Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
NBNGLBFB_10.01.00.0
NBNGLBFB_21.00.01.0
NBNGLBFB_30.01.00.0
NBNGLBFB_40.01.00.0
NBNGLBFB_50.01.00.0
NBNGLBFB_60.01.00.0
NBNGLBFB_70.01.00.0
NBNGLBFB_80.01.00.0
NBNGLBFB_90.01.00.0
NBNGLBFB_100.01.00.0
NBNGLBFB_110.01.00.0
NBNGLBFB_120.01.00.0
NBNGLBFB_130.01.00.0
NBNGLBFB_140.01.00.0
NBNGLBFB_150.01.00.0
NBNGLBFB_161.00.01.0
NBNGLBFB_170.01.00.0
NBNGLBFB_180.01.00.0
NBNGLBFB_190.01.00.0
NBNGLBFB_200.01.00.0
NBNGLBFB_210.01.00.0
NBNGLBFB_220.01.00.0
NBNGLBFB_230.01.00.0
NBNGLBFB_240.01.00.0
NBNGLBFB_251.00.01.0
NBNGLBFB_260.01.00.0
NBNGLBFB_270.01.00.0
NBNGLBFB_280.01.00.0
NBNGLBFB_290.01.00.0
NBNGLBFB_301.00.01.0
NBNGLBFB_310.01.00.0
NBNGLBFB_321.00.01.0
NBNGLBFB_331.00.01.0
NBNGLBFB_340.01.00.0
NBNGLBFB_350.01.00.0
NBNGLBFB_360.01.00.0
NBNGLBFB_370.01.00.0
NBNGLBFB_380.01.00.0
NBNGLBFB_390.01.00.0
NBNGLBFB_400.01.00.0
NBNGLBFB_410.01.00.0
NBNGLBFB_420.01.00.0
NBNGLBFB_431.00.01.0
NBNGLBFB_440.01.00.0
NBNGLBFB_451.00.01.0
NBNGLBFB_461.00.01.0
NBNGLBFB_470.01.00.0
NBNGLBFB_480.01.00.0
NBNGLBFB_490.01.00.0
NBNGLBFB_500.01.00.0
NBNGLBFB_510.01.00.0
NBNGLBFB_520.01.00.0
NBNGLBFB_530.01.00.0
NBNGLBFB_540.01.00.0
NBNGLBFB_550.01.00.0
NBNGLBFB_560.01.00.0
NBNGLBFB_570.01.00.0
NBNGLBFB_580.01.00.0
NBNGLBFB_590.01.00.0
NBNGLBFB_600.01.00.0
NBNGLBFB_610.01.00.0
NBNGLBFB_620.01.00.0
NBNGLBFB_630.01.00.0
NBNGLBFB_640.01.00.0
NBNGLBFB_650.01.00.0
NBNGLBFB_660.01.00.0
NBNGLBFB_670.01.00.0
NBNGLBFB_680.01.00.0
NBNGLBFB_690.01.00.0
NBNGLBFB_700.01.00.0
NBNGLBFB_710.01.00.0
NBNGLBFB_720.01.00.0
NBNGLBFB_730.01.00.0
NBNGLBFB_740.01.00.0
NBNGLBFB_750.01.00.0
NBNGLBFB_761.00.01.0
NBNGLBFB_770.01.00.0
NBNGLBFB_780.01.00.0
NBNGLBFB_790.01.00.0
NBNGLBFB_800.01.00.0
NBNGLBFB_810.01.00.0
NBNGLBFB_820.01.00.0
NBNGLBFB_830.01.00.0
NBNGLBFB_841.00.01.0
NBNGLBFB_850.01.00.0
NBNGLBFB_860.01.00.0
NBNGLBFB_870.01.00.0
NBNGLBFB_881.00.01.0
NBNGLBFB_890.01.00.0
NBNGLBFB_900.01.00.0
NBNGLBFB_910.01.00.0
NBNGLBFB_920.01.00.0
NBNGLBFB_930.01.00.0
NBNGLBFB_940.01.00.0
NBNGLBFB_950.01.00.0
NBNGLBFB_961.00.01.0
NBNGLBFB_970.01.00.0
NBNGLBFB_980.01.00.0
NBNGLBFB_990.01.00.0
NBNGLBFB_1000.01.00.0
NBNGLBFB_1011.00.01.0
NBNGLBFB_1020.01.00.0
NBNGLBFB_1030.01.00.0
NBNGLBFB_1040.01.00.0
NBNGLBFB_1050.01.00.0
NBNGLBFB_1060.01.00.0
NBNGLBFB_1070.01.00.0
NBNGLBFB_1080.01.00.0
NBNGLBFB_1090.01.00.0
NBNGLBFB_1100.01.00.0
NBNGLBFB_1110.01.00.0
NBNGLBFB_1120.01.00.0
NBNGLBFB_1131.00.01.0
NBNGLBFB_1140.01.00.0
NBNGLBFB_1150.01.00.0
NBNGLBFB_1160.01.00.0
NBNGLBFB_1170.01.00.0
NBNGLBFB_1181.00.01.0
NBNGLBFB_1191.00.01.0
NBNGLBFB_1200.01.00.0
NBNGLBFB_1210.01.00.0
NBNGLBFB_1220.01.00.0
NBNGLBFB_1231.00.01.0
NBNGLBFB_1241.00.01.0
NBNGLBFB_1250.01.00.0
NBNGLBFB_1260.01.00.0
NBNGLBFB_1270.01.00.0
NBNGLBFB_1280.01.00.0
NBNGLBFB_1291.00.01.0
NBNGLBFB_1301.00.01.0
NBNGLBFB_1311.00.01.0
NBNGLBFB_1321.00.01.0
NBNGLBFB_1331.00.01.0
NBNGLBFB_1340.01.00.0
NBNGLBFB_1350.01.00.0
NBNGLBFB_1360.01.00.0
NBNGLBFB_1371.00.01.0
NBNGLBFB_1381.00.01.0
NBNGLBFB_1391.00.01.0
NBNGLBFB_1401.00.01.0
NBNGLBFB_1411.00.01.0
NBNGLBFB_1421.00.01.0
NBNGLBFB_1430.01.00.0
NBNGLBFB_1440.01.00.0
NBNGLBFB_1451.00.01.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
NBNGLBFB_525833086046FalseMyoviridaeVOG0376, VOG2545, VOG0796, VOG7407, VOG1912, VOG5027, VOG7237, VOG10904, VOG4918, VOG1915, VOG1942, VOG4778, VOG1353, VOG1881, VOG1883, VOG1352, VOG4699, VOG6163, VOG1956, VOG1433, VOG1348, VOG0573, VOG4550, VOG4691, VOG4845, VOG5334
NBNGLBFB_681698444723FalseSiphoviridaeVOG4705, VOG4904, VOG6540, VOG4687, VOG0083, VOG7017, VOG4659, VOG4633, VOG3179, VOG0660, VOG0209, VOG4586, VOG0207, VOG0205, VOG0204, VOG4553, VOG4573, VOG4556, VOG5051, VOG1886, VOG4581, VOG1648, VOG4841, VOG0198, VOG6005, VOG1698, VOG1446
NBNGLBFB_124204931212FalseMyoviridaeVOG9945, VOG4397, VOG5913, VOG0173, VOG4620, VOG4691, VOG4550, VOG0573, VOG1348, VOG1433, VOG1956, VOG8263, VOG4699, VOG1352, VOG1883, VOG1353, VOG4710, VOG1942, VOG1915, VOG5027, VOG1912, VOG7407

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements