Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0011.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
IAACJOJL_5370277728WalR2.52e-109transcriptional regulatory protein80.3499.57EPH95667

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
No hit found

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
IAACJOJL_10.01.00.0
IAACJOJL_120.01.00.0
IAACJOJL_230.01.00.0
IAACJOJL_250.01.00.0
IAACJOJL_260.01.00.0
IAACJOJL_270.01.00.0
IAACJOJL_280.01.00.0
IAACJOJL_290.01.00.0
IAACJOJL_300.01.00.0
IAACJOJL_310.01.00.0
IAACJOJL_320.01.00.0
IAACJOJL_330.01.00.0
IAACJOJL_340.01.00.0
IAACJOJL_351.00.01.0
IAACJOJL_360.01.00.0
IAACJOJL_371.00.01.0
IAACJOJL_380.01.00.0
IAACJOJL_391.00.01.0
IAACJOJL_400.01.00.0
IAACJOJL_411.00.01.0
IAACJOJL_420.01.00.0
IAACJOJL_430.01.00.0
IAACJOJL_440.01.00.0
IAACJOJL_451.00.01.0
IAACJOJL_460.01.00.0
IAACJOJL_470.01.00.0
IAACJOJL_481.00.01.0
IAACJOJL_490.01.00.0
IAACJOJL_500.01.00.0
IAACJOJL_510.01.00.0
IAACJOJL_521.00.01.0
IAACJOJL_530.01.00.0
IAACJOJL_540.01.00.0
IAACJOJL_550.01.00.0
IAACJOJL_560.01.00.0
IAACJOJL_571.00.01.0
IAACJOJL_581.00.01.0
IAACJOJL_590.01.00.0
IAACJOJL_600.01.00.0
IAACJOJL_610.01.00.0
IAACJOJL_620.01.00.0
IAACJOJL_631.00.01.0
IAACJOJL_641.00.01.0
IAACJOJL_650.01.00.0
IAACJOJL_661.00.01.0
IAACJOJL_671.00.01.0
IAACJOJL_681.00.01.0
IAACJOJL_691.00.01.0
IAACJOJL_701.00.01.0
IAACJOJL_711.00.01.0
IAACJOJL_721.00.01.0
IAACJOJL_731.00.01.0
IAACJOJL_741.00.01.0
IAACJOJL_751.00.01.0
IAACJOJL_760.01.00.0
IAACJOJL_771.00.01.0
IAACJOJL_781.00.01.0
IAACJOJL_791.00.01.0
IAACJOJL_811.00.01.0
IAACJOJL_821.00.01.0
IAACJOJL_831.00.01.0
IAACJOJL_841.00.01.0
IAACJOJL_851.00.01.0
IAACJOJL_861.00.01.0
IAACJOJL_870.01.00.0
IAACJOJL_880.01.00.0
IAACJOJL_891.00.01.0
IAACJOJL_901.00.01.0
IAACJOJL_911.00.01.0
IAACJOJL_921.00.01.0
IAACJOJL_931.00.01.0
IAACJOJL_941.00.01.0
IAACJOJL_951.00.01.0
IAACJOJL_961.00.01.0
IAACJOJL_971.00.01.0
IAACJOJL_980.01.00.0
IAACJOJL_1001.00.01.0
IAACJOJL_1011.00.01.0
IAACJOJL_1021.00.01.0
IAACJOJL_1031.00.01.0
IAACJOJL_1041.00.01.0
IAACJOJL_1051.00.01.0
IAACJOJL_1061.00.01.0
IAACJOJL_1070.01.00.0
IAACJOJL_1081.00.01.0
IAACJOJL_1090.01.00.0
IAACJOJL_1101.00.01.0
IAACJOJL_1200.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
IAACJOJL_35844739507FalseSiphoviridaeVOG8647, VOG0189, VOG0822, VOG0044, VOG3580, VOG3643, VOG0149, VOG0198, VOG4214, VOG4841, VOG10904, VOG4581, VOG1886, VOG4556, VOG4573, VOG4553, VOG0204, VOG0205, VOG0207, VOG4586, VOG0209, VOG8263, VOG4605, VOG4599, VOG10972, VOG9955, VOG6000, VOG4705
IAACJOJL_38363316414FalseSiphoviridaeVOG0480, VOG8908, VOG0198, VOG0204, VOG4568, VOG4556, VOG5051, VOG4544, VOG4581, VOG4841, VOG0205, VOG4609
IAACJOJL_39114028415FalseMyoviridaeVOG5446, VOG0796, VOG0275, VOG4544, VOG0720, VOG4564, VOG4555, VOG3434, VOG1887, VOG4710, VOG1353, VOG1881, VOG1883, VOG1352, VOG4699, VOG5706, VOG4910, VOG1956, VOG1433, VOG1348, VOG0573, VOG4691, VOG4845, VOG0870, VOG10914, VOG3298, VOG3298, VOG8917
IAACJOJL_4026346978FalseUnknownVOG4693, VOG7236, VOG4566, VOG0186, VOG1309
IAACJOJL_41256224412FalseMyoviridaeVOG4845, VOG4691, VOG2349, VOG0573, VOG1348, VOG1433, VOG4865, VOG4699, VOG1352, VOG1883, VOG1353, VOG5795, VOG1329, VOG7118, VOG4564, VOG0720
IAACJOJL_45590620179FalseSiphoviridaeVOG0025, VOG4799, VOG0226, VOG0322, VOG0685, VOG6495, VOG0650, VOG3015, VOG4552, VOG1656, VOG8520, VOG0862, VOG8483, VOG0774, VOG0801

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements