Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0022.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
PIELPEOG_39278923279627WalR2.74e-112transcriptional regulatory protein83.40100.00EPH95667
PIELPEOG_201013410331CspR9.50e-34cold shock protein89.39100.00AAO82613

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
PIELPEOG_2977038764repUS741064 / 106292.20CP000424
PIELPEOG_5243185253rep28937 / 93681.96CP005948

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
PIELPEOG_110.01.00.0
PIELPEOG_190.01.00.0
PIELPEOG_200.01.00.0
PIELPEOG_210.01.00.0
PIELPEOG_220.01.00.0
PIELPEOG_230.01.00.0
PIELPEOG_240.01.00.0
PIELPEOG_250.01.00.0
PIELPEOG_261.00.01.0
PIELPEOG_270.01.00.0
PIELPEOG_280.01.00.0
PIELPEOG_291.00.01.0
PIELPEOG_300.01.00.0
PIELPEOG_310.01.00.0
PIELPEOG_320.01.00.0
PIELPEOG_330.01.00.0
PIELPEOG_340.01.00.0
PIELPEOG_351.00.01.0
PIELPEOG_361.00.01.0
PIELPEOG_370.01.00.0
PIELPEOG_380.01.00.0
PIELPEOG_390.01.00.0
PIELPEOG_400.01.00.0
PIELPEOG_411.00.01.0
PIELPEOG_420.01.00.0
PIELPEOG_430.01.00.0
PIELPEOG_440.01.00.0
PIELPEOG_450.01.00.0
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PIELPEOG_500.01.00.0
PIELPEOG_511.00.01.0
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PIELPEOG_561.00.01.0
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PIELPEOG_580.01.00.0
PIELPEOG_590.01.00.0
PIELPEOG_601.00.01.0
PIELPEOG_610.01.00.0
PIELPEOG_620.01.00.0
PIELPEOG_631.00.01.0
PIELPEOG_641.00.01.0
PIELPEOG_651.00.01.0
PIELPEOG_671.00.01.0
PIELPEOG_680.01.00.0
PIELPEOG_690.01.00.0
PIELPEOG_701.00.01.0
PIELPEOG_711.00.01.0
PIELPEOG_720.01.00.0
PIELPEOG_741.00.01.0
PIELPEOG_751.00.01.0
PIELPEOG_761.00.01.0
PIELPEOG_771.00.01.0
PIELPEOG_830.01.00.0
PIELPEOG_940.01.00.0
PIELPEOG_1050.01.00.0
PIELPEOG_1160.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
PIELPEOG_203253364371FalseSiphoviridaeVOG1309, VOG0186, VOG4855, VOG0226, VOG11003, VOG9860, VOG0536, VOG4567, VOG0198, VOG9153, VOG4570, VOG3699, VOG4544, VOG10227, VOG0691, VOG0692, VOG5616, VOG1183, VOG4555, VOG4711, VOG0695, VOG0696, VOG0697, VOG0698, VOG10044, VOG0701, VOG4545, VOG4605, VOG4605, VOG4599, VOG6455, VOG7896, VOG0861, VOG7017
PIELPEOG_1057065178887FalseSiphoviridaeVOG4609, VOG0205, VOG4841, VOG4581, VOG4544, VOG5051, VOG4556

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements