Probiotic potential risk score
| ARGs | VFs | PGs | PPRS |
|---|---|---|---|
| 0 | 0 | 2 | 2.00 |
PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).
Antibiotic resistance genes
Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)
| Query ID | Begin | End | ARO name | ARO accession | CARD name | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)
ResFinder
| Query ID | Begin | End | Resistance gene | Phenotype | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | |||||||
ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)
AMRFinderPlus
| Query ID | Begin | End | Gene symbol | Sequence name | Method | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)
Virulence factors
Virulence Factor Database (VFDB)
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | VF name | VF category | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | |||||||||
BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)
VirulenceFinder
| Query ID | Begin | End | Database | Virulence factor | Protein function | Identity | Coverage | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||||
VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)
Pathogenic genes
PHI-base
| Query ID | qstart | qend | Gene name | e-value | Function | Identity | Coverage | Gene ID |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| EENILCLG_21 | 20248 | 19541 | WalR | 1.32e-116 | transcriptional regulatory protein | 85.59 | 100.43 | EPH95667 |
| EENILCLG_28 | 20575 | 20772 | CspR | 3.94e-29 | cold shock protein | 81.82 | 100.00 | AAO82613 |
| EENILCLG_28 | 20575 | 20769 | CspA | 1.92e-28 | cold shock protein | 81.54 | 98.48 | CAA62903 |
BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)
Plasmid
PlasmidFinder
| Query ID | Begin | End | Plasmid | Query / Template | Identity | Accession no. |
|---|---|---|---|---|---|---|
| No hit found | ||||||
PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)
PlasmidHunter
| Query ID | Prediction | Chromosome | Plasmid |
|---|---|---|---|
| EENILCLG_1 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_2 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_3 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_4 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_5 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_6 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_7 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_8 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_9 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| EENILCLG_10 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_11 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| EENILCLG_12 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_13 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_14 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| EENILCLG_15 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_16 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_17 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_18 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_19 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_20 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_21 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_22 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_23 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_24 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_25 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_26 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_27 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_28 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_29 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| EENILCLG_30 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| EENILCLG_31 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_32 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_33 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| EENILCLG_34 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| EENILCLG_35 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_36 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_37 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_38 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| EENILCLG_39 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_40 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_41 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_42 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_43 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_44 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_45 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_46 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| EENILCLG_47 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_48 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_49 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_50 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_51 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_52 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_53 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_54 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_55 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_56 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_57 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| EENILCLG_59 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| EENILCLG_60 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_61 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_62 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_63 | 0.0 | 1.0 | 0.0 |
| EENILCLG_65 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
| EENILCLG_66 | 1.0 | 0.0 | 1.0 |
PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)
Prophage
Phigaro
| Query ID | Begin | End | Transposable | Taxonomy | pVOGs |
|---|---|---|---|---|---|
| EENILCLG_3 | 67882 | 91161 | False | Siphoviridae | VOG0198, VOG8681, VOG0638, VOG4841, VOG4581, VOG1886, VOG0202, VOG4556, VOG4573, VOG4553, VOG0204, VOG0205, VOG9583, VOG0207, VOG4586, VOG9258, VOG0801, VOG3462, VOG7521, VOG4856, VOG10868 |
| EENILCLG_4 | 26454 | 36792 | False | Unknown | VOG4548, VOG5014, VOG0327, VOG0322, VOG6545, VOG4577, VOG4606, VOG3468, VOG0221, VOG4967 |
| EENILCLG_4 | 43721 | 64801 | False | Siphoviridae | VOG5448, VOG7894, VOG4841, VOG4581, VOG1886, VOG4556, VOG4573, VOG4553, VOG0204, VOG4589, VOG0539, VOG0704, VOG4586, VOG5852, VOG6163, VOG0801, VOG3462, VOG4190, VOG0083, VOG8438 |
Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)