Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
KMGCBMLA_10.01.00.0
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KMGCBMLA_70.01.00.0
KMGCBMLA_80.01.00.0
KMGCBMLA_90.01.00.0
KMGCBMLA_100.01.00.0
KMGCBMLA_110.01.00.0
KMGCBMLA_120.01.00.0
KMGCBMLA_130.01.00.0
KMGCBMLA_140.01.00.0
KMGCBMLA_150.01.00.0
KMGCBMLA_160.01.00.0
KMGCBMLA_170.01.00.0
KMGCBMLA_180.01.00.0
KMGCBMLA_190.01.00.0
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KMGCBMLA_210.01.00.0
KMGCBMLA_220.01.00.0
KMGCBMLA_230.01.00.0
KMGCBMLA_241.00.01.0
KMGCBMLA_250.01.00.0
KMGCBMLA_260.01.00.0
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KMGCBMLA_560.01.00.0
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KMGCBMLA_590.01.00.0
KMGCBMLA_600.01.00.0
KMGCBMLA_610.01.00.0
KMGCBMLA_621.00.01.0
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KMGCBMLA_651.00.01.0
KMGCBMLA_661.00.01.0
KMGCBMLA_670.01.00.0
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KMGCBMLA_690.01.00.0
KMGCBMLA_700.01.00.0
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KMGCBMLA_790.01.00.0
KMGCBMLA_800.01.00.0
KMGCBMLA_810.01.00.0
KMGCBMLA_820.01.00.0
KMGCBMLA_830.01.00.0
KMGCBMLA_840.01.00.0
KMGCBMLA_850.01.00.0
KMGCBMLA_860.01.00.0
KMGCBMLA_870.01.00.0
KMGCBMLA_880.01.00.0
KMGCBMLA_891.00.01.0
KMGCBMLA_900.01.00.0
KMGCBMLA_910.01.00.0
KMGCBMLA_920.01.00.0
KMGCBMLA_930.01.00.0
KMGCBMLA_940.01.00.0
KMGCBMLA_951.00.01.0
KMGCBMLA_960.01.00.0
KMGCBMLA_970.01.00.0
KMGCBMLA_980.01.00.0
KMGCBMLA_990.01.00.0
KMGCBMLA_1000.01.00.0
KMGCBMLA_1010.01.00.0
KMGCBMLA_1020.01.00.0
KMGCBMLA_1031.00.01.0
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KMGCBMLA_1060.01.00.0
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KMGCBMLA_1090.01.00.0
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KMGCBMLA_1150.01.00.0
KMGCBMLA_1160.01.00.0
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KMGCBMLA_1180.01.00.0
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KMGCBMLA_1210.01.00.0
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KMGCBMLA_1271.00.01.0
KMGCBMLA_1280.01.00.0
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KMGCBMLA_1311.00.01.0
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KMGCBMLA_1341.00.01.0
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KMGCBMLA_1370.01.00.0
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KMGCBMLA_1400.01.00.0
KMGCBMLA_1410.01.00.0
KMGCBMLA_1420.01.00.0
KMGCBMLA_1430.01.00.0
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KMGCBMLA_1460.01.00.0
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KMGCBMLA_1480.01.00.0
KMGCBMLA_1490.01.00.0
KMGCBMLA_1501.00.01.0
KMGCBMLA_1510.01.00.0
KMGCBMLA_1520.01.00.0
KMGCBMLA_1530.01.00.0
KMGCBMLA_1540.01.00.0
KMGCBMLA_1550.01.00.0
KMGCBMLA_1560.01.00.0
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KMGCBMLA_1600.01.00.0
KMGCBMLA_1610.01.00.0
KMGCBMLA_1621.00.01.0
KMGCBMLA_1631.00.01.0
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KMGCBMLA_1651.00.01.0
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KMGCBMLA_1681.00.01.0
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KMGCBMLA_1701.00.01.0
KMGCBMLA_1711.00.01.0
KMGCBMLA_1720.01.00.0
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KMGCBMLA_1740.01.00.0
KMGCBMLA_1750.01.00.0
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KMGCBMLA_1770.01.00.0
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KMGCBMLA_1791.00.01.0
KMGCBMLA_1800.01.00.0
KMGCBMLA_1810.01.00.0
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KMGCBMLA_1830.01.00.0
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KMGCBMLA_1861.00.01.0
KMGCBMLA_1871.00.01.0
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KMGCBMLA_2000.01.00.0
KMGCBMLA_2010.01.00.0
KMGCBMLA_2050.01.00.0
KMGCBMLA_2060.01.00.0
KMGCBMLA_2070.01.00.0
KMGCBMLA_2080.01.00.0
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KMGCBMLA_2101.00.01.0
KMGCBMLA_2111.00.01.0
KMGCBMLA_2121.00.01.0
KMGCBMLA_2131.00.01.0
KMGCBMLA_2140.01.00.0
KMGCBMLA_2151.00.01.0
KMGCBMLA_2160.01.00.0
KMGCBMLA_2171.00.01.0
KMGCBMLA_2180.01.00.0
KMGCBMLA_2191.00.01.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
KMGCBMLA_6874365102630FalseMyoviridaeVOG4693, VOG0198, VOG0376, VOG2545, VOG0796, VOG7407, VOG1912, VOG5027, VOG4918, VOG1915, VOG1942, VOG4778, VOG1353, VOG1881, VOG1883, VOG1352, VOG4699, VOG6163, VOG1956, VOG1433, VOG1348, VOG0573, VOG4550, VOG4691
KMGCBMLA_87305726019FalseMyoviridaeVOG0573, VOG1348, VOG1433, VOG1956, VOG4699, VOG1352, VOG1883, VOG1353, VOG4710, VOG1942, VOG1915, VOG4564, VOG1912, VOG7407, VOG1837, VOG4618, VOG0638, VOG8269, VOG0198
KMGCBMLA_873801641975FalseMyoviridae / SiphoviridaeVOG10735, VOG4995, VOG2215, VOG9667, VOG4602, VOG1561
KMGCBMLA_1094143268301FalseSiphoviridaeVOG7017, VOG0861, VOG4705, VOG9945, VOG6540, VOG0083, VOG7017, VOG4659, VOG4633, VOG4545, VOG0209, VOG4586, VOG0207, VOG0205, VOG0204, VOG4553, VOG4573, VOG4556, VOG0202, VOG1886, VOG4581, VOG4841, VOG0198, VOG3349, VOG0327
KMGCBMLA_1097645277865FalseSiphoviridaeVOG10904, VOG4611, VOG9708
KMGCBMLA_1133252736243FalseMyoviridae / SiphoviridaeVOG6955, VOG9667, VOG2228, VOG4799, VOG8288, VOG5458

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements