OMNAFOGA_451.00.01.0
OMNAFOGA_460.01.00.0
OMNAFOGA_471.00.01.0
OMNAFOGA_481.00.01.0
OMNAFOGA_490.01.00.0
OMNAFOGA_501.00.01.0
OMNAFOGA_511.00.01.0
OMNAFOGA_521.00.01.0
OMNAFOGA_531.00.01.0
OMNAFOGA_540.01.00.0
OMNAFOGA_550.01.00.0
OMNAFOGA_561.00.01.0
OMNAFOGA_570.01.00.0
OMNAFOGA_581.00.01.0
OMNAFOGA_591.00.01.0
OMNAFOGA_600.01.00.0
OMNAFOGA_611.00.01.0
OMNAFOGA_620.01.00.0
OMNAFOGA_631.00.01.0
OMNAFOGA_641.00.01.0
OMNAFOGA_650.01.00.0
OMNAFOGA_661.00.01.0
OMNAFOGA_671.00.01.0
OMNAFOGA_680.01.00.0
OMNAFOGA_690.01.00.0
OMNAFOGA_701.00.01.0
OMNAFOGA_710.01.00.0
OMNAFOGA_720.01.00.0
OMNAFOGA_731.00.01.0
OMNAFOGA_740.01.00.0
OMNAFOGA_751.00.01.0
OMNAFOGA_760.01.00.0
OMNAFOGA_771.00.01.0
OMNAFOGA_780.01.00.0
OMNAFOGA_790.01.00.0
OMNAFOGA_800.01.00.0
OMNAFOGA_811.00.01.0
OMNAFOGA_820.01.00.0
OMNAFOGA_831.00.01.0
OMNAFOGA_841.00.01.0
OMNAFOGA_851.00.01.0
OMNAFOGA_861.00.01.0
OMNAFOGA_871.00.01.0
OMNAFOGA_881.00.01.0
OMNAFOGA_890.01.00.0
OMNAFOGA_901.00.01.0
OMNAFOGA_910.01.00.0
OMNAFOGA_921.00.01.0
OMNAFOGA_941.00.01.0
OMNAFOGA_951.00.01.0
OMNAFOGA_961.00.01.0
OMNAFOGA_970.01.00.0
OMNAFOGA_981.00.01.0
OMNAFOGA_991.00.01.0
OMNAFOGA_1001.00.01.0
OMNAFOGA_1010.01.00.0
OMNAFOGA_1030.01.00.0
OMNAFOGA_1040.01.00.0
OMNAFOGA_1050.01.00.0
OMNAFOGA_1060.01.00.0
OMNAFOGA_1070.01.00.0
OMNAFOGA_1080.01.00.0
OMNAFOGA_1090.01.00.0
OMNAFOGA_1101.00.01.0
OMNAFOGA_1111.00.01.0
OMNAFOGA_1121.00.01.0
OMNAFOGA_1130.01.00.0
OMNAFOGA_1141.00.01.0
OMNAFOGA_1151.00.01.0
OMNAFOGA_1160.01.00.0
OMNAFOGA_1171.00.01.0
OMNAFOGA_1191.00.01.0
OMNAFOGA_1201.00.01.0
OMNAFOGA_1210.01.00.0
OMNAFOGA_1220.01.00.0
OMNAFOGA_1230.01.00.0
OMNAFOGA_1241.00.01.0
OMNAFOGA_1250.01.00.0
OMNAFOGA_1260.01.00.0
OMNAFOGA_1271.00.01.0
OMNAFOGA_1281.00.01.0
OMNAFOGA_1291.00.01.0
OMNAFOGA_1310.01.00.0
OMNAFOGA_1321.00.01.0
OMNAFOGA_1330.01.00.0
OMNAFOGA_1341.00.01.0
OMNAFOGA_1350.01.00.0
OMNAFOGA_1361.00.01.0
OMNAFOGA_1370.01.00.0
OMNAFOGA_1381.00.01.0
OMNAFOGA_1390.01.00.0
OMNAFOGA_1401.00.01.0
OMNAFOGA_1410.01.00.0
OMNAFOGA_1420.01.00.0
OMNAFOGA_1431.00.01.0
OMNAFOGA_1440.01.00.0
OMNAFOGA_1451.00.01.0
OMNAFOGA_1460.01.00.0
OMNAFOGA_1470.01.00.0
OMNAFOGA_1481.00.01.0
OMNAFOGA_1491.00.01.0
OMNAFOGA_1500.01.00.0
OMNAFOGA_1511.00.01.0
OMNAFOGA_1520.01.00.0
OMNAFOGA_1531.00.01.0
OMNAFOGA_1540.01.00.0
OMNAFOGA_1551.00.01.0
OMNAFOGA_1561.00.01.0
OMNAFOGA_1571.00.01.0
OMNAFOGA_1581.00.01.0
OMNAFOGA_1590.01.00.0
OMNAFOGA_1600.01.00.0
OMNAFOGA_1610.01.00.0
OMNAFOGA_1621.00.01.0
OMNAFOGA_1630.01.00.0
OMNAFOGA_1640.01.00.0
OMNAFOGA_1651.00.01.0
OMNAFOGA_1661.00.01.0
OMNAFOGA_1670.01.00.0
OMNAFOGA_1681.00.01.0
OMNAFOGA_1691.00.01.0
OMNAFOGA_1700.01.00.0
OMNAFOGA_1711.00.01.0
OMNAFOGA_1720.01.00.0
OMNAFOGA_1731.00.01.0
OMNAFOGA_1741.00.01.0
OMNAFOGA_1750.01.00.0
OMNAFOGA_1761.00.01.0
OMNAFOGA_1770.01.00.0
OMNAFOGA_1781.00.01.0
OMNAFOGA_1790.01.00.0
OMNAFOGA_1801.00.01.0
OMNAFOGA_1811.00.01.0
OMNAFOGA_1821.00.01.0
OMNAFOGA_1830.01.00.0
OMNAFOGA_1840.01.00.0
OMNAFOGA_1850.01.00.0
OMNAFOGA_1861.00.01.0
OMNAFOGA_1870.01.00.0
OMNAFOGA_1881.00.01.0
OMNAFOGA_1891.00.01.0
OMNAFOGA_1901.00.01.0
OMNAFOGA_1910.01.00.0
OMNAFOGA_1921.00.01.0
OMNAFOGA_1930.01.00.0
OMNAFOGA_1940.01.00.0
OMNAFOGA_1951.00.01.0
OMNAFOGA_1960.01.00.0
OMNAFOGA_1971.00.01.0
OMNAFOGA_1981.00.01.0
OMNAFOGA_1991.00.01.0
OMNAFOGA_2001.00.01.0
OMNAFOGA_2011.00.01.0
OMNAFOGA_2021.00.01.0
OMNAFOGA_2030.01.00.0
OMNAFOGA_2041.00.01.0
OMNAFOGA_2050.01.00.0
OMNAFOGA_2060.01.00.0
OMNAFOGA_2071.00.01.0
OMNAFOGA_2080.01.00.0
OMNAFOGA_2091.00.01.0
OMNAFOGA_2101.00.01.0
OMNAFOGA_2111.00.01.0
OMNAFOGA_2130.01.00.0
OMNAFOGA_2140.01.00.0
OMNAFOGA_2150.01.00.0
OMNAFOGA_2161.00.01.0
OMNAFOGA_2170.01.00.0
OMNAFOGA_2180.01.00.0
OMNAFOGA_2191.00.01.0
OMNAFOGA_2200.01.00.0
OMNAFOGA_2211.00.01.0
OMNAFOGA_2220.01.00.0
OMNAFOGA_2231.00.01.0
OMNAFOGA_2240.01.00.0
OMNAFOGA_2251.00.01.0
OMNAFOGA_2261.00.01.0
OMNAFOGA_2270.01.00.0
OMNAFOGA_2280.01.00.0
OMNAFOGA_2291.00.01.0
OMNAFOGA_2300.01.00.0
OMNAFOGA_2310.01.00.0
OMNAFOGA_2320.01.00.0
OMNAFOGA_2331.00.01.0
OMNAFOGA_2341.00.01.0
OMNAFOGA_2350.01.00.0
OMNAFOGA_2360.01.00.0
OMNAFOGA_2370.01.00.0
OMNAFOGA_2381.00.01.0
OMNAFOGA_2390.01.00.0
OMNAFOGA_2401.00.01.0
OMNAFOGA_2421.00.01.0
OMNAFOGA_2431.00.01.0
OMNAFOGA_2440.01.00.0
OMNAFOGA_2450.01.00.0
OMNAFOGA_2461.00.01.0
OMNAFOGA_2470.01.00.0
OMNAFOGA_2480.01.00.0
OMNAFOGA_2490.01.00.0
OMNAFOGA_2501.00.01.0
OMNAFOGA_2511.00.01.0
OMNAFOGA_2520.01.00.0
OMNAFOGA_2530.01.00.0
OMNAFOGA_2541.00.01.0
OMNAFOGA_2551.00.01.0
OMNAFOGA_2561.00.01.0
OMNAFOGA_2570.01.00.0
OMNAFOGA_2581.00.01.0
OMNAFOGA_2591.00.01.0
OMNAFOGA_2600.01.00.0
OMNAFOGA_2611.00.01.0
OMNAFOGA_2620.01.00.0
OMNAFOGA_2630.01.00.0
OMNAFOGA_2641.00.01.0
OMNAFOGA_2651.00.01.0
OMNAFOGA_2660.01.00.0
OMNAFOGA_2671.00.01.0
OMNAFOGA_2680.01.00.0
OMNAFOGA_2700.01.00.0
OMNAFOGA_2711.00.01.0
OMNAFOGA_2721.00.01.0
OMNAFOGA_2731.00.01.0
OMNAFOGA_2741.00.01.0
OMNAFOGA_2750.01.00.0
OMNAFOGA_2761.00.01.0
OMNAFOGA_2770.01.00.0
OMNAFOGA_2780.01.00.0
OMNAFOGA_2790.01.00.0
OMNAFOGA_2800.01.00.0
OMNAFOGA_2810.01.00.0
OMNAFOGA_2821.00.01.0
OMNAFOGA_2830.01.00.0
OMNAFOGA_2840.01.00.0
OMNAFOGA_2850.01.00.0
OMNAFOGA_2860.01.00.0
OMNAFOGA_2870.01.00.0
OMNAFOGA_2880.01.00.0
OMNAFOGA_2900.01.00.0
OMNAFOGA_2910.01.00.0
OMNAFOGA_2920.01.00.0
OMNAFOGA_2931.00.01.0
OMNAFOGA_2940.01.00.0
OMNAFOGA_2950.01.00.0
OMNAFOGA_2971.00.01.0
OMNAFOGA_2980.01.00.0
OMNAFOGA_2991.00.01.0
OMNAFOGA_3001.00.01.0
OMNAFOGA_3011.00.01.0
OMNAFOGA_3020.01.00.0
OMNAFOGA_3031.00.01.0
OMNAFOGA_3041.00.01.0
OMNAFOGA_3061.00.01.0
OMNAFOGA_3070.01.00.0
OMNAFOGA_3080.01.00.0
OMNAFOGA_3090.01.00.0
OMNAFOGA_3101.00.01.0
OMNAFOGA_3111.00.01.0
OMNAFOGA_3120.01.00.0
OMNAFOGA_3130.01.00.0
OMNAFOGA_3140.01.00.0
OMNAFOGA_3151.00.01.0
OMNAFOGA_3161.00.01.0
OMNAFOGA_3171.00.01.0
OMNAFOGA_3181.00.01.0
OMNAFOGA_3191.00.01.0
OMNAFOGA_3201.00.01.0
OMNAFOGA_3210.01.00.0
OMNAFOGA_3221.00.01.0
OMNAFOGA_3230.01.00.0
OMNAFOGA_3240.01.00.0
OMNAFOGA_3250.01.00.0
OMNAFOGA_3261.00.01.0
OMNAFOGA_3271.00.01.0
OMNAFOGA_3281.00.01.0
OMNAFOGA_3290.01.00.0
OMNAFOGA_3300.01.00.0
OMNAFOGA_3310.01.00.0
OMNAFOGA_3321.00.01.0
OMNAFOGA_3331.00.01.0
OMNAFOGA_3341.00.01.0
OMNAFOGA_3350.01.00.0
OMNAFOGA_3361.00.01.0
OMNAFOGA_3371.00.01.0
OMNAFOGA_3391.00.01.0
OMNAFOGA_3401.00.01.0
OMNAFOGA_3410.01.00.0
OMNAFOGA_3420.01.00.0
OMNAFOGA_3431.00.01.0
OMNAFOGA_3440.01.00.0
OMNAFOGA_3451.00.01.0
OMNAFOGA_3461.00.01.0
OMNAFOGA_3471.00.01.0
OMNAFOGA_3480.01.00.0
OMNAFOGA_3490.01.00.0
OMNAFOGA_3500.01.00.0
OMNAFOGA_3511.00.01.0
OMNAFOGA_3521.00.01.0
OMNAFOGA_3531.00.01.0
OMNAFOGA_3540.01.00.0
OMNAFOGA_3551.00.01.0
OMNAFOGA_3560.01.00.0
OMNAFOGA_3571.00.01.0
OMNAFOGA_3581.00.01.0
OMNAFOGA_3591.00.01.0
OMNAFOGA_3601.00.01.0
OMNAFOGA_3611.00.01.0
OMNAFOGA_3621.00.01.0
OMNAFOGA_3630.01.00.0
OMNAFOGA_3641.00.01.0
OMNAFOGA_3650.01.00.0
OMNAFOGA_3660.01.00.0
OMNAFOGA_3671.00.01.0
OMNAFOGA_3681.00.01.0
OMNAFOGA_3691.00.01.0
OMNAFOGA_3701.00.01.0
OMNAFOGA_3710.01.00.0
OMNAFOGA_3720.01.00.0
OMNAFOGA_3731.00.01.0
OMNAFOGA_3741.00.01.0
OMNAFOGA_3750.01.00.0
OMNAFOGA_3761.00.01.0
OMNAFOGA_3771.00.01.0
OMNAFOGA_3781.00.01.0
OMNAFOGA_3791.00.01.0
OMNAFOGA_3801.00.01.0
OMNAFOGA_3810.01.00.0
OMNAFOGA_3820.01.00.0
OMNAFOGA_3830.01.00.0
OMNAFOGA_3840.01.00.0
OMNAFOGA_3850.01.00.0
OMNAFOGA_3861.00.01.0
OMNAFOGA_3871.00.01.0
OMNAFOGA_3881.00.01.0
OMNAFOGA_3890.01.00.0
OMNAFOGA_3901.00.01.0
OMNAFOGA_3911.00.01.0
OMNAFOGA_3920.01.00.0
OMNAFOGA_3940.01.00.0
OMNAFOGA_3951.00.01.0
OMNAFOGA_3961.00.01.0
OMNAFOGA_3971.00.01.0
OMNAFOGA_3981.00.01.0
OMNAFOGA_3991.00.01.0
OMNAFOGA_4001.00.01.0
OMNAFOGA_4010.01.00.0
OMNAFOGA_4021.00.01.0
OMNAFOGA_4031.00.01.0
OMNAFOGA_4040.01.00.0
OMNAFOGA_4050.01.00.0
OMNAFOGA_4060.01.00.0
OMNAFOGA_4070.01.00.0
OMNAFOGA_4080.01.00.0
OMNAFOGA_4091.00.01.0
OMNAFOGA_4101.00.01.0
OMNAFOGA_4110.01.00.0
OMNAFOGA_4130.01.00.0
OMNAFOGA_4141.00.01.0
OMNAFOGA_4151.00.01.0
OMNAFOGA_4161.00.01.0
OMNAFOGA_4171.00.01.0
OMNAFOGA_4180.01.00.0
OMNAFOGA_4190.01.00.0
OMNAFOGA_4200.01.00.0
OMNAFOGA_4210.01.00.0
OMNAFOGA_4220.01.00.0
OMNAFOGA_4241.00.01.0
OMNAFOGA_4251.00.01.0
OMNAFOGA_4260.01.00.0
OMNAFOGA_4271.00.01.0
OMNAFOGA_4280.01.00.0
OMNAFOGA_4291.00.01.0
OMNAFOGA_4301.00.01.0
OMNAFOGA_4310.01.00.0
OMNAFOGA_4321.00.01.0
OMNAFOGA_4331.00.01.0
OMNAFOGA_4340.01.00.0
OMNAFOGA_4351.00.01.0
OMNAFOGA_4361.00.01.0
OMNAFOGA_4370.01.00.0
OMNAFOGA_4381.00.01.0
OMNAFOGA_4401.00.01.0
OMNAFOGA_4410.01.00.0
OMNAFOGA_4421.00.01.0
OMNAFOGA_4431.00.01.0
OMNAFOGA_4440.01.00.0
OMNAFOGA_4451.00.01.0
OMNAFOGA_4461.00.01.0
OMNAFOGA_4470.01.00.0
OMNAFOGA_4481.00.01.0
OMNAFOGA_4491.00.01.0
OMNAFOGA_4501.00.01.0
OMNAFOGA_4511.00.01.0
OMNAFOGA_4520.01.00.0
OMNAFOGA_4531.00.01.0
OMNAFOGA_4540.01.00.0
OMNAFOGA_4550.01.00.0
OMNAFOGA_4561.00.01.0
OMNAFOGA_4571.00.01.0
OMNAFOGA_4581.00.01.0
OMNAFOGA_4591.00.01.0
OMNAFOGA_4600.01.00.0
OMNAFOGA_4610.01.00.0
OMNAFOGA_4621.00.01.0
OMNAFOGA_4630.01.00.0
OMNAFOGA_4641.00.01.0
OMNAFOGA_4651.00.01.0
OMNAFOGA_4660.01.00.0
OMNAFOGA_4670.01.00.0
OMNAFOGA_4681.00.01.0
OMNAFOGA_4690.01.00.0
OMNAFOGA_4700.01.00.0
OMNAFOGA_4710.01.00.0
OMNAFOGA_4721.00.01.0
OMNAFOGA_4730.01.00.0
OMNAFOGA_4740.01.00.0
OMNAFOGA_4751.00.01.0
OMNAFOGA_4761.00.01.0
OMNAFOGA_4771.00.01.0
OMNAFOGA_4781.00.01.0
OMNAFOGA_4791.00.01.0
OMNAFOGA_4801.00.01.0
OMNAFOGA_4810.01.00.0
OMNAFOGA_4820.01.00.0
OMNAFOGA_4841.00.01.0
OMNAFOGA_4851.00.01.0
OMNAFOGA_4860.01.00.0
OMNAFOGA_4870.01.00.0
OMNAFOGA_4881.00.01.0
OMNAFOGA_4890.01.00.0
OMNAFOGA_4901.00.01.0
OMNAFOGA_4910.01.00.0
OMNAFOGA_4921.00.01.0
OMNAFOGA_4931.00.01.0
OMNAFOGA_4940.01.00.0
OMNAFOGA_4951.00.01.0
OMNAFOGA_4961.00.01.0
OMNAFOGA_4970.01.00.0
OMNAFOGA_4981.00.01.0
OMNAFOGA_4991.00.01.0
OMNAFOGA_5001.00.01.0
OMNAFOGA_5011.00.01.0
OMNAFOGA_5021.00.01.0
OMNAFOGA_5031.00.01.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
No hit found

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements