Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0000.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
No hit found

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
EBCNGLDI_10.01.00.0
EBCNGLDI_20.01.00.0
EBCNGLDI_30.01.00.0
EBCNGLDI_41.00.01.0
EBCNGLDI_50.01.00.0
EBCNGLDI_61.00.01.0
EBCNGLDI_71.00.01.0
EBCNGLDI_80.01.00.0
EBCNGLDI_91.00.01.0
EBCNGLDI_100.01.00.0
EBCNGLDI_110.01.00.0
EBCNGLDI_120.01.00.0
EBCNGLDI_130.01.00.0
EBCNGLDI_140.01.00.0
EBCNGLDI_150.01.00.0
EBCNGLDI_160.01.00.0
EBCNGLDI_171.00.01.0
EBCNGLDI_181.00.01.0
EBCNGLDI_191.00.01.0
EBCNGLDI_201.00.01.0
EBCNGLDI_211.00.01.0
EBCNGLDI_221.00.01.0
EBCNGLDI_230.01.00.0
EBCNGLDI_240.01.00.0
EBCNGLDI_250.01.00.0
EBCNGLDI_260.01.00.0
EBCNGLDI_270.01.00.0
EBCNGLDI_280.01.00.0
EBCNGLDI_290.01.00.0
EBCNGLDI_301.00.01.0
EBCNGLDI_310.01.00.0
EBCNGLDI_320.01.00.0
EBCNGLDI_330.01.00.0
EBCNGLDI_340.01.00.0
EBCNGLDI_350.01.00.0
EBCNGLDI_361.00.01.0
EBCNGLDI_370.01.00.0
EBCNGLDI_380.01.00.0
EBCNGLDI_391.00.01.0
EBCNGLDI_400.01.00.0
EBCNGLDI_410.01.00.0
EBCNGLDI_420.01.00.0
EBCNGLDI_431.00.01.0
EBCNGLDI_440.01.00.0
EBCNGLDI_450.01.00.0
EBCNGLDI_461.00.01.0
EBCNGLDI_470.01.00.0
EBCNGLDI_480.01.00.0
EBCNGLDI_490.01.00.0
EBCNGLDI_500.01.00.0
EBCNGLDI_511.00.01.0
EBCNGLDI_521.00.01.0
EBCNGLDI_530.01.00.0
EBCNGLDI_540.01.00.0
EBCNGLDI_561.00.01.0
EBCNGLDI_571.00.01.0
EBCNGLDI_580.01.00.0
EBCNGLDI_590.01.00.0
EBCNGLDI_601.00.01.0
EBCNGLDI_611.00.01.0
EBCNGLDI_621.00.01.0
EBCNGLDI_641.00.01.0
EBCNGLDI_651.00.01.0
EBCNGLDI_661.00.01.0
EBCNGLDI_670.01.00.0
EBCNGLDI_680.01.00.0
EBCNGLDI_690.01.00.0
EBCNGLDI_701.00.01.0
EBCNGLDI_710.01.00.0
EBCNGLDI_721.00.01.0
EBCNGLDI_730.01.00.0
EBCNGLDI_740.01.00.0
EBCNGLDI_750.01.00.0
EBCNGLDI_761.00.01.0
EBCNGLDI_770.01.00.0
EBCNGLDI_780.01.00.0
EBCNGLDI_790.01.00.0
EBCNGLDI_801.00.01.0
EBCNGLDI_811.00.01.0
EBCNGLDI_821.00.01.0
EBCNGLDI_830.01.00.0
EBCNGLDI_841.00.01.0
EBCNGLDI_850.01.00.0
EBCNGLDI_861.00.01.0
EBCNGLDI_871.00.01.0
EBCNGLDI_890.01.00.0
EBCNGLDI_900.01.00.0
EBCNGLDI_911.00.01.0
EBCNGLDI_921.00.01.0
EBCNGLDI_931.00.01.0
EBCNGLDI_940.01.00.0
EBCNGLDI_951.00.01.0
EBCNGLDI_960.01.00.0
EBCNGLDI_971.00.01.0
EBCNGLDI_981.00.01.0
EBCNGLDI_991.00.01.0
EBCNGLDI_1001.00.01.0
EBCNGLDI_1010.01.00.0
EBCNGLDI_1021.00.01.0
EBCNGLDI_1030.01.00.0
EBCNGLDI_1041.00.01.0
EBCNGLDI_1050.01.00.0
EBCNGLDI_1061.00.01.0
EBCNGLDI_1070.01.00.0
EBCNGLDI_1081.00.01.0
EBCNGLDI_1090.01.00.0
EBCNGLDI_1101.00.01.0
EBCNGLDI_1110.01.00.0
EBCNGLDI_1120.01.00.0
EBCNGLDI_1130.01.00.0
EBCNGLDI_1141.00.01.0
EBCNGLDI_1161.00.01.0
EBCNGLDI_1170.01.00.0
EBCNGLDI_1180.01.00.0
EBCNGLDI_1191.00.01.0
EBCNGLDI_1201.00.01.0
EBCNGLDI_1210.01.00.0
EBCNGLDI_1220.01.00.0
EBCNGLDI_1231.00.01.0
EBCNGLDI_1241.00.01.0
EBCNGLDI_1250.01.00.0
EBCNGLDI_1261.00.01.0
EBCNGLDI_1270.01.00.0
EBCNGLDI_1281.00.01.0
EBCNGLDI_1291.00.01.0
EBCNGLDI_1350.01.00.0
EBCNGLDI_1460.01.00.0
EBCNGLDI_1570.01.00.0
EBCNGLDI_1680.01.00.0
EBCNGLDI_1791.00.01.0
EBCNGLDI_1840.01.00.0
EBCNGLDI_1850.01.00.0
EBCNGLDI_1861.00.01.0
EBCNGLDI_1870.01.00.0
EBCNGLDI_1880.01.00.0
EBCNGLDI_1890.01.00.0
EBCNGLDI_1900.01.00.0
EBCNGLDI_1910.01.00.0
EBCNGLDI_1920.01.00.0
EBCNGLDI_1930.01.00.0
EBCNGLDI_1940.01.00.0
EBCNGLDI_1950.01.00.0
EBCNGLDI_1960.01.00.0
EBCNGLDI_1970.01.00.0
EBCNGLDI_1980.01.00.0
EBCNGLDI_1990.01.00.0
EBCNGLDI_2001.00.01.0
EBCNGLDI_2010.01.00.0
EBCNGLDI_2020.01.00.0
EBCNGLDI_2030.01.00.0
EBCNGLDI_2040.01.00.0
EBCNGLDI_2050.01.00.0
EBCNGLDI_2061.00.01.0
EBCNGLDI_2071.00.01.0
EBCNGLDI_2080.01.00.0
EBCNGLDI_2090.01.00.0
EBCNGLDI_2100.01.00.0
EBCNGLDI_2110.01.00.0
EBCNGLDI_2121.00.01.0
EBCNGLDI_2130.01.00.0
EBCNGLDI_2140.01.00.0
EBCNGLDI_2150.01.00.0
EBCNGLDI_2160.01.00.0
EBCNGLDI_2170.01.00.0
EBCNGLDI_2181.00.01.0
EBCNGLDI_2190.01.00.0
EBCNGLDI_2200.01.00.0
EBCNGLDI_2210.01.00.0
EBCNGLDI_2220.01.00.0
EBCNGLDI_2231.00.01.0
EBCNGLDI_2240.01.00.0
EBCNGLDI_2250.01.00.0
EBCNGLDI_2260.01.00.0
EBCNGLDI_2270.01.00.0
EBCNGLDI_2280.01.00.0
EBCNGLDI_2290.01.00.0
EBCNGLDI_2301.00.01.0
EBCNGLDI_2310.01.00.0
EBCNGLDI_2321.00.01.0
EBCNGLDI_2330.01.00.0
EBCNGLDI_2340.01.00.0
EBCNGLDI_2350.01.00.0
EBCNGLDI_2360.01.00.0
EBCNGLDI_2370.01.00.0
EBCNGLDI_2380.01.00.0
EBCNGLDI_2390.01.00.0
EBCNGLDI_2400.01.00.0
EBCNGLDI_2411.00.01.0
EBCNGLDI_2421.00.01.0
EBCNGLDI_2430.01.00.0
EBCNGLDI_2440.01.00.0
EBCNGLDI_2450.01.00.0
EBCNGLDI_2460.01.00.0
EBCNGLDI_2470.01.00.0
EBCNGLDI_2480.01.00.0
EBCNGLDI_2500.01.00.0
EBCNGLDI_2511.00.01.0
EBCNGLDI_2520.01.00.0
EBCNGLDI_2530.01.00.0
EBCNGLDI_2540.01.00.0
EBCNGLDI_2551.00.01.0
EBCNGLDI_2560.01.00.0
EBCNGLDI_2570.01.00.0
EBCNGLDI_2580.01.00.0
EBCNGLDI_2590.01.00.0
EBCNGLDI_2600.01.00.0
EBCNGLDI_2611.00.01.0
EBCNGLDI_2620.01.00.0
EBCNGLDI_2630.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
EBCNGLDI_11272614104365FalseMyoviridaeVOG4693, VOG0198, VOG4455, VOG0376, VOG2545, VOG0796, VOG7407, VOG1912, VOG5027, VOG4918, VOG1915, VOG1942, VOG4778, VOG1353, VOG1881, VOG1883, VOG1352, VOG4699, VOG6163, VOG1956, VOG1433, VOG1348, VOG0573, VOG4550, VOG4691, VOG4845, VOG5334
EBCNGLDI_1873039456111FalseSiphoviridaeVOG6675, VOG0327, VOG8222, VOG0198, VOG4841, VOG4581, VOG1886, VOG0202, VOG4556, VOG4573, VOG4553, VOG0204, VOG0205, VOG0207, VOG4586, VOG0209, VOG4545, VOG4633, VOG4659, VOG7017, VOG6540
EBCNGLDI_2421874241001FalseMyoviridaeVOG8232, VOG0198, VOG0686, VOG0796, VOG7407, VOG1912, VOG5027, VOG4865, VOG1915, VOG6932, VOG1942, VOG4778, VOG1353, VOG1881, VOG1883, VOG1352, VOG4699, VOG6307

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements