Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
MDOHGMOA_10.01.00.0
MDOHGMOA_20.01.00.0
MDOHGMOA_30.01.00.0
MDOHGMOA_40.01.00.0
MDOHGMOA_50.01.00.0
MDOHGMOA_60.01.00.0
MDOHGMOA_70.01.00.0
MDOHGMOA_80.01.00.0
MDOHGMOA_90.01.00.0
MDOHGMOA_100.01.00.0
MDOHGMOA_110.01.00.0
MDOHGMOA_120.01.00.0
MDOHGMOA_130.01.00.0
MDOHGMOA_140.01.00.0
MDOHGMOA_150.01.00.0
MDOHGMOA_160.01.00.0
MDOHGMOA_170.01.00.0
MDOHGMOA_180.01.00.0
MDOHGMOA_190.01.00.0
MDOHGMOA_200.01.00.0
MDOHGMOA_210.01.00.0
MDOHGMOA_220.01.00.0
MDOHGMOA_230.01.00.0
MDOHGMOA_240.01.00.0
MDOHGMOA_250.01.00.0
MDOHGMOA_260.01.00.0
MDOHGMOA_270.01.00.0
MDOHGMOA_280.01.00.0
MDOHGMOA_290.01.00.0
MDOHGMOA_300.01.00.0
MDOHGMOA_310.01.00.0
MDOHGMOA_320.01.00.0
MDOHGMOA_330.01.00.0
MDOHGMOA_340.01.00.0
MDOHGMOA_350.01.00.0
MDOHGMOA_360.01.00.0
MDOHGMOA_370.01.00.0
MDOHGMOA_380.01.00.0
MDOHGMOA_390.01.00.0
MDOHGMOA_400.01.00.0
MDOHGMOA_410.01.00.0
MDOHGMOA_420.01.00.0
MDOHGMOA_430.01.00.0
MDOHGMOA_440.01.00.0
MDOHGMOA_450.01.00.0
MDOHGMOA_460.01.00.0
MDOHGMOA_470.01.00.0
MDOHGMOA_480.01.00.0
MDOHGMOA_490.01.00.0
MDOHGMOA_500.01.00.0
MDOHGMOA_510.01.00.0
MDOHGMOA_520.01.00.0
MDOHGMOA_530.01.00.0
MDOHGMOA_540.01.00.0
MDOHGMOA_550.01.00.0
MDOHGMOA_560.01.00.0
MDOHGMOA_570.01.00.0
MDOHGMOA_580.01.00.0
MDOHGMOA_590.01.00.0
MDOHGMOA_600.01.00.0
MDOHGMOA_610.01.00.0
MDOHGMOA_620.01.00.0
MDOHGMOA_630.01.00.0
MDOHGMOA_641.00.01.0
MDOHGMOA_650.01.00.0
MDOHGMOA_660.01.00.0
MDOHGMOA_670.01.00.0
MDOHGMOA_680.01.00.0
MDOHGMOA_690.01.00.0
MDOHGMOA_700.01.00.0
MDOHGMOA_710.01.00.0
MDOHGMOA_720.01.00.0
MDOHGMOA_730.01.00.0
MDOHGMOA_740.01.00.0
MDOHGMOA_750.01.00.0
MDOHGMOA_760.01.00.0
MDOHGMOA_770.01.00.0
MDOHGMOA_780.01.00.0
MDOHGMOA_790.01.00.0
MDOHGMOA_800.01.00.0
MDOHGMOA_810.01.00.0
MDOHGMOA_821.00.01.0
MDOHGMOA_830.01.00.0
MDOHGMOA_841.00.01.0
MDOHGMOA_850.01.00.0
MDOHGMOA_861.00.01.0
MDOHGMOA_871.00.01.0
MDOHGMOA_880.01.00.0
MDOHGMOA_890.01.00.0
MDOHGMOA_900.01.00.0
MDOHGMOA_910.01.00.0
MDOHGMOA_920.01.00.0
MDOHGMOA_930.01.00.0
MDOHGMOA_941.00.01.0
MDOHGMOA_951.00.01.0
MDOHGMOA_960.01.00.0
MDOHGMOA_970.01.00.0
MDOHGMOA_980.01.00.0
MDOHGMOA_990.01.00.0
MDOHGMOA_1000.01.00.0
MDOHGMOA_1010.01.00.0
MDOHGMOA_1020.01.00.0
MDOHGMOA_1030.01.00.0
MDOHGMOA_1040.01.00.0
MDOHGMOA_1050.01.00.0
MDOHGMOA_1060.01.00.0
MDOHGMOA_1070.01.00.0
MDOHGMOA_1080.01.00.0
MDOHGMOA_1091.00.01.0
MDOHGMOA_1100.01.00.0
MDOHGMOA_1110.01.00.0
MDOHGMOA_1120.01.00.0
MDOHGMOA_1130.01.00.0
MDOHGMOA_1140.01.00.0
MDOHGMOA_1150.01.00.0
MDOHGMOA_1161.00.01.0
MDOHGMOA_1170.01.00.0
MDOHGMOA_1180.01.00.0
MDOHGMOA_1190.01.00.0
MDOHGMOA_1200.01.00.0
MDOHGMOA_1211.00.01.0
MDOHGMOA_1220.01.00.0
MDOHGMOA_1231.00.01.0
MDOHGMOA_1241.00.01.0
MDOHGMOA_1250.01.00.0
MDOHGMOA_1260.01.00.0
MDOHGMOA_1270.01.00.0
MDOHGMOA_1281.00.01.0
MDOHGMOA_1291.00.01.0
MDOHGMOA_1301.00.01.0
MDOHGMOA_1310.01.00.0
MDOHGMOA_1321.00.01.0
MDOHGMOA_1330.01.00.0
MDOHGMOA_1340.01.00.0
MDOHGMOA_1351.00.01.0
MDOHGMOA_1361.00.01.0
MDOHGMOA_1371.00.01.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
MDOHGMOA_3124678138919FalseUnknownVOG8932,

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements