Probiotic potential risk score


ARGs VFs PGs PPRS
0022.00

PPRS is classified as low-risk (≤4), medium-risk (4-6), and high-risk (≥6).

Antibiotic resistance genes


Comprehensive Antibiotic Resistance Database (CARD)

Query ID Begin End ARO name ARO accession CARD name Identity Coverage Accession no.
No hit found

RGI v6.0.3 (Database: CARD Variants v4.0.2, Nov. 2023 release)

ResFinder

Query ID Begin End Resistance gene Phenotype Identity Coverage Accession no.
No hit found

ResFinder v4.6.0 (Database: resfinder_db, Aug. 2024 release)

AMRFinderPlus

Query ID Begin End Gene symbol Sequence name Method Identity Coverage Accession no.
No hit found

AMRFinderPlus v4.0.3 (Database: Oct. 2024 release)

Virulence factors


Virulence Factor Database (VFDB)

Query ID qstart qend Gene name e-value VF name VF category Identity Coverage Accession no.
No hit found

BLASTN v2.16.0 (Database: VFDB, Dec. 2024 release)

VirulenceFinder

Query ID Begin End Database Virulence factor Protein function Identity Coverage Accession no.
No hit found

VirulenceFinder v2.0. 4 (Database: virulencefinder_db, Feb . 2024 release)

Pathogenic genes


PHI-base

Query ID qstart qend Gene name e-value Function Identity Coverage Gene ID
HNFEACIA_2991566862WalR1.10e-112transcriptional regulatory protein83.40100.00EPH95667
HNFEACIA_12297359538CspR5.95e-34cold shock protein87.88100.00AAO82613

BLASTX v2.16.0 (Database: PHI base v4.16, May. 2024 release)

Plasmid


PlasmidFinder

Query ID Begin End Plasmid Query / Template Identity Accession no.
HNFEACIA_742405925117repUS751059 / 1059100.00CP002393

PlasmidFinder v 2.1.6 (Database: plasmidfinder_db v 2.2.0 , Nov. 2024 release)

PlasmidHunter

Query ID Prediction Chromosome Plasmid
HNFEACIA_10.01.00.0
HNFEACIA_21.00.01.0
HNFEACIA_30.01.00.0
HNFEACIA_41.00.01.0
HNFEACIA_50.01.00.0
HNFEACIA_60.01.00.0
HNFEACIA_70.01.00.0
HNFEACIA_80.01.00.0
HNFEACIA_90.01.00.0
HNFEACIA_100.01.00.0
HNFEACIA_110.01.00.0
HNFEACIA_121.00.01.0
HNFEACIA_131.00.01.0
HNFEACIA_140.01.00.0
HNFEACIA_151.00.01.0
HNFEACIA_161.00.01.0
HNFEACIA_170.01.00.0
HNFEACIA_180.01.00.0
HNFEACIA_190.01.00.0
HNFEACIA_200.01.00.0
HNFEACIA_210.01.00.0
HNFEACIA_220.01.00.0
HNFEACIA_230.01.00.0
HNFEACIA_240.01.00.0
HNFEACIA_250.01.00.0
HNFEACIA_261.00.01.0
HNFEACIA_270.01.00.0
HNFEACIA_280.01.00.0
HNFEACIA_291.00.01.0
HNFEACIA_300.01.00.0
HNFEACIA_310.01.00.0
HNFEACIA_320.01.00.0
HNFEACIA_331.00.01.0
HNFEACIA_340.01.00.0
HNFEACIA_360.01.00.0
HNFEACIA_370.01.00.0
HNFEACIA_380.01.00.0
HNFEACIA_390.01.00.0
HNFEACIA_400.01.00.0
HNFEACIA_410.01.00.0
HNFEACIA_420.01.00.0
HNFEACIA_431.00.01.0
HNFEACIA_440.01.00.0
HNFEACIA_450.01.00.0
HNFEACIA_461.00.01.0
HNFEACIA_471.00.01.0
HNFEACIA_480.01.00.0
HNFEACIA_490.01.00.0
HNFEACIA_501.00.01.0
HNFEACIA_510.01.00.0
HNFEACIA_520.01.00.0
HNFEACIA_531.00.01.0
HNFEACIA_541.00.01.0
HNFEACIA_550.01.00.0
HNFEACIA_560.01.00.0
HNFEACIA_570.01.00.0
HNFEACIA_580.01.00.0
HNFEACIA_591.00.01.0
HNFEACIA_601.00.01.0
HNFEACIA_611.00.01.0
HNFEACIA_620.01.00.0
HNFEACIA_630.01.00.0
HNFEACIA_640.01.00.0
HNFEACIA_651.00.01.0
HNFEACIA_661.00.01.0
HNFEACIA_670.01.00.0
HNFEACIA_681.00.01.0
HNFEACIA_690.01.00.0
HNFEACIA_700.01.00.0
HNFEACIA_711.00.01.0
HNFEACIA_720.01.00.0
HNFEACIA_730.01.00.0
HNFEACIA_741.00.01.0
HNFEACIA_750.01.00.0
HNFEACIA_760.01.00.0
HNFEACIA_770.01.00.0
HNFEACIA_780.01.00.0
HNFEACIA_790.01.00.0
HNFEACIA_800.01.00.0
HNFEACIA_810.01.00.0
HNFEACIA_820.01.00.0
HNFEACIA_830.01.00.0
HNFEACIA_840.01.00.0
HNFEACIA_850.01.00.0
HNFEACIA_860.01.00.0
HNFEACIA_870.01.00.0
HNFEACIA_880.01.00.0
HNFEACIA_890.01.00.0
HNFEACIA_900.01.00.0
HNFEACIA_910.01.00.0
HNFEACIA_921.00.01.0
HNFEACIA_930.01.00.0
HNFEACIA_940.01.00.0
HNFEACIA_950.01.00.0
HNFEACIA_960.01.00.0
HNFEACIA_970.01.00.0
HNFEACIA_980.01.00.0
HNFEACIA_990.01.00.0
HNFEACIA_1000.01.00.0
HNFEACIA_1010.01.00.0
HNFEACIA_1020.01.00.0
HNFEACIA_1030.01.00.0
HNFEACIA_1040.01.00.0
HNFEACIA_1050.01.00.0
HNFEACIA_1060.01.00.0
HNFEACIA_1071.00.01.0
HNFEACIA_1080.01.00.0
HNFEACIA_1090.01.00.0
HNFEACIA_1100.01.00.0
HNFEACIA_1111.00.01.0
HNFEACIA_1120.01.00.0
HNFEACIA_1130.01.00.0
HNFEACIA_1140.01.00.0
HNFEACIA_1150.01.00.0
HNFEACIA_1160.01.00.0
HNFEACIA_1171.00.01.0
HNFEACIA_1180.01.00.0
HNFEACIA_1190.01.00.0
HNFEACIA_1200.01.00.0
HNFEACIA_1210.01.00.0
HNFEACIA_1220.01.00.0
HNFEACIA_1230.01.00.0
HNFEACIA_1240.01.00.0
HNFEACIA_1251.00.01.0
HNFEACIA_1260.01.00.0
HNFEACIA_1270.01.00.0
HNFEACIA_1280.01.00.0
HNFEACIA_1290.01.00.0
HNFEACIA_1300.01.00.0
HNFEACIA_1310.01.00.0
HNFEACIA_1320.01.00.0
HNFEACIA_1330.01.00.0
HNFEACIA_1340.01.00.0
HNFEACIA_1350.01.00.0
HNFEACIA_1360.01.00.0
HNFEACIA_1371.00.01.0
HNFEACIA_1380.01.00.0
HNFEACIA_1391.00.01.0
HNFEACIA_1400.01.00.0
HNFEACIA_1410.01.00.0
HNFEACIA_1421.00.01.0
HNFEACIA_1430.01.00.0
HNFEACIA_1440.01.00.0
HNFEACIA_1450.01.00.0
HNFEACIA_1461.00.01.0
HNFEACIA_1470.01.00.0
HNFEACIA_1480.01.00.0
HNFEACIA_1490.01.00.0
HNFEACIA_1500.01.00.0
HNFEACIA_1510.01.00.0
HNFEACIA_1520.01.00.0
HNFEACIA_1530.01.00.0
HNFEACIA_1540.01.00.0
HNFEACIA_1550.01.00.0
HNFEACIA_1560.01.00.0
HNFEACIA_1570.01.00.0
HNFEACIA_1580.01.00.0
HNFEACIA_1590.01.00.0
HNFEACIA_1600.01.00.0
HNFEACIA_1610.01.00.0
HNFEACIA_1620.01.00.0
HNFEACIA_1630.01.00.0
HNFEACIA_1640.01.00.0
HNFEACIA_1650.01.00.0
HNFEACIA_1660.01.00.0
HNFEACIA_1681.00.01.0
HNFEACIA_1690.01.00.0
HNFEACIA_1700.01.00.0
HNFEACIA_1710.01.00.0
HNFEACIA_1721.00.01.0
HNFEACIA_1730.01.00.0
HNFEACIA_1740.01.00.0
HNFEACIA_1750.01.00.0
HNFEACIA_1761.00.01.0
HNFEACIA_1770.01.00.0
HNFEACIA_1780.01.00.0
HNFEACIA_1790.01.00.0
HNFEACIA_1800.01.00.0
HNFEACIA_1810.01.00.0
HNFEACIA_1820.01.00.0
HNFEACIA_1830.01.00.0
HNFEACIA_1840.01.00.0
HNFEACIA_1850.01.00.0
HNFEACIA_1860.01.00.0
HNFEACIA_1870.01.00.0
HNFEACIA_1880.01.00.0
HNFEACIA_1890.01.00.0
HNFEACIA_1900.01.00.0
HNFEACIA_1910.01.00.0
HNFEACIA_1920.01.00.0
HNFEACIA_1930.01.00.0
HNFEACIA_1940.01.00.0
HNFEACIA_1950.01.00.0
HNFEACIA_1961.00.01.0
HNFEACIA_1970.01.00.0
HNFEACIA_1981.00.01.0
HNFEACIA_1990.01.00.0
HNFEACIA_2000.01.00.0
HNFEACIA_2010.01.00.0
HNFEACIA_2020.01.00.0
HNFEACIA_2030.01.00.0
HNFEACIA_2040.01.00.0
HNFEACIA_2050.01.00.0
HNFEACIA_2060.01.00.0
HNFEACIA_2070.01.00.0
HNFEACIA_2080.01.00.0
HNFEACIA_2090.01.00.0
HNFEACIA_2100.01.00.0
HNFEACIA_2110.01.00.0
HNFEACIA_2120.01.00.0
HNFEACIA_2130.01.00.0
HNFEACIA_2140.01.00.0
HNFEACIA_2150.01.00.0
HNFEACIA_2160.01.00.0
HNFEACIA_2170.01.00.0
HNFEACIA_2180.01.00.0
HNFEACIA_2190.01.00.0
HNFEACIA_2200.01.00.0
HNFEACIA_2210.01.00.0
HNFEACIA_2220.01.00.0
HNFEACIA_2230.01.00.0
HNFEACIA_2240.01.00.0
HNFEACIA_2250.01.00.0
HNFEACIA_2260.01.00.0
HNFEACIA_2270.01.00.0
HNFEACIA_2280.01.00.0
HNFEACIA_2290.01.00.0
HNFEACIA_2300.01.00.0
HNFEACIA_2310.01.00.0
HNFEACIA_2321.00.01.0
HNFEACIA_2330.01.00.0
HNFEACIA_2340.01.00.0
HNFEACIA_2351.00.01.0
HNFEACIA_2360.01.00.0
HNFEACIA_2370.01.00.0
HNFEACIA_2380.01.00.0
HNFEACIA_2390.01.00.0
HNFEACIA_2400.01.00.0
HNFEACIA_2410.01.00.0
HNFEACIA_2420.01.00.0
HNFEACIA_2431.00.01.0
HNFEACIA_2440.01.00.0
HNFEACIA_2451.00.01.0
HNFEACIA_2461.00.01.0
HNFEACIA_2471.00.01.0
HNFEACIA_2481.00.01.0
HNFEACIA_2490.01.00.0
HNFEACIA_2500.01.00.0
HNFEACIA_2510.01.00.0
HNFEACIA_2520.01.00.0
HNFEACIA_2530.01.00.0
HNFEACIA_2540.01.00.0
HNFEACIA_2550.01.00.0
HNFEACIA_2560.01.00.0
HNFEACIA_2570.01.00.0
HNFEACIA_2580.01.00.0
HNFEACIA_2590.01.00.0
HNFEACIA_2600.01.00.0
HNFEACIA_2610.01.00.0
HNFEACIA_2620.01.00.0
HNFEACIA_2630.01.00.0
HNFEACIA_2640.01.00.0
HNFEACIA_2650.01.00.0
HNFEACIA_2660.01.00.0
HNFEACIA_2670.01.00.0
HNFEACIA_2680.01.00.0
HNFEACIA_2690.01.00.0
HNFEACIA_2700.01.00.0
HNFEACIA_2710.01.00.0
HNFEACIA_2720.01.00.0
HNFEACIA_2730.01.00.0
HNFEACIA_2740.01.00.0
HNFEACIA_2750.01.00.0
HNFEACIA_2760.01.00.0
HNFEACIA_2770.01.00.0
HNFEACIA_2780.01.00.0
HNFEACIA_2790.01.00.0
HNFEACIA_2800.01.00.0
HNFEACIA_2810.01.00.0
HNFEACIA_2820.01.00.0
HNFEACIA_2830.01.00.0
HNFEACIA_2841.00.01.0
HNFEACIA_2850.01.00.0
HNFEACIA_2860.01.00.0
HNFEACIA_2870.01.00.0
HNFEACIA_2880.01.00.0
HNFEACIA_2890.01.00.0
HNFEACIA_2900.01.00.0
HNFEACIA_2910.01.00.0
HNFEACIA_2920.01.00.0
HNFEACIA_2930.01.00.0
HNFEACIA_2940.01.00.0
HNFEACIA_2950.01.00.0
HNFEACIA_2960.01.00.0
HNFEACIA_2970.01.00.0
HNFEACIA_2980.01.00.0
HNFEACIA_2990.01.00.0
HNFEACIA_3001.00.01.0
HNFEACIA_3010.01.00.0
HNFEACIA_3020.01.00.0
HNFEACIA_3030.01.00.0
HNFEACIA_3040.01.00.0
HNFEACIA_3050.01.00.0
HNFEACIA_3060.01.00.0
HNFEACIA_3070.01.00.0
HNFEACIA_3080.01.00.0
HNFEACIA_3090.01.00.0
HNFEACIA_3100.01.00.0
HNFEACIA_3110.01.00.0
HNFEACIA_3121.00.01.0
HNFEACIA_3130.01.00.0
HNFEACIA_3140.01.00.0
HNFEACIA_3150.01.00.0
HNFEACIA_3160.01.00.0
HNFEACIA_3170.01.00.0
HNFEACIA_3180.01.00.0
HNFEACIA_3190.01.00.0
HNFEACIA_3200.01.00.0
HNFEACIA_3220.01.00.0

PlasmidHunter v 1.4.5 (Database: May. 2024 release)

Prophage


Phigaro

Query ID Begin End Transposable Taxonomy pVOGs
HNFEACIA_781446455161FalseSiphoviridaeVOG8303, VOG4918, VOG0054, VOG1637, VOG7896, VOG4599, VOG4605, VOG6163, VOG2225, VOG4586, VOG0704, VOG0539, VOG4589, VOG0204, VOG5601, VOG4553, VOG4568, VOG4556, VOG3644, VOG4544, VOG4581, VOG4841, VOG1345, VOG10904, VOG4570, VOG0198, VOG9281, VOG3643, VOG0152, VOG9741, VOG4693, VOG6623, VOG9860, VOG9667, VOG11003, VOG0226, VOG4566, VOG0186, VOG1309, VOG0181, VOG5423, VOG4552, VOG4995, VOG2215

Phigaro v2.4.0 (Database: Jan. 2024 release)


Insertion sequence (IS) elements