Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0011.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
MAAIOLEL_112427524469CspA7.15e-29cold shock protein84.6198.48CAA62903

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
MAAIOLEL_10.01.00.0
MAAIOLEL_20.01.00.0
MAAIOLEL_30.01.00.0
MAAIOLEL_40.01.00.0
MAAIOLEL_50.01.00.0
MAAIOLEL_60.01.00.0
MAAIOLEL_70.01.00.0
MAAIOLEL_80.01.00.0
MAAIOLEL_90.01.00.0
MAAIOLEL_100.01.00.0
MAAIOLEL_110.01.00.0
MAAIOLEL_120.01.00.0
MAAIOLEL_130.01.00.0
MAAIOLEL_140.01.00.0
MAAIOLEL_150.01.00.0
MAAIOLEL_160.01.00.0
MAAIOLEL_170.01.00.0
MAAIOLEL_180.01.00.0
MAAIOLEL_190.01.00.0
MAAIOLEL_200.01.00.0
MAAIOLEL_210.01.00.0
MAAIOLEL_220.01.00.0
MAAIOLEL_230.01.00.0
MAAIOLEL_240.01.00.0
MAAIOLEL_250.01.00.0
MAAIOLEL_260.01.00.0
MAAIOLEL_270.01.00.0
MAAIOLEL_280.01.00.0
MAAIOLEL_290.01.00.0
MAAIOLEL_300.01.00.0
MAAIOLEL_310.01.00.0
MAAIOLEL_320.01.00.0
MAAIOLEL_330.01.00.0
MAAIOLEL_340.01.00.0
MAAIOLEL_350.01.00.0
MAAIOLEL_361.00.01.0
MAAIOLEL_371.00.01.0
MAAIOLEL_381.00.01.0
MAAIOLEL_390.01.00.0
MAAIOLEL_400.01.00.0
MAAIOLEL_410.01.00.0
MAAIOLEL_420.01.00.0
MAAIOLEL_431.00.01.0
MAAIOLEL_440.01.00.0
MAAIOLEL_450.01.00.0
MAAIOLEL_460.01.00.0
MAAIOLEL_470.01.00.0
MAAIOLEL_480.01.00.0
MAAIOLEL_490.01.00.0
MAAIOLEL_500.01.00.0
MAAIOLEL_510.01.00.0
MAAIOLEL_520.01.00.0
MAAIOLEL_530.01.00.0
MAAIOLEL_540.01.00.0
MAAIOLEL_550.01.00.0
MAAIOLEL_561.00.01.0
MAAIOLEL_571.00.01.0
MAAIOLEL_580.01.00.0
MAAIOLEL_591.00.01.0
MAAIOLEL_600.01.00.0
MAAIOLEL_611.00.01.0
MAAIOLEL_620.01.00.0
MAAIOLEL_630.01.00.0
MAAIOLEL_640.01.00.0
MAAIOLEL_650.01.00.0
MAAIOLEL_660.01.00.0
MAAIOLEL_670.01.00.0
MAAIOLEL_681.00.01.0
MAAIOLEL_690.01.00.0
MAAIOLEL_701.00.01.0
MAAIOLEL_711.00.01.0
MAAIOLEL_720.01.00.0
MAAIOLEL_731.00.01.0
MAAIOLEL_761.00.01.0
MAAIOLEL_770.01.00.0
MAAIOLEL_781.00.01.0
MAAIOLEL_791.00.01.0
MAAIOLEL_801.00.01.0
MAAIOLEL_820.01.00.0
MAAIOLEL_831.00.01.0
MAAIOLEL_840.01.00.0
MAAIOLEL_850.01.00.0
MAAIOLEL_861.00.01.0
MAAIOLEL_870.01.00.0
MAAIOLEL_881.00.01.0
MAAIOLEL_891.00.01.0
MAAIOLEL_910.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
MAAIOLEL_91575743688TrueSiphoviridaeVOG0052, VOG7438, VOG1047, VOG0021, VOG0026, VOG4606, VOG0327, VOG4548, VOG0198, VOG4581, VOG4571, VOG4544, VOG4556, VOG4573, VOG4553, VOG0204, VOG4589, VOG0641, VOG9502, VOG0221, VOG0221, VOG6703

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements